More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2367 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_2367  hypothetical protein  100 
 
 
289 aa  544  1e-154  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00313159  normal  0.594079 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2634  cation ABC transporter, permease protein  96.89 
 
 
289 aa  504  1e-142  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.059277  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1311  ABC-3 protein  76.12 
 
 
290 aa  380  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0179  ABC-3 protein  74.31 
 
 
290 aa  379  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.958095 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0677  ABC-3 protein  71.53 
 
 
290 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.697838  normal  0.0650939 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1063  ABC transporter membrane spanning protein  68.75 
 
 
290 aa  364  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21744  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0622  ABC-3 protein  70.83 
 
 
290 aa  362  3e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.285827  normal  0.675779 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0927  ABC-3 protein  59.38 
 
 
290 aa  335  6e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.426068  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2228  ABC-3 protein  65.73 
 
 
289 aa  332  3e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2783  ABC-3 protein  64.08 
 
 
291 aa  332  5e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.314797  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4558  hypothetical protein  58.68 
 
 
290 aa  328  5e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3130  ABC-3 protein  62.37 
 
 
291 aa  323  1e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.362621  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1340  ABC transporter permease  59.72 
 
 
290 aa  323  2e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.562769 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0915  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems permease components  60.63 
 
 
289 aa  321  7e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.891696  normal  0.706737 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3427  hypothetical protein  59.23 
 
 
289 aa  321  7e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0704  ABC-3 protein  59.44 
 
 
286 aa  316  3e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.462722  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4708  ABC-3 protein  58.33 
 
 
290 aa  314  1e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.13978 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4829  hypothetical protein  58.89 
 
 
291 aa  313  2e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0844  hypothetical protein  57.99 
 
 
290 aa  311  7e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0721518 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0221  hypothetical protein  62.22 
 
 
300 aa  310  1e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.860948  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0978  ABC-3 protein  62.5 
 
 
295 aa  307  1e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3680  ABC-3 protein  59.57 
 
 
284 aa  305  4e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3531  ABC-3 protein  59.57 
 
 
284 aa  301  6e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1175  ABC-3 protein  61.54 
 
 
295 aa  301  8e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3703  ABC-3 transporter component  63.36 
 
 
290 aa  301  1e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.406266  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0654  ABC-3 protein  59.21 
 
 
284 aa  301  1e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1047  ABC-3 protein  61.54 
 
 
295 aa  300  2e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0160155 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2052  hypothetical protein  55.36 
 
 
299 aa  296  3e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.146645  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1122  ABC-3 protein  63.18 
 
 
285 aa  292  5e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  9.76582e-05  unclonable  1.10767e-08 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1143  ABC-3 protein  54.58 
 
 
294 aa  291  9e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2471  ABC-3 protein  55.94 
 
 
296 aa  287  1e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1596  ABC-3 protein  57.14 
 
 
288 aa  286  3e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0434418 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1973  ABC transporter, membrane protein  54.09 
 
 
293 aa  281  9e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3499  ABC-3 protein  56.69 
 
 
288 aa  276  2e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5583  ABC-3 protein  59.86 
 
 
288 aa  271  7e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0895448  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5388  ABC-3 protein  61.07 
 
 
288 aa  269  4e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.375408  normal  0.0641109 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3177  ABC-3 protein  56.29 
 
 
287 aa  266  3e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3391  ABC-3 protein  58.09 
 
 
304 aa  263  3e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0468601  normal  0.064332 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0351  ABC transporter, permease protein  48.94 
 
 
290 aa  249  5e-65  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0105  cation ABC transporter, permease protein  50.54 
 
 
284 aa  244  9e-64  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.536532  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5660  hypothetical protein  51.25 
 
 
288 aa  243  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.721685  normal  0.0964649 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3561  ABC-3 protein  59.12 
 
 
295 aa  213  4e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.232243 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  37.83 
 
 
278 aa  173  3e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  37.83 
 
 
278 aa  173  3e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  32.29 
 
 
279 aa  166  5e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  34.53 
 
 
280 aa  163  2e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  31.97 
 
 
277 aa  160  3e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0291  ABC transporter, permease protein  34.83 
 
 
278 aa  146  4e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  35.48 
 
 
289 aa  145  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  33.57 
 
 
304 aa  144  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2633  chelated iron transport system membrane protein  30.99 
 
 
297 aa  143  4e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  0.711765 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1702  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeD  30.99 
 
 
297 aa  143  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1812  ABC-3 protein  30.99 
 
 
297 aa  143  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0136745  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1043  ABC-3 protein  35.97 
 
 
312 aa  141  2e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.151088 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  30.57 
 
 
288 aa  138  8e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  29.21 
 
 
288 aa  135  9e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  2.75951e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  29.21 
 
 
288 aa  134  2e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  31.09 
 
 
280 aa  131  1e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  29.46 
 
 
288 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  29.46 
 
 
288 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2045  ABC-3 protein  33.6 
 
 
278 aa  130  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00377513  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2130  ABC-3 protein  30.22 
 
 
286 aa  129  4e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0882717 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  31.46 
 
 
285 aa  125  6e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  30.34 
 
 
281 aa  125  6e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  3.45254e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2208  ABC-3 protein  29.64 
 
 
285 aa  124  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.033424  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0803  ABC-3 protein  31.47 
 
 
290 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117912  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0776  ABC-3 protein  31.47 
 
 
290 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3405  hypothetical protein  30.74 
 
 
285 aa  122  1e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1916  ABC-3 protein  29.29 
 
 
285 aa  121  1e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3701  ABC-3 protein  30.83 
 
 
282 aa  120  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2174  ABC-3 protein  31.94 
 
 
306 aa  120  3e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2143  ABC-3 protein  34.34 
 
 
304 aa  120  4e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1013  ABC transporter  31.93 
 
 
291 aa  120  4e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134252  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  30.37 
 
 
300 aa  118  1e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  32.03 
 
 
287 aa  118  1e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.56655e-06 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  27.62 
 
 
285 aa  117  2e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3260  ABC-3 protein  28.92 
 
 
294 aa  117  2e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00406808  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1661  putative ABC transporter membrane protein  33.85 
 
 
303 aa  117  2e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.726587  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06291  ABC transporter  31.94 
 
 
290 aa  117  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06591  ABC transporter  31.56 
 
 
290 aa  117  3e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.591644  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0326  chelated iron ABC transporter, permease  33.33 
 
 
296 aa  115  6e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0155604  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2209  ABC-3 protein  30.97 
 
 
287 aa  115  1e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0138791  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0325  chelated iron ABC transporter, permease  28 
 
 
280 aa  113  3e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.057736  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3278  ABC-3 protein  30.96 
 
 
291 aa  113  4e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1589  ABC-3 protein  32.03 
 
 
281 aa  112  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1400  ABC-3 protein  30.04 
 
 
351 aa  112  7e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2131  ABC-3 protein  31.76 
 
 
286 aa  112  9e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.241388 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3358  hypothetical protein  31.11 
 
 
297 aa  111  1e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0130649  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4028  ABC-3 protein  33.08 
 
 
306 aa  111  1e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1256  ABC-3 protein  31.79 
 
 
280 aa  111  1e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.400724  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1917  ABC-3 protein  30.22 
 
 
287 aa  111  1e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0159377  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1390  ABC-3 protein  32.26 
 
 
295 aa  111  1e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.0078855  normal  0.217794 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2602  ABC-3 protein  31.6 
 
 
285 aa  110  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0918  ABC-3 protein  29.89 
 
 
278 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0892  ABC-3 protein  29.89 
 
 
278 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13210  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  31.6 
 
 
276 aa  110  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2573  manganese transport system membrane protein MntB  29.5 
 
 
276 aa  109  4e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.449069  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1230  hypothetical protein  32.09 
 
 
301 aa  110  4e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2603  ABC-3 protein  30.71 
 
 
275 aa  109  4e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1114  ABC-3 protein  27.9 
 
 
279 aa  108  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>