135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0079 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0079  orotidine 5'-phosphate decarboxylase subfamily protein  100 
 
 
274 aa  557  1e-158  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000192992  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0088  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  74.09 
 
 
279 aa  415  1e-115  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0082  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  69.34 
 
 
274 aa  405  1e-112  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2677  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  67.88 
 
 
274 aa  394  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0124  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  67.88 
 
 
274 aa  393  1e-108  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0101  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  65.33 
 
 
274 aa  389  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0006  orotidine 5'-phosphate decarboxylase subfamily protein  64.75 
 
 
280 aa  371  1e-102  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2698  orotidine 5' phosphate decarboxylase  52.14 
 
 
274 aa  249  2e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0183887  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13603  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  50.21 
 
 
274 aa  231  8e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2230  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  48.09 
 
 
274 aa  231  9e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.332513 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2322  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  48.95 
 
 
273 aa  229  3e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1970  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  47.04 
 
 
272 aa  229  4e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0476362  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2966  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  48.12 
 
 
274 aa  222  4e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0073  orotidine 5'-monophosphate decarboxylase  49.79 
 
 
276 aa  221  7e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0435  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  49.59 
 
 
279 aa  219  4e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.514449  normal  0.571146 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3069  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  46.27 
 
 
276 aa  219  6e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.201112  hitchhiker  0.00274028 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_12  orotidine 5-prime-phosphate decarboxylase  50 
 
 
270 aa  218  1e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0012  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  49.57 
 
 
270 aa  216  3e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.50788  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0013  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  46.74 
 
 
270 aa  210  2e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1293  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  49.17 
 
 
264 aa  210  2e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1444  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  43.78 
 
 
267 aa  205  5e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  5.34867e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0197  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  45 
 
 
283 aa  192  3e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1975  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  45.3 
 
 
272 aa  192  4e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.568621  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2203  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  45.83 
 
 
266 aa  190  2e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1801  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  45.15 
 
 
273 aa  188  7e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.293438 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4349  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  43.48 
 
 
272 aa  188  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0751763  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1586  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  42.91 
 
 
276 aa  188  1e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00897859 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0190  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.43 
 
 
272 aa  181  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  3.50723e-06  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0923  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.79 
 
 
284 aa  177  2e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.318929  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2851  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.44 
 
 
302 aa  175  9e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3018  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.6 
 
 
271 aa  172  5e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.397504 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2608  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.17 
 
 
283 aa  172  5e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.23667  normal  0.693787 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0552  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.32 
 
 
271 aa  169  6e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.655653 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3050  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.77 
 
 
272 aa  167  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3404  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.46 
 
 
271 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0610032  normal  0.088058 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2609  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.83 
 
 
271 aa  166  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2773  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.43 
 
 
288 aa  166  4e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.350308 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1223  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.71 
 
 
264 aa  165  8e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.665288  normal  0.0822909 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4108  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.08 
 
 
284 aa  162  4e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.80823e-07 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3450  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.7 
 
 
270 aa  162  4e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.799758  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0957  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  34.23 
 
 
477 aa  162  6e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.434428  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3478  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.31 
 
 
275 aa  161  8e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3304  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.31 
 
 
275 aa  161  8e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3443  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.31 
 
 
275 aa  161  8e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1261  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.31 
 
 
275 aa  161  8e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0401  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.31 
 
 
275 aa  161  8e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.46828  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2481  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.31 
 
 
275 aa  161  8e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0575744  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3481  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.31 
 
 
275 aa  161  8e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.959289  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0551  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.52 
 
 
275 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.771334  normal  0.817763 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3708  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.09 
 
 
275 aa  161  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0899629  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0527  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.52 
 
 
275 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2759  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.09 
 
 
275 aa  160  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.499942 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0594  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.09 
 
 
275 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.165873 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0626  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.09 
 
 
275 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.260961  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0143  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.09 
 
 
275 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4616  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.98 
 
 
285 aa  158  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1184  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.77 
 
 
275 aa  158  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1816  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.93 
 
 
307 aa  157  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00211539  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0825  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.24 
 
 
274 aa  156  4e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4696  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.66 
 
 
274 aa  154  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3625  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.55 
 
 
278 aa  153  3e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.313315  normal  0.3554 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3843  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.59 
 
 
282 aa  153  3e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.181506  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3403  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.82 
 
 
288 aa  151  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.57419  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4058  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.89 
 
 
306 aa  150  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.186048  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3776  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.28 
 
 
287 aa  150  3e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1199  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.16 
 
 
287 aa  148  9e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0530325  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1384  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.16 
 
 
287 aa  147  1e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.675621  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0824  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.97 
 
 
275 aa  148  1e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0219  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.86 
 
 
281 aa  146  4e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5082  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.3 
 
 
274 aa  144  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09390  Orotidine-5'-phosphate decarboxylase  34.63 
 
 
311 aa  142  5e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00166281  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0783  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.7 
 
 
287 aa  142  6e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2296  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  33.61 
 
 
479 aa  141  1e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2347  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  33.61 
 
 
479 aa  141  1e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.159703  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1671  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  34.24 
 
 
482 aa  140  2e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0240  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  32.86 
 
 
281 aa  140  2e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0659  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.02 
 
 
289 aa  140  3e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.102908  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0925  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  33.12 
 
 
347 aa  138  1e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1075  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.82 
 
 
274 aa  135  7e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_56623  predicted protein  37.55 
 
 
513 aa  134  2e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.329951  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1377  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  31.62 
 
 
305 aa  126  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0531  Orotidine-5'-phosphate decarboxylase  37.61 
 
 
317 aa  122  6e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0951  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  31.63 
 
 
314 aa  119  5e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2071  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.86 
 
 
258 aa  117  2e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2713  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.84 
 
 
259 aa  117  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.790129 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0882  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  32.21 
 
 
309 aa  115  1e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  4.14792e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2904  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  32.97 
 
 
320 aa  112  7e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0614  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  33.59 
 
 
312 aa  109  4e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0376  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  30.83 
 
 
500 aa  109  6e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2110  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  32.4 
 
 
300 aa  100  3e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1852  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.22 
 
 
278 aa  98.2  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2261  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.59 
 
 
288 aa  97.1  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.691248  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0953  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  32.26 
 
 
359 aa  97.1  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0377509  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3000  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.48 
 
 
286 aa  95.5  9e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.137742 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14780  orotidine 5'-phosphate decarboxylase, subfamily 2  34.11 
 
 
279 aa  93.2  4e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1859  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  32.89 
 
 
278 aa  93.2  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4272  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  32.06 
 
 
279 aa  91.3  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.279827  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1998  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.53 
 
 
290 aa  90.1  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.49069e-08 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1713  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  33.89 
 
 
286 aa  89.4  6e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0351669  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2665  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.21 
 
 
277 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.907231  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>