177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4410 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4410  hypothetical protein  100 
 
 		 209 aa  424  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5933  hypothetical protein  45.08 
 
 		 209 aa  175  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4263  flavin reductase domain-containing protein  43.37 
 
 		 210 aa  164  6.9999999999999995e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644656 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5120  putative flavin reductase  37.04 
 
 		 203 aa  137  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0364817  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0945  hypothetical protein  39.5 
 
 		 210 aa  136  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5005  flavin reductase  37.57 
 
 		 203 aa  135  4e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000501887  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5444  hypothetical protein  37.04 
 
 		 203 aa  135  4e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0011476  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5507  hypothetical protein  36.51 
 
 		 203 aa  135  4e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000065263  unclonable  4.40126e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5447  hypothetical protein  37.04 
 
 		 203 aa  134  8e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000739812  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5021  flavin reductase  37.04 
 
 		 203 aa  134  8e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000378469  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1051  flavin reductase-like, FMN-binding  37.04 
 
 		 213 aa  133  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0886076 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5906  hypothetical protein  35.03 
 
 		 195 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5253  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.75 
 
 		 196 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.504075 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5500  hypothetical protein  36.51 
 
 		 203 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000371904  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1365  hypothetical protein  35.23 
 
 		 196 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.300021  normal  0.0686539 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5171  hypothetical protein  36.51 
 
 		 203 aa  132  5e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000552892  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5565  hypothetical protein  36.51 
 
 		 203 aa  132  5e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000029994  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0762  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.13 
 
 		 203 aa  132  5e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5413  hypothetical protein  36.51 
 
 		 203 aa  131  6e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.81917e-62 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0364  nitrilotriacetate monooxygenase component B  34.52 
 
 		 205 aa  131  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3843  hypothetical protein  36.51 
 
 		 203 aa  131  7.999999999999999e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000198663  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2683  hypothetical protein  35.71 
 
 		 203 aa  128  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2740  hypothetical protein  35.71 
 
 		 203 aa  128  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0602  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  37.69 
 
 		 217 aa  127  9.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.413112 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4644  hypothetical protein  37 
 
 		 231 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0889  hypothetical protein  35.98 
 
 		 200 aa  125  3e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.581973  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0090  flavin reductase domain-containing protein  36.27 
 
 		 210 aa  125  4.0000000000000003e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00316855 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1479  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.61 
 
 		 206 aa  123  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1916  hypothetical protein  33.68 
 
 		 203 aa  122  5e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2914  hypothetical protein  36.9 
 
 		 203 aa  120  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5124  flavin reductase-like, FMN-binding  35.96 
 
 		 216 aa  118  4.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.178532 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2631  hypothetical protein  39.64 
 
 		 221 aa  118  6e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.300035  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2452  hypothetical protein  33.33 
 
 		 201 aa  118  7e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.108576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7599  hypothetical protein  33.33 
 
 		 220 aa  116  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5370  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.71 
 
 		 223 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.480853 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2815  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  37.11 
 
 		 219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112665  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2444  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  33.89 
 
 		 199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5134  hypothetical protein  31.82 
 
 		 220 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5786  hypothetical protein  34.02 
 
 		 208 aa  112  6e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.756136  hitchhiker  0.00296108 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3276  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.03 
 
 		 295 aa  111  7.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1359  hypothetical protein  34.2 
 
 		 208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3627  hypothetical protein  32.8 
 
 		 202 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.174937  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43240  hypothetical protein  33.51 
 
 		 202 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.531737 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6314  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  37.22 
 
 		 294 aa  108  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2366  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  32.79 
 
 		 203 aa  107  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.460598  normal  0.14144 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3148  flavin reductase-like, FMN-binding  31.12 
 
 		 219 aa  107  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2654  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.32 
 
 		 203 aa  106  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3293  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  32.65 
 
 		 216 aa  106  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.902968  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5247  hypothetical protein  33.17 
 
 		 216 aa  106  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.59199 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2487  hypothetical protein  33.33 
 
 		 203 aa  106  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.0244852 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2070  hypothetical protein  37.63 
 
 		 202 aa  105  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.224794 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2435  hypothetical protein  32.04 
 
 		 211 aa  105  7e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3465  hypothetical protein  37.11 
 
 		 202 aa  104  7e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3110  hypothetical protein  37.11 
 
 		 202 aa  104  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0966495  normal  0.11855 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1215  hypothetical protein  34.68 
 
 		 208 aa  104  9e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2915  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.82 
 
 		 203 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1242  hypothetical protein  34.68 
 
 		 208 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0081  hypothetical protein  35.8 
 
 		 209 aa  104  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3064  hypothetical protein  31.05 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.883432  normal  0.0355565 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4219  hypothetical protein  31.61 
 
 		 205 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.269485 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0405  hypothetical protein  34.87 
 
 		 207 aa  102  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4071  hypothetical protein  33.16 
 
 		 205 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.261199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02220  hypothetical protein  34.12 
 
 		 208 aa  102  4e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.686893  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1133  hypothetical protein  34.68 
 
 		 208 aa  102  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.311037 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1039  hypothetical protein  31.47 
 
 		 201 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.708626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1593  hypothetical protein  34.66 
 
 		 291 aa  102  5e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1899  hypothetical protein  36.9 
 
 		 202 aa  102  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.843142  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0863  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.24 
 
 		 209 aa  102  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0075  hypothetical protein  33.7 
 
 		 196 aa  101  6e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000447764  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1122  hypothetical protein  34.68 
 
 		 221 aa  101  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4899  hypothetical protein  32.31 
 
 		 205 aa  101  8e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0761  hypothetical protein  34.94 
 
 		 208 aa  101  9e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0500  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.23 
 
 		 294 aa  100  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4462  hypothetical protein  33.33 
 
 		 209 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70984  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1051  hypothetical protein  34.09 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.106662  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2682  hypothetical protein  31.41 
 
 		 205 aa  99.4  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4298  hypothetical protein  32.09 
 
 		 207 aa  99  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6039  hypothetical protein  34.38 
 
 		 206 aa  99  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.8711  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1786  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  32.32 
 
 		 228 aa  99  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.60124  normal  0.96149 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01680  hypothetical protein  34.46 
 
 		 292 aa  98.6  6e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4002  hypothetical protein  32.09 
 
 		 207 aa  98.2  7e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.548606  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4414  hypothetical protein  31.77 
 
 		 201 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2164  hypothetical protein  30.69 
 
 		 200 aa  96.7  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.341865  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6898  hypothetical protein  29.59 
 
 		 203 aa  95.9  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800563  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2943  hypothetical protein  30.1 
 
 		 216 aa  95.9  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0832  hypothetical protein  33.71 
 
 		 206 aa  95.9  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.158602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04002  nitrilotriacetate monooxygenase component B  32.97 
 
 		 209 aa  95.9  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2405  hypothetical protein  29.9 
 
 		 203 aa  94.7  8e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.139855  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1398  hypothetical protein  30.46 
 
 		 201 aa  94.7  9e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.709674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4325  hypothetical protein  30.46 
 
 		 201 aa  94.7  9e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0412  hypothetical protein  30.05 
 
 		 206 aa  94.7  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.567346  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2920  hypothetical protein  31.19 
 
 		 202 aa  94.4  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1083  hypothetical protein  28.34 
 
 		 204 aa  94.4  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.2808  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1646  hypothetical protein  32.26 
 
 		 212 aa  93.2  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0627  flavin reductase domain-containing protein  30.68 
 
 		 194 aa  92  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2217  hypothetical protein  29.53 
 
 		 207 aa  92  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0565603 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02124  hypothetical protein  33.75 
 
 		 169 aa  91.7  7e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4267  hypothetical protein  31.05 
 
 		 221 aa  91.7  8e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308533  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07162  conserved hypothetical protein  31.46 
 
 		 241 aa  90.5  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.574629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2319  hypothetical protein  27.68 
 
 		 201 aa  90.5  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>