84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_2262 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_2262  uroporphyrinogen-III synthase-like protein  100 
 
 		 289 aa  597  1e-170  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.405188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0099  putative uroporphyrinogen-III synthase  34.74 
 
 		 325 aa  158  1e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0090  uroporphyrinogen-III synthase  33.55 
 
 		 327 aa  157  2e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0281  uroporphyrinogen-III synthase  33.73 
 
 		 257 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69440  uroporphyrinogen-III synthase  32.53 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0212  uroporphyrinogen-III synthase  31.33 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4134  uroporphyrinogen III synthase HEM4  30.91 
 
 		 244 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47590  uroporphyrinogen-III synthase  31.52 
 
 		 262 aa  64.3  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0129  uroporphyrinogen-III synthetase  30.81 
 
 		 258 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2356  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.07 
 
 		 695 aa  62.4  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134951  normal  0.286784 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6005  uroporphyrinogen-III synthase  31.93 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.201687  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5486  uroporphyrinogen-III synthase  31.1 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0257  uroporphyrinogen-III synthase  33.73 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.884296  normal  0.835101 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0482  uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.48 
 
 		 243 aa  58.9  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0209  uroporphyrinogen-III synthase  32.53 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0061  uroporphyrinogen-III synthase  29.65 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3255  uroporphyrinogen-III synthase  26.51 
 
 		 239 aa  58.2  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.286341 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0187  uroporphyrinogen-III synthase  32.53 
 
 		 255 aa  57  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2178  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.49 
 
 		 686 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.280216  hitchhiker  0.000563849 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3061  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.33 
 
 		 672 aa  56.6  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0028  Uroporphyrinogen-III synthase  27.44 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0073  uroporphyrinogen-III synthase  33.65 
 
 		 253 aa  55.5  0.0000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2689  uroporphyrinogen-III synthase  29.94 
 
 		 260 aa  55.1  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0113  uroporphyrinogen III methylase  25.75 
 
 		 264 aa  55.1  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0503  uroporphyrinogen III synthase HEM4  27.15 
 
 		 265 aa  55.1  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3673  uroporphyrinogen-III synthase  30.59 
 
 		 260 aa  55.5  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002105  uroporphyrinogen-III synthase  26.19 
 
 		 242 aa  55.5  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.939405  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2570  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.38 
 
 		 702 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.866591 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0486  uroporphyrinogen III synthase HEM4  26.14 
 
 		 270 aa  54.7  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1438  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  27.54 
 
 		 267 aa  53.9  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880003  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0011  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  25.93 
 
 		 271 aa  53.5  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.458741 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0317  uroporphyrinogen III synthase HEM4  25.42 
 
 		 243 aa  53.5  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00149  uroporphyrinogen-III synthetase  22.42 
 
 		 243 aa  52.8  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1026  uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.14 
 
 		 264 aa  52.8  0.000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.928762  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3588  uroporphyrinogen III synthase HEM4  27.08 
 
 		 246 aa  51.2  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2792  uroporphyrinogen-III synthetase  27.27 
 
 		 250 aa  50.4  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0219  uroporphyrinogen III synthase HemD  28.57 
 
 		 248 aa  50.8  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2165  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.88 
 
 		 665 aa  50.4  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.255779 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0385  uroporphyrinogen III synthase HEM4  37.21 
 
 		 232 aa  50.1  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.108763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2567  uroporphyrinogen-III synthase  30.77 
 
 		 252 aa  50.1  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.134092 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0387  uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.14 
 
 		 238 aa  49.7  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.999258  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4314  uroporphyrinogen-III synthase  26.73 
 
 		 246 aa  50.1  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0341  uroporphyrinogen III synthase HEM4  30 
 
 		 240 aa  49.7  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0439  uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.48 
 
 		 239 aa  49.3  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3179  uroporphyrinogen-III synthase  24.08 
 
 		 252 aa  49.3  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0387  uroporphyrinogen III synthase HEM4  37.21 
 
 		 232 aa  48.9  0.00009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.8019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3639  uroporphyrinogen III synthase HEM4  37.21 
 
 		 232 aa  48.9  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.23023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5751  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.61 
 
 		 656 aa  48.9  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00315  uroporphyrinogen-III synthase  25 
 
 		 242 aa  48.5  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3108  uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.82 
 
 		 251 aa  48.5  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.917277  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3592  uroporphyrinogen III synthase HEM4  23.98 
 
 		 250 aa  47.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1070  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.86 
 
 		 672 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0701  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.13 
 
 		 689 aa  47.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2467  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.12 
 
 		 655 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3981  uroporphyrinogen-III synthase  31.36 
 
 		 246 aa  47  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000864571  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2661  uroporphyrinogen-III synthetase  26.35 
 
 		 250 aa  47  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2748  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.08 
 
 		 693 aa  46.2  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3410  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.28 
 
 		 672 aa  46.2  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2333  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.12 
 
 		 655 aa  46.2  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.623737 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3979  uroporphyrinogen III synthase HEM4  27.98 
 
 		 246 aa  46.2  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3299  uroporphyrinogen-III synthase  28.82 
 
 		 262 aa  45.8  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.466839  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2897  Uroporphyrinogen-III synthase  28.82 
 
 		 262 aa  45.8  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.116607  normal  0.0810585 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3902  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  27.98 
 
 		 246 aa  45.8  0.0009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2669  uroporphyrinogen-III synthase  28.74 
 
 		 261 aa  45.4  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000490526 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3641  uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.21 
 
 		 244 aa  45.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4095  uroporphyrinogen III synthase HEM4  27.98 
 
 		 246 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.56612 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1231  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.12 
 
 		 659 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4581  uroporphyrinogen-III synthase  23.97 
 
 		 250 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0870  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.39 
 
 		 656 aa  44.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.787739 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0736  uroporphyrinogen-III synthase  29.52 
 
 		 259 aa  44.3  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.512163 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1072  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.12 
 
 		 659 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1596  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.12 
 
 		 659 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.447843  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3001  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.12 
 
 		 659 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2283  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.12 
 
 		 659 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1078  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.12 
 
 		 659 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2767  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.31 
 
 		 503 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0731  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.12 
 
 		 659 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0062  uroporphyrinogen-III synthase  25.67 
 
 		 246 aa  43.5  0.004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2558  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.19 
 
 		 506 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0873  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.37 
 
 		 659 aa  43.5  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2399  uroporphyrinogen-III synthase  26.63 
 
 		 260 aa  43.5  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.659823  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0653  uroporphyrinogen-III synthase  23.43 
 
 		 250 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0178  uroporphyrinogen-III synthase  28.07 
 
 		 246 aa  42.4  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0118658  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1125  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase, uroporphyrinogen-III synthase  30.28 
 
 		 516 aa  42.4  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.325525 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>