More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2266 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2266  cytochrome c, monohaem  100 
 
 		 336 aa  671    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.380948  normal  0.0167103 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11170  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit II  63.69 
 
 		 315 aa  363  2e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.761021  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1767  cytochrome c oxidase, subunit II  41.64 
 
 		 352 aa  245  9.999999999999999e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.204958  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4760  cytochrome c oxidase subunit II  43.57 
 
 		 327 aa  239  5e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.723293  normal  0.0836993 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1449  cytochrome c oxidase, subunit II  39.87 
 
 		 346 aa  230  3e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.015711 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6354  cytochrome c oxidase subunit II  40.62 
 
 		 334 aa  220  3e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2347  cytochrome c oxidase, subunit II  42.25 
 
 		 334 aa  215  9e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0118  cytochrome c oxidase, subunit IIC  37.89 
 
 		 324 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.134505  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1705  cytochrome c, monohaem  39.12 
 
 		 324 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.829367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2991  cytochrome c oxidase, subunit II  40.74 
 
 		 338 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336386  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0096  cytochrome c oxidase, subunit II  40.48 
 
 		 334 aa  212  7.999999999999999e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.296292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01475  chain II protein of putative cytochrome c oxidase  45.98 
 
 		 234 aa  212  9e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1754  cytochrome c, monohaem  37.27 
 
 		 324 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5502  cytochrome c oxidase, subunit II  41.06 
 
 		 370 aa  211  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.535121  normal  0.0572426 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2792  cytochrome c oxidase, subunit II  37.93 
 
 		 330 aa  211  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.625738  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5491  cytochrome c oxidase, subunit II  36.98 
 
 		 355 aa  209  5e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2183  putative cytochrome c oxidase polypeptide II precursor  37.97 
 
 		 338 aa  209  7e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0732382 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6572  cytochrome c, monohaem  41.83 
 
 		 352 aa  208  8e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.381109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6286  cytochrome c oxidase, subunit II  41.94 
 
 		 352 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.257472  normal  0.0263748 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6539  cytochrome c, monohaem  42.63 
 
 		 434 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.537411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1292  cytochrome c oxidase, subunit II  42.63 
 
 		 354 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493898  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0460  cytochrome c oxidase, subunit II  35.93 
 
 		 353 aa  204  1e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.354816  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2026  cytochrome c oxidase, subunit II  37.46 
 
 		 346 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000905775 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1993  cytochrome c oxidase, subunit II  42.95 
 
 		 314 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0975891  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6146  cytochrome c oxidase, subunit II  41.35 
 
 		 353 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870856  normal  0.304247 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0167  putative cytochrome c oxidase subunit II  37.5 
 
 		 371 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.26265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3379  cytochrome c oxidase, subunit II  47.51 
 
 		 318 aa  199  5e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0771  cytochrome c oxidase, subunit II  38.64 
 
 		 381 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0315373  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0945  cytochrome oxidase subunit II  37.58 
 
 		 372 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.891376  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5244  cytochrome c oxidase, subunit II  37.62 
 
 		 326 aa  197  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0788277  normal  0.868201 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0783  cytochrome c oxidase, subunit II  38.66 
 
 		 372 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0079  putative cytochrome c oxidase subunit II  37.94 
 
 		 342 aa  195  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.917681  hitchhiker  0.00234837 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  35.69 
 
 		 367 aa  194  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5826  cytochrome c oxidase, subunit II  45.45 
 
 		 330 aa  194  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  35.85 
 
 		 370 aa  190  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4792  cytochrome c oxidase, subunit II  36.25 
 
 		 354 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280165  normal  0.517537 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3540  cytochrome c oxidase, subunit II  36.54 
 
 		 311 aa  188  1e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2313  cytochrome c oxidase, subunit II  43.22 
 
 		 244 aa  182  8.000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.210732  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0697  cytochrome c oxidase, subunit II  43.52 
 
 		 322 aa  181  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3892  cytochrome c oxidase subunit II  36.98 
 
 		 345 aa  175  8e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.740774  normal  0.178097 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3849  cytochrome c oxidase, subunit II  43.98 
 
 		 235 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.26025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0156  cytochrome c oxidase, subunit II  46.26 
 
 		 232 aa  170  4e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0104  cytochrome c oxidase subunit II  31.59 
 
 		 359 aa  169  6e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.100023  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0628  cytochrome c oxidase, subunit II  32.56 
 
 		 351 aa  168  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0563  cytochrome c oxidase subunit II  40.43 
 
 		 394 aa  167  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3856  cytochrome c oxidase subunit II  30.86 
 
 		 349 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.15254  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3687  cytochrome c oxidase, subunit II  30.86 
 
 		 349 aa  157  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3704  cytochrome c oxidase, subunit II  30.86 
 
 		 349 aa  157  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.136015  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4062  cytochrome c oxidase, subunit II  30.86 
 
 		 349 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4154  cytochrome c oxidase subunit II  30.86 
 
 		 349 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3959  cytochrome c oxidase, subunit II  30.86 
 
 		 349 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3991  cytochrome c oxidase, subunit II  30.56 
 
 		 349 aa  156  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3098  QoxB, quinol oxidase subunit II  42.29 
 
 		 261 aa  156  4e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4046  cytochrome c oxidase, subunit II  30.86 
 
 		 349 aa  156  6e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1193  cytochrome c oxidase, subunit II  30.86 
 
 		 349 aa  155  6e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0709  cytochrome c oxidase subunit II  33.33 
 
 		 355 aa  155  7e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.669005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3770  cytochrome c oxidase subunit II  31.06 
 
 		 349 aa  155  8e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2072  cytochrome c oxidase, subunit II  30.89 
 
 		 425 aa  154  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54281 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2646  cytochrome c oxidase subunit II  29.74 
 
 		 349 aa  149  5e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0991495  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0407  cytochrome c oxidase, subunit II  31.74 
 
 		 435 aa  143  4e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3825  cytochrome c oxidase, subunit II  42.13 
 
 		 189 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.495822 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  30.38 
 
 		 316 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1855  cytochrome c oxidase, subunit II  31.47 
 
 		 356 aa  134  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3668  cytochrome-c oxidase  38.39 
 
 		 378 aa  133  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.253259  normal  0.882679 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0983  cytochrome c oxidase, subunit II  31.42 
 
 		 356 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  28.53 
 
 		 330 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1588  cytochrome c oxidase, subunit II  37.02 
 
 		 342 aa  119  6e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2996  cytochrome c oxidase, subunit II  29.68 
 
 		 329 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.941612  hitchhiker  0.00487692 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.304556 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2275  cytochrome c oxidase, subunit II  31.13 
 
 		 337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.869151  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  31.13 
 
 		 314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1600  cytochrome c oxidase, subunit II  30.59 
 
 		 337 aa  112  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1676  cytochrome c oxidase, subunit II  30.59 
 
 		 337 aa  112  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06272  cytochrome c oxidase, subunit II  26.02 
 
 		 405 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3523  quinol oxidase AA3, subunit II  29.55 
 
 		 301 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3587  cytochrome c oxidase, subunit II  31.58 
 
 		 279 aa  110  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.677515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3263  cytochrome c oxidase, subunit II  31.58 
 
 		 279 aa  110  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.571759  normal  0.256995 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0255  cytochrome-c oxidase  31.22 
 
 		 285 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3463  cytochrome-c oxidase  31.22 
 
 		 285 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0954  ubiquinol oxidase, subunit II  30.17 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3459  cytochrome c oxidase, subunit II  33.17 
 
 		 279 aa  108  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.927042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1348  cytochrome c, monohaem  29.13 
 
 		 426 aa  108  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.195405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1877  ubiquinol oxidase, subunit II  31.06 
 
 		 350 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.209329 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0851  cytochrome c oxidase, subunit II  28.57 
 
 		 350 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0855  cytochrome c oxidase, subunit II  28.57 
 
 		 350 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1548  ubiquinol oxidase, subunit II  31.06 
 
 		 350 aa  106  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.45181  normal  0.18234 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0033  cytochrome c oxidase, subunit II  27.23 
 
 		 279 aa  106  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.979273  normal  0.511366 
 
 
-
 
NC_002978  WD0300  cytochrome c oxidase, subunit II  32.41 
 
 		 254 aa  106  7e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0658  cytochrome C oxidase subunit II transmembrane region  28.1 
 
 		 279 aa  105  8e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.508316  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0260  cytochrome c oxidase, subunit II  32.62 
 
 		 288 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.150091  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0223  cytochrome c oxidase, subunit II  30.59 
 
 		 285 aa  105  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0761  cytochrome c oxidase, subunit II  30.59 
 
 		 285 aa  105  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2349  cytochrome c oxidase, subunit II  32.98 
 
 		 285 aa  105  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159121  normal  0.911923 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1471  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  27.8 
 
 		 401 aa  104  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3011  Cytochrome-c oxidase  27.7 
 
 		 380 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.913445  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1538  cytochrome c oxidase, subunit II  29.88 
 
 		 399 aa  103  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5608  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  28.92 
 
 		 349 aa  103  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2489  cytochrome c oxidase, subunit II  30.57 
 
 		 243 aa  103  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.500427  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0036  cytochrome c oxidase, subunit II  27.15 
 
 		 378 aa  103  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2071  ubiquinol oxidase, subunit II  31.91 
 
 		 295 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.741779  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>