More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2364 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2364  response regulator receiver modulated CheW protein  100 
 
 
297 aa  607  9.999999999999999e-173  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2225  response regulator receiver modulated CheW protein  58.53 
 
 
318 aa  355  3.9999999999999996e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1805  response regulator receiver modulated CheW protein  47.32 
 
 
312 aa  259  4e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.123386  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0629  response regulator receiver modulated CheW protein  44.85 
 
 
308 aa  245  8e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01282  hypothetical protein  38.96 
 
 
308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1068  putative CheW protein  36.25 
 
 
309 aa  195  9e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0334866  normal  0.0302452 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004175  chemotaxis protein CheV  37.66 
 
 
308 aa  192  6e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1794  chemotaxis protein CheV  37.91 
 
 
308 aa  191  9e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1215  response regulator receiver modulated CheW protein  36.54 
 
 
310 aa  191  2e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.186708  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3734  response regulator receiver modulated CheW protein  34.84 
 
 
309 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2340  chemotaxis protein methyltransferase CheV  37.86 
 
 
306 aa  190  2.9999999999999997e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06152  chemotaxis protein  35.14 
 
 
314 aa  186  5e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000739527  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01014  chemotaxis protein  35.14 
 
 
314 aa  186  5e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.347371  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1431  response regulator receiver modulated CheW protein  36.99 
 
 
313 aa  186  5e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20750  putative chemotaxis protein  35.69 
 
 
310 aa  185  9e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1781  putative chemotaxis protein  35.05 
 
 
310 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1461  putative CheW protein  34.41 
 
 
309 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4393  chemotaxis protein CheV  34.08 
 
 
309 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3954  response regulator receiver modulated CheW protein  34.41 
 
 
309 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2215  putative chemotaxis protein  33.66 
 
 
316 aa  180  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3486  response regulator receiver:CheW-like protein  33.87 
 
 
308 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1907  response regulator receiver modulated CheW protein  33.9 
 
 
314 aa  179  5.999999999999999e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.150829 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1301  CheW-like protein  34.98 
 
 
306 aa  178  9e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1927  chemotaxis protein CheV, putative  33.55 
 
 
308 aa  178  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.203525  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4253  CheW protein  34.52 
 
 
310 aa  177  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.861577 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0522  putative CheW protein  36.36 
 
 
311 aa  175  9e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0924  response regulator receiver modulated CheW protein  34.1 
 
 
309 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0891  response regulator receiver modulated CheW protein  35.6 
 
 
312 aa  173  3.9999999999999995e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.875715  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3102  response regulator receiver modulated CheW protein  35.55 
 
 
306 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.896505 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2964  putative CheW protein  35.55 
 
 
306 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.725917  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2949  putative CheW protein  35.55 
 
 
306 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1414  response regulator receiver modulated CheW protein  35.55 
 
 
306 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1257  response regulator receiver modulated CheW protein  36.09 
 
 
306 aa  170  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1319  response regulator receiver modulated CheW protein  34.55 
 
 
306 aa  170  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0920942 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1327  response regulator receiver modulated CheW protein  36.09 
 
 
306 aa  170  3e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1343  response regulator receiver modulated CheW protein  34.88 
 
 
306 aa  169  5e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.447173  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1176  putative CheW protein  34.84 
 
 
309 aa  169  5e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.531119  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2852  putative CheW protein  34.74 
 
 
310 aa  169  7e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.141391 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1474  chemotaxis protein CheV  34.33 
 
 
309 aa  168  8e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1595  response regulator receiver modulated CheW protein  33.33 
 
 
307 aa  168  8e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1159  response regulator receiver modulated CheW protein  33.89 
 
 
306 aa  168  9e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.601808  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1476  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  34.7 
 
 
324 aa  167  1e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1572  CheW protein  34.42 
 
 
310 aa  167  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2213  putative CheW protein  32.67 
 
 
311 aa  167  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.542266 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2320  chemotaxis protein CheV  33.33 
 
 
306 aa  168  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.698234  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1063  putative CheW protein  34.59 
 
 
307 aa  167  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3252  chemotaxis protein CheV  34.88 
 
 
306 aa  167  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3089  response regulator receiver modulated CheW protein  33.33 
 
 
306 aa  167  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3297  response regulator receiver:CheW-like protein  33.88 
 
 
308 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.307395  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2599  putative CheW protein  34.88 
 
 
306 aa  165  8e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3954  CheW protein  34.97 
 
 
311 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2128  chemotaxis protein CheV  33.99 
 
 
311 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.103105 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2316  response regulator receiver modulated CheW protein  34.11 
 
 
313 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.90141  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3612  putative CheW protein  33.99 
 
 
311 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.296716  normal  0.145923 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1646  response regulator receiver modulated CheW protein  33.66 
 
 
311 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3524  chemotaxis protein CheV, putative  33.22 
 
 
308 aa  161  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.010446  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003013  chemotaxis protein CheV  31.15 
 
 
317 aa  160  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1670  response regulator receiver modulated CheW protein  33.99 
 
 
311 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.75876 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1338  response regulator receiver modulated CheW protein  32.33 
 
 
306 aa  160  3e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2344  response regulator receiver modulated CheW protein  32.25 
 
 
314 aa  159  4e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.088498  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2462  response regulator receiver modulated CheW protein  32.25 
 
 
314 aa  159  4e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0985134  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2272  response regulator receiver modulated CheW protein  32.25 
 
 
314 aa  159  5e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.740501  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1989  chemotaxis protein CheV  31.92 
 
 
314 aa  159  7e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2319  putative CheW protein  31.8 
 
 
314 aa  159  8e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00776156  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2144  response regulator receiver modulated CheW protein  31.13 
 
 
317 aa  159  8e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000067765  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1592  chemotaxis protein CheV  30.26 
 
 
314 aa  158  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02869  hypothetical protein  30.82 
 
 
313 aa  157  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2594  putative CheW protein  31.92 
 
 
314 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0125388  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2708  response regulator receiver modulated CheW protein  31.92 
 
 
314 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.404736  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2633  putative CheW protein  31.92 
 
 
314 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0317026  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1752  response regulator receiver modulated CheW protein  31.92 
 
 
314 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0141626  hitchhiker  0.0048436 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1598  CheW protein  33.75 
 
 
317 aa  155  1e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.874814  normal  0.438592 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01327  chemotaxis protein CheV  31.67 
 
 
319 aa  154  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.750704  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2678  response regulator receiver modulated CheW protein  31.68 
 
 
312 aa  154  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0199239  normal  0.361965 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2144  CheW-like protein  31.13 
 
 
313 aa  154  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00213305  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1944  response regulator receiver modulated CheW protein  29.47 
 
 
314 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000211383  normal  0.0128896 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2032  chemotaxis protein CheV  29.97 
 
 
338 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00977151  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3396  putative CheW protein  33.1 
 
 
295 aa  152  8e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.591298  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0231  chemotaxis protein CheV  31.56 
 
 
313 aa  152  8.999999999999999e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3123  chemotaxis protein CheV  33.22 
 
 
299 aa  151  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3102  response regulator receiver modulated CheW protein  33.44 
 
 
306 aa  150  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.262439  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0735  response regulator receiver:CheW-like protein  31.63 
 
 
311 aa  149  4e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1372  response regulator receiver modulated CheW protein  32.88 
 
 
299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00980078 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1437  response regulator receiver modulated CheW protein  32.88 
 
 
299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.080472 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1425  response regulator receiver modulated CheW protein  32.88 
 
 
299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.419487  normal  0.0812955 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2493  putative CheW protein  33.45 
 
 
299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3225  response regulator receiver modulated CheW protein  31.27 
 
 
322 aa  147  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.185014  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3224  response regulator receiver modulated CheW protein  31.46 
 
 
319 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0658571  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1901  response regulator receiver modulated CheW protein  31.91 
 
 
314 aa  144  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0980501  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2708  response regulator receiver modulated CheW protein  30.1 
 
 
300 aa  143  3e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2201  chemotaxis protein CheV  32.42 
 
 
299 aa  143  4e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.865724 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2936  putative CheW protein  31.71 
 
 
298 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.243491 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2613  response regulator receiver modulated CheW protein  30.13 
 
 
325 aa  141  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2185  putative CheW protein  31.94 
 
 
297 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0845954  normal  0.0210169 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0841  response regulator receiver modulated CheW protein  32.41 
 
 
299 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1561  response regulator receiver modulated CheW protein  31.71 
 
 
298 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0294399  hitchhiker  0.00399966 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1457  response regulator receiver modulated CheW protein  32.53 
 
 
314 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4654  CheW protein  33.79 
 
 
300 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2899  response regulator receiver modulated CheW protein  33.1 
 
 
295 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.715975  hitchhiker  0.00931868 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2796  putative CheW protein  31.71 
 
 
298 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>