More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2382 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_2382  sulfatase  100 
 
 
488 aa  1019    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.285521  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3852  sulfatase  43.38 
 
 
468 aa  374  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0345  sulfatase  42.89 
 
 
474 aa  356  5.999999999999999e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00158762  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4501  sulfatase  41.99 
 
 
481 aa  354  2e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.930305  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1327  sulfatase  39.5 
 
 
480 aa  341  2e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.499609  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6288  sulfatase  40.49 
 
 
523 aa  338  1.9999999999999998e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.44956 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2166  sulfatase  38.38 
 
 
497 aa  322  9.000000000000001e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.696706  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3661  sulfatase  40.76 
 
 
500 aa  316  6e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0317755  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1638  sulfatase  38.46 
 
 
457 aa  301  2e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.132093 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3296  sulfatase  36.46 
 
 
460 aa  292  1e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0308085  hitchhiker  0.000582836 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3373  sulfatase  39.39 
 
 
481 aa  289  7e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1497  sulfatase  34.37 
 
 
536 aa  274  3e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.139846  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0491  sulfatase  37.04 
 
 
500 aa  253  5.000000000000001e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.244971 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0953  sulfatase  33.01 
 
 
1414 aa  228  2e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.462358  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0451  sulfatase  32.28 
 
 
719 aa  217  2.9999999999999998e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1213  sulfatase  33.05 
 
 
487 aa  211  3e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.255178  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2602  sulfatase  31.39 
 
 
452 aa  210  5e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2941  sulfatase  31.56 
 
 
480 aa  210  6e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.515365 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0740  sulfatase  31.5 
 
 
440 aa  207  3e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0936  sulfatase  32.15 
 
 
479 aa  204  2e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3913  sulfatase  30.43 
 
 
522 aa  204  2e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.656698  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2738  sulfatase  33.19 
 
 
466 aa  202  9.999999999999999e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.846304  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3501  sulfatase  31.35 
 
 
506 aa  202  9.999999999999999e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.486843  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3949  sulfatase  34.56 
 
 
470 aa  198  2.0000000000000003e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.184377  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4240  twin-arginine translocation pathway signal  32.96 
 
 
457 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615359  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0785  sulfatase  30.62 
 
 
472 aa  197  3e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6289  sulfatase  31.38 
 
 
486 aa  197  3e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.235101 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0360  Steryl-sulfatase  32.24 
 
 
553 aa  196  8.000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6052  sulfatase  31.97 
 
 
453 aa  196  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3640  sulfatase  30.13 
 
 
520 aa  191  2e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1881  sulfatase  32.78 
 
 
490 aa  191  2.9999999999999997e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1353  n-acetylgalactosamine-6-sulfate sulfatase  31.83 
 
 
471 aa  189  1e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0725989  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2379  sulfatase  32.17 
 
 
470 aa  188  2e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8255  sulfatase  31.67 
 
 
482 aa  188  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229678  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1516  sulfatase  29.94 
 
 
553 aa  186  8e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.943825  normal  0.893122 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0038  sulfatase  30.85 
 
 
497 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5404  sulfatase  33.4 
 
 
457 aa  185  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.268396  normal  0.742595 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0895  sulfatase  30.16 
 
 
471 aa  184  3e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281969  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0555  sulfatase  29.96 
 
 
486 aa  184  4.0000000000000006e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1131  sulfatase  30.71 
 
 
551 aa  183  5.0000000000000004e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2294  sulfatase  32.76 
 
 
442 aa  182  9.000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.434198  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3577  sulfatase  32.52 
 
 
438 aa  181  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176651  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0040  sulfatase  31.22 
 
 
497 aa  179  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.843312  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0039  sulfatase  31.22 
 
 
497 aa  179  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.225946 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0040  sulfatase  31.22 
 
 
497 aa  179  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.872346  normal  0.13967 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0038  sulfatase  31.22 
 
 
497 aa  179  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292867  hitchhiker  0.00560398 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4498  sulfatase  28.63 
 
 
462 aa  179  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.697848  normal  0.704843 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0889  sulfatase  29.42 
 
 
500 aa  179  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00184444  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2890  sulfatase  28.98 
 
 
523 aa  178  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0296  sulfatase  33.7 
 
 
442 aa  178  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0474  sulfatase  31.93 
 
 
491 aa  177  3e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3047  sulfatase  28.33 
 
 
503 aa  177  4e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0209579 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4466  sulfatase  31.97 
 
 
453 aa  177  5e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0640965 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4652  sulfatase  29.76 
 
 
551 aa  177  6e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1776  sulfatase  29.53 
 
 
520 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.791288 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4692  sulfatase  31.95 
 
 
491 aa  174  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.66699 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3999  sulfatase  27.56 
 
 
467 aa  173  5.999999999999999e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0015  sulfatase  31.07 
 
 
497 aa  173  5.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.689426  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4261  sulfatase  29.78 
 
 
506 aa  171  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.362858 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2674  sulfatase  30.31 
 
 
559 aa  172  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.687796  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1449  sulfatase  31.03 
 
 
495 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.499056  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2831  sulfatase  28.44 
 
 
440 aa  171  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0404074 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2850  sulfatase  28.04 
 
 
563 aa  171  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00796001  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0121  sulfatase  28.68 
 
 
526 aa  170  5e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3436  sulfatase  30.59 
 
 
462 aa  170  7e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4996  sulfatase  29.64 
 
 
506 aa  169  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.317023 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0302  sulfatase  30.52 
 
 
543 aa  168  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.139649 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0571  sulfatase  30.3 
 
 
517 aa  167  2.9999999999999998e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0440  sulfatase  30.02 
 
 
505 aa  166  5.9999999999999996e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0138449  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4650  sulfatase  27.46 
 
 
539 aa  166  8e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3801  sulfatase  28.51 
 
 
453 aa  166  9e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00499822  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0354  sulfatase  27.79 
 
 
493 aa  165  2.0000000000000002e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5003  sulfatase  27.75 
 
 
533 aa  165  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3660  sulfatase  29.63 
 
 
523 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000523129  normal  0.837026 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1520  sulfatase  31.6 
 
 
631 aa  164  4.0000000000000004e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2849  sulfatase  29.03 
 
 
503 aa  163  8.000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000585259  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3659  sulfatase  30.84 
 
 
484 aa  161  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000330438  normal  0.826759 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2743  sulfatase  27.38 
 
 
581 aa  161  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1568  sulfatase  28.95 
 
 
638 aa  161  2e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0365787  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2408  sulfatase  27.18 
 
 
548 aa  160  4e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.387467  hitchhiker  0.00012242 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2657  sulfatase  29.23 
 
 
519 aa  160  5e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1182  sulfatase  28.92 
 
 
465 aa  160  6e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3374  sulfatase  28.3 
 
 
507 aa  160  6e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  30.8 
 
 
501 aa  160  6e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3115  cerebroside-sulfatase  32.49 
 
 
440 aa  157  4e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100154  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3375  sulfatase  27.41 
 
 
571 aa  157  6e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.590124 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1030  sulfatase  28.54 
 
 
470 aa  155  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3980  Cerebroside-sulfatase  29.32 
 
 
458 aa  155  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2065  sulfatase  28.79 
 
 
542 aa  155  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0577602 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3650  sulfatase  27.46 
 
 
482 aa  154  4e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00127194  decreased coverage  0.00847064 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2052  sulfatase  28.21 
 
 
543 aa  153  8e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430392  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1842  sulfatase  27.02 
 
 
526 aa  152  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3662  sulfatase  27.66 
 
 
637 aa  151  3e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.33998  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3654  sulfatase  28.78 
 
 
489 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0466355 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0820  sulfatase  27.97 
 
 
627 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3142  sulfatase  31.98 
 
 
524 aa  149  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.854728  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3985  sulfatase  29.27 
 
 
478 aa  148  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.135566  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0881  sulfatase  28.54 
 
 
510 aa  147  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.789189  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3903  arylsulfatase  27.24 
 
 
563 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313687  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2364  sulfatase family protein  27.16 
 
 
492 aa  146  9e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.027189  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>