More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0244 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0244  glycine cleavage system H protein  100 
 
 		 116 aa  228  2e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0712  glycine cleavage system protein H  64.04 
 
 		 122 aa  155  2e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0736  glycine cleavage system protein H  64.04 
 
 		 122 aa  154  5.0000000000000005e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1738  glycine cleavage system protein H  62.83 
 
 		 122 aa  143  9e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000000301495  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1516  glycine cleavage system H protein  58.93 
 
 		 125 aa  138  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0307602  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0376  glycine cleavage system H protein  56.36 
 
 		 124 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0338  glycine cleavage system H protein  58.88 
 
 		 125 aa  128  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0357579  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0390  glycine cleavage system H protein  55.45 
 
 		 123 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.927773 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0396  glycine cleavage system H protein  54.55 
 
 		 123 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2210  glycine cleavage system H protein  50.91 
 
 		 121 aa  127  6e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.194358  normal  0.155334 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2200  glycine cleavage system protein H  50.89 
 
 		 125 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.330883 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4386  glycine cleavage system protein H  50.91 
 
 		 121 aa  125  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.548766  normal  0.706573 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0832  glycine cleavage system protein H  50.45 
 
 		 126 aa  124  6e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00486711  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0849  glycine cleavage system protein H  50.45 
 
 		 126 aa  124  6e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000024227  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01205  glycine cleavage system protein H  52.25 
 
 		 125 aa  123  7e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0862464  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0485  glycine cleavage system protein H  52.78 
 
 		 126 aa  122  1e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1285  glycine cleavage system protein H  47.71 
 
 		 121 aa  123  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.390609  normal  0.169764 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1732  glycine cleavage system protein H  47.71 
 
 		 121 aa  123  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5450  glycine cleavage system protein H  46.79 
 
 		 121 aa  122  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749655 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00862  glycine cleavage system protein H  52.68 
 
 		 129 aa  121  3e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1619  glycine cleavage system protein H  44.95 
 
 		 121 aa  121  4e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209831  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3739  glycine cleavage system protein H  46.79 
 
 		 121 aa  120  5e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0626114  normal  0.594072 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0689  glycine cleavage system protein H  46.36 
 
 		 125 aa  120  9e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.904294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1569  glycine cleavage system protein H  43.12 
 
 		 121 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108538 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2392  glycine cleavage system H protein  51.82 
 
 		 119 aa  119  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.368043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32847  glycine decarboxylase  46.73 
 
 		 157 aa  118  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0721  glycine cleavage system H protein  49.55 
 
 		 126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1020  glycine cleavage system protein H  55.77 
 
 		 120 aa  119  1.9999999999999998e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000891205  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3154  glycine cleavage system H protein  51.4 
 
 		 124 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2253  glycine cleavage system protein H  47.32 
 
 		 120 aa  119  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0487645  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  52.73 
 
 		 126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2673  glycine cleavage system H protein  50.47 
 
 		 124 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  49.11 
 
 		 126 aa  118  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0897  glycine cleavage system H protein  49.53 
 
 		 135 aa  118  3e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00473644  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3527  glycine cleavage system protein H  42.86 
 
 		 120 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.36925 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  47.22 
 
 		 126 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05972  glycine cleavage system protein H  52.68 
 
 		 126 aa  117  7e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6034  glycine cleavage system protein H  44.64 
 
 		 120 aa  116  9e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0418539  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  48.62 
 
 		 130 aa  116  9e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2684  glycine cleavage system H protein  47.32 
 
 		 123 aa  116  9e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.418167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1328  glycine cleavage system H protein  50.93 
 
 		 126 aa  116  9.999999999999999e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27674  predicted protein  46.79 
 
 		 134 aa  115  9.999999999999999e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1851  glycine cleavage system protein H  45.95 
 
 		 123 aa  116  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0324659  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1591  glycine cleavage system H protein  47.27 
 
 		 124 aa  115  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0734  glycine cleavage system protein H  46.43 
 
 		 124 aa  116  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.5619  normal  0.0299013 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0726  glycine cleavage system protein H  44.95 
 
 		 122 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0680  glycine cleavage system protein H  44.95 
 
 		 122 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0813  glycine cleavage system protein H  43.75 
 
 		 120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.388148  normal  0.22287 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0854  glycine cleavage system protein H  43.75 
 
 		 120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0728621  normal  0.0870942 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3863  glycine cleavage system protein H  44.95 
 
 		 122 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.394687  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1183  glycine cleavage system protein H  45.54 
 
 		 120 aa  115  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.157974  normal  0.140639 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1353  glycine cleavage system H protein  45.87 
 
 		 125 aa  114  3.9999999999999997e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0778  glycine cleavage system protein H  43.75 
 
 		 120 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.068818 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3300  glycine cleavage system H protein  46.43 
 
 		 123 aa  114  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906564  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3586  glycine cleavage system protein H  47.75 
 
 		 127 aa  114  6e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000166607  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1095  glycine cleavage system protein H  42.34 
 
 		 122 aa  114  6e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.171201  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1017  glycine cleavage system protein H  45.87 
 
 		 122 aa  114  6e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1244  glycine cleavage system protein H  48.62 
 
 		 128 aa  113  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3020  glycine cleavage system H protein  43.75 
 
 		 124 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.29213  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1867  glycine cleavage system H protein  45.54 
 
 		 122 aa  113  7.999999999999999e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0347749  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2869  glycine cleavage system protein H  53.06 
 
 		 129 aa  113  8.999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4814  glycine cleavage system protein H  46.85 
 
 		 127 aa  113  8.999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00016491  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1654  glycine cleavage system protein H  45.95 
 
 		 126 aa  112  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000233  glycine cleavage system H protein  51.79 
 
 		 126 aa  112  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0953  glycine cleavage system protein H  49.11 
 
 		 126 aa  112  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2715  glycine cleavage system protein H  47.71 
 
 		 128 aa  112  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2621  glycine cleavage system protein H  47.71 
 
 		 128 aa  112  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233728  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0623  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 130 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5135  glycine cleavage system protein H  46.85 
 
 		 127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00103553  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3072  glycine cleavage system protein H  51.82 
 
 		 131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.132267 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5130  glycine cleavage system protein H  46.85 
 
 		 127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365083  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4859  glycine cleavage system protein H  46.85 
 
 		 127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000908449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4700  glycine cleavage system protein H  46.85 
 
 		 127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4716  glycine cleavage system protein H  46.85 
 
 		 127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000916909  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5228  glycine cleavage system protein H  46.85 
 
 		 127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000143615  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5133  glycine cleavage system protein H  46.85 
 
 		 127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000135708  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3591  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.961592  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3436  glycine cleavage system protein H  49.09 
 
 		 135 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0839  glycine cleavage system protein H  49.11 
 
 		 130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5097  glycine cleavage system protein H  46.85 
 
 		 127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2720  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0615009  normal  0.778842 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3830  glycine cleavage system H protein  48.15 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.741858 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3298  glycine cleavage system H protein  43.75 
 
 		 129 aa  111  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.480249 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2836  glycine cleavage system H protein  43.36 
 
 		 120 aa  111  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000136421  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0105  glycine cleavage system protein H  46.85 
 
 		 127 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000835004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2523  glycine cleavage system protein H  46.79 
 
 		 127 aa  110  5e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.85836  normal  0.122501 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2036  glycine cleavage system protein H  47.22 
 
 		 129 aa  110  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  44.95 
 
 		 127 aa  110  5e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  49.48 
 
 		 126 aa  110  5e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0050  glycine cleavage system H protein  41.67 
 
 		 124 aa  110  5e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.968123  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3063  glycine cleavage system protein H  50.89 
 
 		 129 aa  110  6e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.210618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0834  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 129 aa  110  6e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1275  glycine cleavage system H protein  47.32 
 
 		 129 aa  110  8.000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.421201  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1890  glycine cleavage system protein H  44.64 
 
 		 120 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0467152  hitchhiker  0.00604337 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3302  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 129 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.13973  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1812  glycine cleavage system protein H  48.18 
 
 		 131 aa  110  8.000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2092  glycine cleavage system protein H  44.64 
 
 		 120 aa  110  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.206967  normal  0.370959 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3310  glycine cleavage system protein H  46.36 
 
 		 136 aa  110  9e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00460  glycine dehydrogenase (decarboxylating), putative  46.02 
 
 		 160 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.528435  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0811  glycine cleavage system protein H  46.36 
 
 		 130 aa  109  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.061834  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>