212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2792 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2792  uroporphyrinogen-III synthetase  100 
 
 
250 aa  511  1e-144  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2661  uroporphyrinogen-III synthetase  96 
 
 
250 aa  492  9.999999999999999e-139  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2897  Uroporphyrinogen-III synthase  33.61 
 
 
262 aa  126  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.116607  normal  0.0810585 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3299  uroporphyrinogen-III synthase  33.61 
 
 
262 aa  126  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.466839  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2689  uroporphyrinogen-III synthase  31.37 
 
 
260 aa  124  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0011  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.04 
 
 
271 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.458741 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0034  uroporphyrinogen-III synthase  32.35 
 
 
256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0028  Uroporphyrinogen-III synthase  30.57 
 
 
272 aa  112  5e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2567  uroporphyrinogen-III synthase  29.91 
 
 
252 aa  107  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.134092 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2669  uroporphyrinogen-III synthase  29.29 
 
 
261 aa  107  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000490526 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3673  uroporphyrinogen-III synthase  29.46 
 
 
260 aa  106  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0482  uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.95 
 
 
243 aa  101  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00315  uroporphyrinogen-III synthase  29.96 
 
 
242 aa  101  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2399  uroporphyrinogen-III synthase  29.48 
 
 
260 aa  99.4  6e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.659823  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002105  uroporphyrinogen-III synthase  29.65 
 
 
242 aa  99  7e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.939405  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3061  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.17 
 
 
672 aa  98.2  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2173  uroporphyrinogen-III synthase  30.2 
 
 
268 aa  98.2  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3639  uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.15 
 
 
232 aa  97.1  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.23023  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0439  uroporphyrinogen III synthase HEM4  27.75 
 
 
239 aa  97.4  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0385  uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.15 
 
 
232 aa  97.4  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.108763  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1026  uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.38 
 
 
264 aa  97.1  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.928762  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0503  uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.3 
 
 
265 aa  96.7  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0387  uroporphyrinogen III synthase HEM4  30.74 
 
 
238 aa  96.7  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.999258  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0387  uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.15 
 
 
232 aa  96.7  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.8019  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0008  uroporphyrinogen-III synthase  29.8 
 
 
268 aa  96.3  5e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0960218  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1438  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  27.69 
 
 
267 aa  95.1  8e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880003  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4314  uroporphyrinogen-III synthase  28.69 
 
 
246 aa  95.5  8e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3902  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.13 
 
 
246 aa  95.5  8e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0372  uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.55 
 
 
243 aa  94.4  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4095  uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.13 
 
 
246 aa  94.4  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.56612 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0486  uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.57 
 
 
270 aa  92.8  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0219  uroporphyrinogen III synthase HemD  25.65 
 
 
248 aa  92  7e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3979  uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.7 
 
 
246 aa  92  7e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4134  uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.31 
 
 
244 aa  91.7  9e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3588  uroporphyrinogen III synthase HEM4  27.78 
 
 
246 aa  91.7  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0341  uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.51 
 
 
240 aa  90.1  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4001  uroporphyrinogen III synthase HEM4  30.41 
 
 
232 aa  90.1  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.655634  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1540  Uroporphyrinogen-III synthase  29.23 
 
 
249 aa  88.2  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.221664  hitchhiker  0.00271946 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0113  uroporphyrinogen III methylase  30.54 
 
 
264 aa  87.4  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0317  uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.95 
 
 
243 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4150  uroporphyrinogen-III synthase  27.9 
 
 
246 aa  81.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0701  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.22 
 
 
504 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3201  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.92 
 
 
519 aa  81.3  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4326  uroporphyrinogen-III synthase  27.9 
 
 
246 aa  81.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.975314 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30 
 
 
510 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4165  uroporphyrinogen-III synthase  27.9 
 
 
246 aa  81.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000285608  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0178  uroporphyrinogen-III synthase  27.54 
 
 
246 aa  81.6  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0118658  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3255  uroporphyrinogen-III synthase  29.35 
 
 
239 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.286341 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2579  Uroporphyrinogen-III synthase  28.57 
 
 
266 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3353  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.9 
 
 
504 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422788  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0501  Uroporphyrinogen-III synthase  25.49 
 
 
276 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000190734  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1797  uroporphyrinogen-III synthase  27.32 
 
 
251 aa  80.1  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0201801  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4267  uroporphyrinogen-III synthase  27.47 
 
 
246 aa  79.7  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30 
 
 
511 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4219  uroporphyrinogen-III synthase  27.47 
 
 
246 aa  79.3  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.374545  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0932  Uroporphyrinogen-III synthase  27.32 
 
 
249 aa  79  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1125  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase, uroporphyrinogen-III synthase  26.85 
 
 
516 aa  79  0.00000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.325525 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1977  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  26.21 
 
 
513 aa  77.4  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0017868  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3981  uroporphyrinogen-III synthase  27.9 
 
 
246 aa  75.5  0.0000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000864571  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0896  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.78 
 
 
506 aa  74.7  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1514  uroporphyrinogen-III synthase  25.77 
 
 
247 aa  74.7  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0212  uroporphyrinogen-III synthase  26.97 
 
 
255 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475879  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3549  uroporphyrinogen III synthase HEM4  26.79 
 
 
266 aa  74.7  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6005  uroporphyrinogen-III synthase  23.77 
 
 
251 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.201687  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1258  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.94 
 
 
508 aa  74.7  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.323904  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3988  uroporphyrinogen-III synthase  26.84 
 
 
246 aa  74.7  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0209  uroporphyrinogen-III synthase  28.51 
 
 
255 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69440  uroporphyrinogen-III synthase  24.69 
 
 
251 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4172  uroporphyrinogen-III synthase  26.18 
 
 
246 aa  73.9  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0344779  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0892  Uroporphyrinogen-III synthase  26.8 
 
 
245 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3235  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  27 
 
 
513 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0761379  normal  0.140873 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4175  Uroporphyrinogen-III synthase  25.75 
 
 
246 aa  72.8  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.272222  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4203  uroporphyrinogen-III synthase  25.75 
 
 
246 aa  73.2  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.110892  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0045  uroporphyrinogen-III synthase  26.7 
 
 
222 aa  72.8  0.000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4319  uroporphyrinogen-III synthase  25.75 
 
 
246 aa  72.4  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0995416  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4024  uroporphyrinogen-III synthase  25.75 
 
 
246 aa  72  0.000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00563247  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2207  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.32 
 
 
507 aa  72  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00880064  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5242  uroporphyrinogen-III synthase  25.75 
 
 
246 aa  72  0.000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03679  uroporphyrinogen-III synthetase  25.75 
 
 
246 aa  72  0.000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.398858  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0187  uroporphyrinogen-III synthase  28.1 
 
 
255 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03628  hypothetical protein  25.75 
 
 
246 aa  72  0.000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.408532  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0535  uroporphyrinogen-III synthase  27.47 
 
 
249 aa  72  0.000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4017  uroporphyrinogen-III synthase  27.47 
 
 
249 aa  72  0.000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.405149  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4263  uroporphyrinogen-III synthase  25.75 
 
 
246 aa  72  0.000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0197  uroporphyrinogen-III synthase  27.47 
 
 
249 aa  72  0.000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00133341  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3592  uroporphyrinogen III synthase HEM4  26.36 
 
 
250 aa  71.2  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0949  Uroporphyrinogen-III synthase  27.84 
 
 
247 aa  70.9  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1341  Uroporphyrinogen-III synthase  27.23 
 
 
266 aa  70.9  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4169  uroporphyrinogen-III synthase  25.75 
 
 
246 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.534441 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2162  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.54 
 
 
512 aa  70.5  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000123773  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0227  uroporphyrinogen-III synthase  26.58 
 
 
246 aa  70.1  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5486  uroporphyrinogen-III synthase  26.94 
 
 
255 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47590  uroporphyrinogen-III synthase  25.41 
 
 
262 aa  68.9  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0252  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.98 
 
 
511 aa  68.6  0.00000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2837  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  26.96 
 
 
503 aa  68.2  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.452302  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2767  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.73 
 
 
503 aa  68.2  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1057  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.32 
 
 
505 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681167 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0765  uroporphyrinogen III synthase HEM4  27.24 
 
 
267 aa  68.2  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000129403 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3108  uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.43 
 
 
251 aa  67.4  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.917277  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1428  uroporphyrinogen-III synthase  25.26 
 
 
248 aa  67  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>