More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1203 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_1815  aspartyl-tRNA synthetase  56.95 
 
 
598 aa  716  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2326  aspartyl-tRNA synthetase  59.97 
 
 
600 aa  734  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2038  aspartyl-tRNA synthetase  60.61 
 
 
592 aa  761  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.323108  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0675  aspartyl-tRNA synthetase  60.13 
 
 
600 aa  736  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0691  aspartyl-tRNA synthetase  59.97 
 
 
600 aa  734  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.832914  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2240  aspartyl-tRNA synthetase  63.55 
 
 
592 aa  794  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2406  aspartyl-tRNA synthetase  59.97 
 
 
600 aa  734  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2079  aspartyl-tRNA synthetase  60.2 
 
 
592 aa  758  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.725699  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1892  aspartyl-tRNA synthetase  58.04 
 
 
599 aa  718  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00404218  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2434  aspartyl-tRNA synthetase  58.25 
 
 
590 aa  718  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0126074  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1935  aspartyl-tRNA synthetase  60.54 
 
 
592 aa  758  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0176325  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1268  aspartyl-tRNA synthetase  67.62 
 
 
591 aa  842  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.132766  normal  0.965215 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0735  aspartyl-tRNA synthetase  60.98 
 
 
591 aa  757  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  3.82007e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1242  aspartyl-tRNA synthetase  67.95 
 
 
591 aa  855  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.276348  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0991  aspartyl-tRNA synthetase  87.15 
 
 
601 aa  1104  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  1.25703e-08  unclonable  1.15783e-09 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2187  aspartyl-tRNA synthetase  67.62 
 
 
590 aa  842  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  1.46204e-05  normal  0.319945 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4545  aspartyl-tRNA synthetase  67.11 
 
 
590 aa  829  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.486893  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0056  aspartyl-tRNA synthetase  58.87 
 
 
596 aa  737  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.524796  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1070  aspartyl-tRNA synthetase  60.64 
 
 
599 aa  741  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.171076  normal  0.17773 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0803  aspartyl-tRNA synthetase  58.75 
 
 
603 aa  717  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.979885  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2262  aspartyl-tRNA synthetase  58.63 
 
 
596 aa  728  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.410754  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2725  aspartyl-tRNA synthetase  60.63 
 
 
600 aa  736  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0872752  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01825  hypothetical protein  57.21 
 
 
590 aa  711  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.765739  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1953  aspartyl-tRNA synthetase  61.36 
 
 
591 aa  764  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.154117  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2160  aspartyl-tRNA synthetase  57.62 
 
 
601 aa  720  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0356  aspartyl-tRNA synthetase  61.33 
 
 
623 aa  753  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1843  aspartyl-tRNA synthetase  61.21 
 
 
591 aa  758  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.986528  normal  0.35056 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0699  aspartyl-tRNA synthetase  62.2 
 
 
592 aa  758  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4122  aspartyl-tRNA synthetase  59.6 
 
 
601 aa  720  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.154751  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1707  aspartyl-tRNA synthetase  67.61 
 
 
599 aa  855  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  4.68378e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3637  aspartyl-tRNA synthetase  59.57 
 
 
604 aa  717  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0787  aspartyl-tRNA synthetase  59.33 
 
 
605 aa  745  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.574625  normal  0.685476 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0874  aspartyl-tRNA synthetase  58.75 
 
 
603 aa  717  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.104539  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2752  aspartyl-tRNA synthetase  59.97 
 
 
600 aa  734  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1326  aspartyl-tRNA synthetase  57.07 
 
 
604 aa  698  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2226  aspartyl-tRNA synthetase  63.32 
 
 
617 aa  797  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.544329  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36730  aspartyl-tRNA synthetase  67.28 
 
 
591 aa  839  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2307  aspartyl-tRNA synthetase  60.44 
 
 
592 aa  759  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  2.41226e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2035  aspartyl-tRNA synthetase  59.6 
 
 
598 aa  729  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.1996  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0423  aspartyl-tRNA synthetase  58.11 
 
 
610 aa  728  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  9.68757e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1320  aspartyl-tRNA synthetase  57.21 
 
 
590 aa  712  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4002  aspartyl-tRNA synthetase  67.79 
 
 
591 aa  849  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2575  aspartyl-tRNA synthetase  60.97 
 
 
595 aa  770  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  1.63507e-05  hitchhiker  0.000702641 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2752  aspartyl-tRNA synthetase  60.8 
 
 
600 aa  737  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.314882  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4013  aspartyl-tRNA synthetase  59.63 
 
 
598 aa  743  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.44023e-06 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1597  aspartyl-tRNA synthetase  58.43 
 
 
600 aa  724  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.566711 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2643  aspartyl-tRNA synthetase  60.8 
 
 
600 aa  737  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21858  normal  0.167975 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1346  aspartyl-tRNA synthetase  58.72 
 
 
590 aa  728  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0494228  hitchhiker  0.00190768 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0381  aspartyl-tRNA synthetase  59.47 
 
 
599 aa  725  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26589  normal  0.586164 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1222  aspartyl-tRNA synthetase  58.56 
 
 
590 aa  726  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.241157  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1106  aspartyl-tRNA synthetase  57.21 
 
 
590 aa  712  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0656  aspartyl-tRNA synthetase  60.77 
 
 
599 aa  740  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654045  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0341  aspartyl-tRNA synthetase  61.17 
 
 
623 aa  752  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01727  aspartyl-tRNA synthetase  63.74 
 
 
586 aa  788  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2055  aspartyl-tRNA synthetase  58.72 
 
 
590 aa  728  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2115  aspartyl-tRNA synthetase  58.72 
 
 
590 aa  728  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00789525 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3132  aspartyl-tRNA synthetase  54.29 
 
 
583 aa  643  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0057  aspartyl-tRNA synthetase  58.87 
 
 
596 aa  737  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  2.41419e-07  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1766  aspartyl-tRNA synthetase  57.21 
 
 
590 aa  712  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.836624  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01597  aspartyl-tRNA synthetase  60.24 
 
 
592 aa  738  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1959  aspartyl-tRNA synthetase  57.21 
 
 
590 aa  711  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.9398  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2096  aspartyl-tRNA synthetase  57.21 
 
 
590 aa  712  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.356263  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2030  aspartyl-tRNA synthetase  60.88 
 
 
595 aa  761  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.019591  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2781  aspartyl-tRNA synthetase  58.07 
 
 
593 aa  716  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.332179  normal  0.0858323 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2366  aspartyl-tRNA synthetase  61.21 
 
 
597 aa  763  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00207934  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2040  aspartyl-tRNA synthetase  60.44 
 
 
592 aa  759  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00291501  hitchhiker  1.15872e-07 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1170  aspartyl-tRNA synthetase  63.88 
 
 
599 aa  782  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2423  aspartyl-tRNA synthetase  60.27 
 
 
592 aa  757  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  6.67018e-05  normal  0.106149 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5453  aspartyl-tRNA synthetase  58.47 
 
 
600 aa  718  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2602  aspartyl-tRNA synthetase  57.05 
 
 
590 aa  711  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.445839  normal  0.911145 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0574  aspartyl-tRNA synthetase  60.3 
 
 
600 aa  734  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0673836  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1751  aspartyl-tRNA synthetase  58.45 
 
 
590 aa  731  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  1.2582e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2426  aspartyl-tRNA synthetase  59.6 
 
 
598 aa  729  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0626295  normal  0.119978 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4205  aspartyl-tRNA synthetase  67.62 
 
 
591 aa  850  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.103347  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1886  aspartyl-tRNA synthetase  60.81 
 
 
591 aa  749  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2148  aspartyl-tRNA synthetase  59.6 
 
 
598 aa  729  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2060  aspartyl-tRNA synthetase  58.72 
 
 
590 aa  728  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0198036 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0475  aspartyl-tRNA synthetase  60.4 
 
 
596 aa  747  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  6.26629e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2433  aspartyl-tRNA synthetase  61.53 
 
 
591 aa  769  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0603  aspartyl-tRNA synthetase  60.27 
 
 
588 aa  747  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0560  aspartyl-tRNA synthetase  60.3 
 
 
600 aa  739  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.677051  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2114  aspartyl-tRNA synthetase  60 
 
 
601 aa  748  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.454587  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1297  aspartyl-tRNA synthetase  58.64 
 
 
611 aa  717  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.474496  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0913  aspartyl-tRNA synthetase  66.61 
 
 
594 aa  836  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  8.46052e-09  decreased coverage  2.30652e-07 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2384  aspartyl-tRNA synthetase  63.26 
 
 
594 aa  787  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  3.93733e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0866  aspartyl-tRNA synthetase  59 
 
 
601 aa  736  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.770528  normal  0.0740151 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4043  aspartyl-tRNA synthetase  60.93 
 
 
599 aa  745  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0426746  normal  0.173389 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1887  aspartyl-tRNA synthetase  60.34 
 
 
593 aa  759  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00122802  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1844  aspartyl-tRNA synthetase  64.98 
 
 
592 aa  797  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00295429  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1183  aspartyl-tRNA synthetase  98.85 
 
 
608 aa  1240  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  9.58333e-05  hitchhiker  0.00287943 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3981  aspartyl-tRNA synthetase  66.44 
 
 
591 aa  833  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0111519  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0193  aspartyl-tRNA synthetase  59.97 
 
 
600 aa  734  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.624275  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1434  aspartyl-tRNA synthetase  57.77 
 
 
593 aa  727  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4411  aspartyl-tRNA synthetase  68.29 
 
 
591 aa  850  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00200172  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0302  aspartyl-tRNA synthetase  60.61 
 
 
595 aa  756  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0234684  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0852  aspartyl-tRNA synthetase  59.97 
 
 
598 aa  733  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.591723  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2099  aspartyl-tRNA synthetase  57.28 
 
 
598 aa  719  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0442  aspartyl-tRNA synthetase  62.13 
 
 
597 aa  770  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.967913 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0439  aspartyl-tRNA synthetase  60.3 
 
 
602 aa  744  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.142464  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0890  aspartyl-tRNA synthetase  62.27 
 
 
596 aa  771  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  7.08268e-10  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>