82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0090 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0090  uroporphyrinogen-III synthase  100 
 
 		 327 aa  665    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0099  putative uroporphyrinogen-III synthase  86.62 
 
 		 325 aa  554  1e-157  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2262  uroporphyrinogen-III synthase-like protein  33.88 
 
 		 289 aa  155  7e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.405188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0281  uroporphyrinogen-III synthase  28.14 
 
 		 257 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0212  uroporphyrinogen-III synthase  27.12 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2748  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.23 
 
 		 693 aa  63.2  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3061  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.1 
 
 		 672 aa  62.8  0.000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69440  uroporphyrinogen-III synthase  31.91 
 
 		 251 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0257  uroporphyrinogen-III synthase  28.45 
 
 		 255 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.884296  normal  0.835101 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6005  uroporphyrinogen-III synthase  30.85 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.201687  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0486  uroporphyrinogen III synthase HEM4  26.44 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3666  Na+/H+ antiporter NhaA  26.37 
 
 		 290 aa  55.1  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.232778  normal  0.349209 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0503  uroporphyrinogen III synthase HEM4  26.02 
 
 		 265 aa  55.5  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2356  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.41 
 
 		 695 aa  55.1  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134951  normal  0.286784 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0028  Uroporphyrinogen-III synthase  26.84 
 
 		 272 aa  55.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2567  uroporphyrinogen-III synthase  27.53 
 
 		 252 aa  54.7  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.134092 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0701  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.28 
 
 		 689 aa  55.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47590  uroporphyrinogen-III synthase  25.1 
 
 		 262 aa  54.3  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2689  uroporphyrinogen-III synthase  26.7 
 
 		 260 aa  53.5  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2178  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.62 
 
 		 686 aa  53.9  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.280216  hitchhiker  0.000563849 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0129  uroporphyrinogen-III synthetase  28.45 
 
 		 258 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0439  uroporphyrinogen III synthase HEM4  34.68 
 
 		 239 aa  53.5  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00315  uroporphyrinogen-III synthase  25.25 
 
 		 242 aa  53.5  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4172  uroporphyrinogen-III synthase  33.33 
 
 		 246 aa  53.1  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0344779  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0034  uroporphyrinogen-III synthase  24.74 
 
 		 256 aa  52.4  0.000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3981  uroporphyrinogen-III synthase  33.33 
 
 		 246 aa  52.4  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000864571  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002105  uroporphyrinogen-III synthase  31.91 
 
 		 242 aa  52  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.939405  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0061  uroporphyrinogen-III synthase  27.78 
 
 		 257 aa  52  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1070  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.96 
 
 		 672 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3641  uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.92 
 
 		 244 aa  50.8  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5486  uroporphyrinogen-III synthase  24.68 
 
 		 255 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0113  uroporphyrinogen III methylase  23.62 
 
 		 264 aa  50.4  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0209  uroporphyrinogen-III synthase  27.74 
 
 		 255 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0187  uroporphyrinogen-III synthase  27.07 
 
 		 255 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0385  uroporphyrinogen III synthase HEM4  34 
 
 		 232 aa  50.1  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.108763  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0227  uroporphyrinogen-III synthase  37.38 
 
 		 246 aa  50.1  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1438  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  27.04 
 
 		 267 aa  49.7  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880003  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0219  uroporphyrinogen III synthase HemD  23.38 
 
 		 248 aa  50.1  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0387  uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.65 
 
 		 238 aa  50.1  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.999258  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3673  uroporphyrinogen-III synthase  40 
 
 		 260 aa  49.7  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2570  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.99 
 
 		 702 aa  49.3  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.866591 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3639  uroporphyrinogen III synthase HEM4  38.81 
 
 		 232 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.23023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1026  uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.36 
 
 		 264 aa  48.9  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.928762  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2669  uroporphyrinogen-III synthase  28.27 
 
 		 261 aa  48.5  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000490526 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0387  uroporphyrinogen III synthase HEM4  38.81 
 
 		 232 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.8019  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0178  uroporphyrinogen-III synthase  35.11 
 
 		 246 aa  48.9  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0118658  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3410  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  24.63 
 
 		 672 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00149  uroporphyrinogen-III synthetase  27.18 
 
 		 243 aa  48.5  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3255  uroporphyrinogen-III synthase  29.41 
 
 		 239 aa  47.8  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.286341 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4263  uroporphyrinogen-III synthase  33.68 
 
 		 246 aa  47.4  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4175  Uroporphyrinogen-III synthase  33.68 
 
 		 246 aa  47  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.272222  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4203  uroporphyrinogen-III synthase  33.68 
 
 		 246 aa  47  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.110892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5242  uroporphyrinogen-III synthase  33.68 
 
 		 246 aa  47  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4319  uroporphyrinogen-III synthase  33.68 
 
 		 246 aa  47  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0995416  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4024  uroporphyrinogen-III synthase  33.68 
 
 		 246 aa  47  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00563247  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03628  hypothetical protein  33.68 
 
 		 246 aa  47  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.408532  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4314  uroporphyrinogen-III synthase  35.94 
 
 		 246 aa  47.4  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03679  uroporphyrinogen-III synthetase  33.68 
 
 		 246 aa  47  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.398858  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4326  uroporphyrinogen-III synthase  33.72 
 
 		 246 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.975314 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4165  uroporphyrinogen-III synthase  33.72 
 
 		 246 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000285608  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0011  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  26.84 
 
 		 271 aa  45.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.458741 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4150  uroporphyrinogen-III synthase  33.72 
 
 		 246 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4219  uroporphyrinogen-III synthase  33.72 
 
 		 246 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.374545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3108  uroporphyrinogen III synthase HEM4  27.13 
 
 		 251 aa  45.4  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.917277  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0062  uroporphyrinogen-III synthase  32.29 
 
 		 246 aa  45.8  0.001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2399  uroporphyrinogen-III synthase  32.98 
 
 		 260 aa  45.8  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.659823  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4169  uroporphyrinogen-III synthase  32.63 
 
 		 246 aa  45.8  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.534441 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2333  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.49 
 
 		 655 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.623737 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4267  uroporphyrinogen-III synthase  33.72 
 
 		 246 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4001  uroporphyrinogen III synthase HEM4  30.61 
 
 		 232 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.655634  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3089  uroporphyrinogen III synthase  25.98 
 
 		 287 aa  44.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.479559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2897  Uroporphyrinogen-III synthase  36.05 
 
 		 262 aa  44.3  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.116607  normal  0.0810585 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3299  uroporphyrinogen-III synthase  36.05 
 
 		 262 aa  44.3  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.466839  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3902  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.59 
 
 		 246 aa  43.9  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01871  putative uroporphyrinogen III synthase  21.51 
 
 		 261 aa  43.5  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.773561  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0073  uroporphyrinogen-III synthase  28.92 
 
 		 253 aa  43.5  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4095  uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.59 
 
 		 246 aa  43.1  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.56612 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3979  uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.59 
 
 		 246 aa  43.5  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2661  uroporphyrinogen-III synthetase  24.29 
 
 		 250 aa  42.7  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2165  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.75 
 
 		 665 aa  42.7  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.255779 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0482  uroporphyrinogen III synthase HEM4  23.24 
 
 		 243 aa  42.4  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5751  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  24.14 
 
 		 656 aa  42.4  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>