More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3306 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1581  polyA polymerase family protein  58.52 
 
 		 880 aa  1012    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.48144  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0358  CBS domain containing protein  39.46 
 
 		 1077 aa  645    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0457131 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1458  Polynucleotide adenylyltransferase region  42.17 
 
 		 892 aa  689    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.402567  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2294  CBS domain containing protein  56.38 
 
 		 875 aa  992    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1297  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  48.39 
 
 		 888 aa  827    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.795106  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1578  PolyA polymerase family protein  56.78 
 
 		 880 aa  1007    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.507141  normal  0.242793 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1972  CBS  43.49 
 
 		 898 aa  700    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.03578  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1184  Polynucleotide adenylyltransferase region  41.61 
 
 		 905 aa  638    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0878  CBS domain containing protein  61.43 
 
 		 880 aa  1090    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1346  cyclic nucleotide-binding protein  43.01 
 
 		 902 aa  703    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.761753 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2246  CBS domain-containing protein  57.53 
 
 		 875 aa  1028    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1929  CBS domain containing protein  56.15 
 
 		 875 aa  989    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0679  polynucleotide adenylyltransferase region  45.89 
 
 		 888 aa  786    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.197003  normal  0.0338911 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3306  polynucleotide adenylyltransferase region  100 
 
 		 881 aa  1781    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102582  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1433  polynucleotide adenylyltransferase region  43.04 
 
 		 904 aa  694    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.743333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2755  CBS domain-containing protein  42.08 
 
 		 896 aa  731    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.1635  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1131  polynucleotide adenylyltransferase region  38.84 
 
 		 907 aa  635  1e-180  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00727527  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2087  Polynucleotide adenylyltransferase region  37.17 
 
 		 877 aa  568  1e-160  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.625204 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1420  polyA polymerase family protein  35.98 
 
 		 880 aa  567  1e-160  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0185526  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0684  polynucleotide adenylyltransferase region  34.7 
 
 		 877 aa  556  1e-157  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1654  CBS domain containing protein  35.81 
 
 		 890 aa  555  1e-156  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.873652 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0215  CBS domain-containing protein  34.95 
 
 		 863 aa  523  1e-147  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  36 
 
 		 873 aa  520  1e-146  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0213  CBS domain-containing protein  35.24 
 
 		 863 aa  522  1e-146  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0891  polynucleotide adenylyltransferase region  34.02 
 
 		 883 aa  514  1e-144  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3428  Polynucleotide adenylyltransferase region  35.63 
 
 		 873 aa  479  1e-134  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000799776  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0750  CBS domain containing protein  35.89 
 
 		 867 aa  478  1e-133  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.596795  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1425  CBS domain-containing protein  32.33 
 
 		 859 aa  474  1e-132  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1695  CBS domain-containing protein  31.21 
 
 		 885 aa  471  1.0000000000000001e-131  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  35.91 
 
 		 769 aa  459  1e-127  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  34.99 
 
 		 845 aa  445  1e-123  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2388  Polynucleotide adenylyltransferase region  31.58 
 
 		 903 aa  436  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.991166 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2847  polynucleotide adenylyltransferase region  34.97 
 
 		 874 aa  435  1e-120  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2466  polynucleotide adenylyltransferase region  35.99 
 
 		 872 aa  434  1e-120  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.779181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07150  CBS domain containing protein  32.24 
 
 		 865 aa  421  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0367477  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1708  phosphoesterase, RecJ-like  32.5 
 
 		 904 aa  414  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.833662  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4294  polynucleotide adenylyltransferase region  32.1 
 
 		 907 aa  405  1e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00498072  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3742  Polynucleotide adenylyltransferase region  31.56 
 
 		 903 aa  405  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3792  Polynucleotide adenylyltransferase region  31.19 
 
 		 903 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1421  polynucleotide adenylyltransferase region  32.29 
 
 		 909 aa  403  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0976  CBS  32.1 
 
 		 909 aa  387  1e-106  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000281258  normal  0.107884 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2030  Polynucleotide adenylyltransferase region  32.86 
 
 		 854 aa  358  1.9999999999999998e-97  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.609547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1481  Polynucleotide adenylyltransferase region  26.16 
 
 		 847 aa  297  5e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000006237  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1441  Polynucleotide adenylyltransferase region  27.03 
 
 		 821 aa  278  2e-73  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000556215  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0635  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 432 aa  230  9e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00186716  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1450  Polynucleotide adenylyltransferase region  34.32 
 
 		 450 aa  217  9e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1774  polyA polymerase family protein  34.32 
 
 		 450 aa  217  9e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.69358  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2615  polynucleotide adenylyltransferase region  33.33 
 
 		 404 aa  189  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0405883  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1564  polynucleotide adenylyltransferase region  30.34 
 
 		 388 aa  182  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1363  polynucleotide adenylyltransferase region  38.1 
 
 		 383 aa  167  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0642  polynucleotide adenylyltransferase region  35.63 
 
 		 374 aa  164  7e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000899541  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0409  polyA polymerase family protein  27 
 
 		 418 aa  157  1e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_352  polyA polymerase, tRNA nucleotidyltransferase  28.81 
 
 		 418 aa  153  1e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0388  polynucleotide adenylyltransferase region  27.55 
 
 		 416 aa  152  2e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2260  Polynucleotide adenylyltransferase region  30.88 
 
 		 422 aa  150  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.029615  unclonable  0.0000000423985 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1937  polynucleotide adenylyltransferase  26.67 
 
 		 567 aa  142  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2535  tRNA adenylyltransferase (tRNA nucleotidyl transferase)  29.44 
 
 		 479 aa  141  6e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0665  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  36.8 
 
 		 484 aa  132  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0990908 
 
 
-
 
NC_002950  PG0801  polyA polymerase family protein  35.54 
 
 		 483 aa  124  6e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0854  Polynucleotide adenylyltransferase region  33.76 
 
 		 468 aa  124  9e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00520307 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0872  hypothetical protein  35.04 
 
 		 474 aa  119  1.9999999999999998e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2415  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.32 
 
 		 471 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4906  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  30.43 
 
 		 495 aa  118  5e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06110  tRNA nucleotidyltransferase  32.5 
 
 		 477 aa  117  1.0000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5957  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  32.91 
 
 		 483 aa  117  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122928  normal  0.0117202 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2058  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.22 
 
 		 469 aa  117  1.0000000000000001e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3525  Polynucleotide adenylyltransferase region  43.98 
 
 		 448 aa  115  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.224253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2544  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  37.5 
 
 		 561 aa  113  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0551  polynucleotide adenylyltransferase region  41.21 
 
 		 377 aa  111  5e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0184  polyA polymerase  33.03 
 
 		 403 aa  110  9.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.648939  normal  0.0507556 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0305  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  24.01 
 
 		 415 aa  110  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.535708  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03261  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  24.14 
 
 		 415 aa  110  2e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1109  metal dependent phosphohydrolase  33.05 
 
 		 470 aa  107  8e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.875974  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03271  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  23.82 
 
 		 415 aa  106  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.163609  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1668  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  34.27 
 
 		 418 aa  105  5e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03821  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  34.27 
 
 		 418 aa  104  6e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.150415  normal  0.362341 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25491  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  37.44 
 
 		 415 aa  103  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0212  polyA polymerase  39.66 
 
 		 404 aa  103  2e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.809405  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1306  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  30 
 
 		 489 aa  102  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1525  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  30.38 
 
 		 475 aa  102  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36397  predicted protein  28.04 
 
 		 759 aa  101  7e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0992  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  32.71 
 
 		 471 aa  100  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03361  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  29.89 
 
 		 415 aa  99  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0600629  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1213  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.05 
 
 		 479 aa  98.2  7e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1012  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  26.36 
 
 		 399 aa  98.2  7e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.200696  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1151  polyA polymerase family protein  31.17 
 
 		 475 aa  96.3  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.71029 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2857  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  31.05 
 
 		 484 aa  96.3  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.858546  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0722  HDIG  31.4 
 
 		 476 aa  95.9  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.314731  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1528  poly(A) polymerase  30.55 
 
 		 484 aa  93.6  1e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000410456  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1756  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  38.12 
 
 		 473 aa  93.2  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3376  poly(A) polymerase  32.5 
 
 		 443 aa  92.4  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000590256  normal  0.326432 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0065  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  32.63 
 
 		 467 aa  92  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000449224  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4574  HDIG domain-containing protein  33.9 
 
 		 485 aa  92  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.119435 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5092  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.76 
 
 		 485 aa  90.9  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000588683 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3665  multifunctional tRNA nucleotidyl transferase/2'3'-cyclic phosphodiesterase/2'nucleotidase/phosphatase  34.2 
 
 		 428 aa  89.7  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4118  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  40.54 
 
 		 458 aa  90.1  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00476179 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0924  polynucleotide adenylyltransferase region  33.93 
 
 		 384 aa  89.4  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.101669  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23340  tRNA adenylyltransferase  33.2 
 
 		 483 aa  89  4e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3120  polynucleotide adenylyltransferase region  33.82 
 
 		 450 aa  88.6  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0608  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  32.5 
 
 		 584 aa  88.2  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>