272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2490 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2490  dienelactone hydrolase  100 
 
 		 262 aa  532  1e-150  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.56422  normal  0.109355 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2018  dienelactone hydrolase  55.79 
 
 		 242 aa  280  1e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.426068  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2209  dienelactone hydrolase family protein  55.37 
 
 		 242 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.670258  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2775  dienelactone hydrolase  61.6 
 
 		 269 aa  271  9e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3677  hypothetical protein  56.07 
 
 		 241 aa  270  2e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1626  dienelactone hydrolase  54.62 
 
 		 242 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0197057 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43840  hypothetical protein  55.65 
 
 		 241 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1690  dienelactone hydrolase  52.48 
 
 		 241 aa  259  3e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0305937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3501  dienelactone hydrolase  52.48 
 
 		 241 aa  258  6e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.572778  normal  0.863924 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1015  dienelactone hydrolase  53.33 
 
 		 261 aa  257  1e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0264245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3749  dienelactone hydrolase  51.65 
 
 		 241 aa  257  1e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0499  dienelactone hydrolase  52.7 
 
 		 261 aa  257  1e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4178  dienelactone hydrolase  51.24 
 
 		 241 aa  254  8e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02015  dienelactone hydrolase  51.48 
 
 		 264 aa  246  3e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1920  dienelactone hydrolase  46.39 
 
 		 264 aa  216  2e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0694  dienelactone hydrolase  45.7 
 
 		 271 aa  217  2e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.115096  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2303  dienelactone hydrolase  46.01 
 
 		 264 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0014  dienelactone hydrolase  41.9 
 
 		 273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0661  dienelactone hydrolase  44.3 
 
 		 263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1093  dienelactone hydrolase  40.57 
 
 		 237 aa  182  6e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0163  dienelactone hydrolase  41.8 
 
 		 318 aa  182  7e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2592  hypothetical protein  37.66 
 
 		 238 aa  170  3e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0790  dienelactone hydrolase  39.38 
 
 		 269 aa  168  6e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2719  hypothetical protein  37.66 
 
 		 238 aa  168  7e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1497  dienelactone hydrolase  40.25 
 
 		 246 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4659  dienelactone hydrolase  36.4 
 
 		 257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1219  carboxymethylenebutenolidase  40.51 
 
 		 258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0189806  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0347  dienelactone hydrolase  38.31 
 
 		 262 aa  164  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.971139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1264  dienelactone hydrolase family protein  39.66 
 
 		 237 aa  163  3e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0914  dienelactone hydrolase  36.17 
 
 		 263 aa  160  1e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3134  dienelactone hydrolase  40.59 
 
 		 234 aa  160  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0587579  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2739  hypothetical protein  39.17 
 
 		 238 aa  159  4e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4242  dienelactone hydrolase  36.61 
 
 		 263 aa  159  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.194983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2350  dienelactone hydrolase  40.95 
 
 		 259 aa  159  6e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.722074  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1803  dienelactone hydrolase family protein  38.33 
 
 		 239 aa  158  1e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.100178  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0480  dienelactone hydrolase family protein  41.63 
 
 		 260 aa  157  1e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2536  dienelactone hydrolase family protein  41.86 
 
 		 270 aa  156  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1184  dienelactone hydrolase  37.45 
 
 		 265 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00788305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1196  dienelactone hydrolase  39.91 
 
 		 263 aa  154  9e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.372002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3711  dienelactone hydrolase  36.74 
 
 		 262 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138504 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1214  dienelactone hydrolase  37.08 
 
 		 263 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.602009  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2612  hypothetical protein  38.75 
 
 		 238 aa  154  2e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33270  Dienelactone hydrolase protein  35.5 
 
 		 261 aa  153  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.669671  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0425  dienelactone hydrolase  34.41 
 
 		 268 aa  151  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.18094  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1677  dienelactone hydrolase family protein  35.98 
 
 		 262 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4232  dienelactone hydrolase  36.33 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.215176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3611  dienelactone hydrolase  33.33 
 
 		 267 aa  150  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000690208  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1616  dienelactone hydrolase  40.37 
 
 		 263 aa  149  3e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.555158 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2163  dienelactone hydrolase  36.13 
 
 		 237 aa  147  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163998  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2218  dienelactone hydrolase  33.98 
 
 		 264 aa  147  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000562202  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1399  dienelactone hydrolase  35.66 
 
 		 250 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3656  dienelactone hydrolase  37.45 
 
 		 263 aa  144  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4214  hypothetical protein  37.83 
 
 		 262 aa  143  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1525  dienelactone hydrolase  37 
 
 		 241 aa  143  3e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4212  normal  0.461619 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0787  dienelactone hydrolase family protein  41 
 
 		 356 aa  142  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307266  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0612  dienelactone hydrolase family protein  41 
 
 		 243 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0597  dienelactone hydrolase family protein  41 
 
 		 243 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4080  dienelactone hydrolase  35.9 
 
 		 244 aa  135  8e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.240265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0501  dienelactone hydrolase family protein  39.33 
 
 		 242 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.821381  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0569  dienelactone hydrolase  32.64 
 
 		 267 aa  132  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000352652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0559  dienelactone hydrolase  32.67 
 
 		 265 aa  132  6.999999999999999e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49330  hypothetical protein  36.67 
 
 		 262 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.295044  normal  0.0937035 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1805  dienelactone hydrolase  31.36 
 
 		 245 aa  131  9e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.341986  normal  0.0741289 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1980  dienelactone hydrolase  39.36 
 
 		 245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.228213 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2281  dienelactone hydrolase  39.57 
 
 		 245 aa  130  3e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187081 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1245  dienelactone hydrolase  32.37 
 
 		 261 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00955102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4157  dienelactone hydrolase  36.09 
 
 		 237 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.138582  normal  0.0101627 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4133  dienelactone hydrolase  38.14 
 
 		 237 aa  123  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.850524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1370  dienelactone hydrolase  32.54 
 
 		 280 aa  122  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.591445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4947  dienelactone hydrolase  35.68 
 
 		 241 aa  119  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.316291  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3032  dienelactone hydrolase  34.91 
 
 		 296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.345773 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2104  dienelactone hydrolase  35.98 
 
 		 234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0464175  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0940  dienelactone hydrolase  30.33 
 
 		 279 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0170  dienelactone hydrolase  32.06 
 
 		 246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135133  normal  0.545513 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3045  dienelactone hydrolase  34.02 
 
 		 249 aa  112  6e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2621  dienelactone hydrolase  30.59 
 
 		 265 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2650  dienelactone hydrolase  30.59 
 
 		 265 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2665  dienelactone hydrolase  30.59 
 
 		 265 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.858071  normal  0.690988 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  31.72 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7419  hypothetical protein  33.17 
 
 		 234 aa  95.9  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.140169  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4373  dienelactone hydrolase  29.03 
 
 		 256 aa  91.7  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.68292 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46214  predicted protein  28.11 
 
 		 367 aa  75.9  0.0000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1898  Carboxymethylenebutenolidase  25.12 
 
 		 292 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.668e-17 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2003  dienelactone hydrolase  25.11 
 
 		 236 aa  70.9  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  27.39 
 
 		 248 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  27.88 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03717  predicted hydrolase  23.75 
 
 		 269 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4149  Carboxymethylenebutenolidase  23.37 
 
 		 271 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4054  dienelactone hydrolase family protein  23.37 
 
 		 271 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4351  dienelactone hydrolase family protein  23.75 
 
 		 271 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4206  dienelactone hydrolase family protein  25.68 
 
 		 269 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000877073 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5271  dienelactone hydrolase family protein  23.75 
 
 		 271 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.198587 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03666  hypothetical protein  23.83 
 
 		 267 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0548  carboxymethylenebutenolidase  28.7 
 
 		 235 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.833541 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2526  dienelactone hydrolase  30.24 
 
 		 248 aa  67  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.347045 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4178  carboxymethylenebutenolidase  23.75 
 
 		 271 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0221316 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  26.36 
 
 		 247 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  26.24 
 
 		 247 aa  66.2  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4294  dienelactone hydrolase  25.91 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4198  dienelactone hydrolase  25.91 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>