More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0468 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0468  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 357 aa  716    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1704  transcriptional regulator, AraC family  49.69 
 
 		 362 aa  291  1e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2518  transcriptional regulator, AraC family  47.38 
 
 		 336 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.179818 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2046  AraC family transcriptional regulator  49.54 
 
 		 324 aa  286  4e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2657  AraC family transcriptional regulator  49.54 
 
 		 324 aa  286  4e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0449258  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  46.47 
 
 		 336 aa  285  7e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5985  transcriptional regulator  49.54 
 
 		 334 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0571562 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2686  AraC family transcriptional regulator  49.24 
 
 		 324 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  48.92 
 
 		 322 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  49.4 
 
 		 338 aa  280  2e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2704  AraC family transcriptional regulator  48.47 
 
 		 322 aa  280  4e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.561895  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1312  transcriptional regulator, AraC family  48.8 
 
 		 338 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00374343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2578  AraC family transcriptional regulator  48.77 
 
 		 322 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5675  transcriptional regulator, AraC family  50.31 
 
 		 320 aa  267  2e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5819  transcriptional regulator  46.59 
 
 		 338 aa  266  5.999999999999999e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321081  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3442  putative transcriptional regulator  45.45 
 
 		 334 aa  261  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0513  AraC family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 387 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1836  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 327 aa  259  6e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3465  transcriptional regulator  44.21 
 
 		 341 aa  258  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  45.94 
 
 		 319 aa  257  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1581  transcriptional regulator  44.75 
 
 		 335 aa  256  4e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40600  putative transcriptional regulator  44.85 
 
 		 334 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1652  AraC family transcriptional regulator  48.61 
 
 		 327 aa  253  3e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5976  transcriptional regulator  43.6 
 
 		 325 aa  252  6e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557743  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1848  transcriptional regulator, AraC family  49.38 
 
 		 338 aa  252  9.000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2640  AraC family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 329 aa  251  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0741  AraC family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 321 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.885746 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0861  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  43.11 
 
 		 344 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0865  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  43.11 
 
 		 344 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1645  transcriptional regulator AraC family  47.43 
 
 		 327 aa  250  3e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1023  AraC family transcription regulator  43.83 
 
 		 345 aa  250  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.243872  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0685  AraC family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 344 aa  250  3e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5267  AraC family transcriptional regulator  44.27 
 
 		 320 aa  249  6e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.589428 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0323  AraC family transcriptional regulator  42.81 
 
 		 344 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0069  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  42.81 
 
 		 344 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2455  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  42.81 
 
 		 344 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0621  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  42.81 
 
 		 344 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.627949  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5992  AraC family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 348 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728993  normal  0.755382 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2196  transcriptional regulator  45.32 
 
 		 334 aa  247  2e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5796  transcriptional regulator, AraC family  47.5 
 
 		 317 aa  246  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5748  AraC family transcriptional regulator  44.97 
 
 		 321 aa  246  6e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.389978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5842  AraC family transcriptional regulator  44.97 
 
 		 321 aa  246  6e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.770334  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6209  AraC family transcriptional regulator  44.97 
 
 		 321 aa  246  6e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677646 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0747  AraC family transcriptional regulator  44.41 
 
 		 321 aa  245  9e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.46918  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0761  AraC family transcriptional regulator  44.41 
 
 		 321 aa  245  9e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321335  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6612  transcriptional regulator  44.51 
 
 		 341 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3129  transcriptional regulator, AraC family  43.53 
 
 		 328 aa  243  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4319  AraC family transcriptional regulator  45.68 
 
 		 324 aa  243  3e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6979  transcriptional regulator, AraC family  45.31 
 
 		 319 aa  242  6e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3004  transcriptional regulator  44.86 
 
 		 319 aa  242  7e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000291789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6685  AraC family transcriptional regulator  44.65 
 
 		 321 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  0.261527 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0268  AraC family transcriptional regulator  47.38 
 
 		 346 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0231  AraC family transcriptional regulator  47.38 
 
 		 343 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0955  DarR  47.38 
 
 		 369 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2526  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  47.38 
 
 		 369 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374888  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1610  AraC family transcriptional regulator  47.38 
 
 		 346 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2667  DarR  47.38 
 
 		 374 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1414  AraC family transcriptional regulator  47.38 
 
 		 346 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2747  transcriptional regulator  43.25 
 
 		 338 aa  241  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4246  AraC family transcriptional regulator  44.06 
 
 		 319 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3465  transcriptional regulator, AraC family  44.38 
 
 		 327 aa  238  9e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1088  transcriptional regulator, AraC family  42.5 
 
 		 332 aa  238  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1008  Fis family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 346 aa  238  1e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254492 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0160  transcriptional regulator, AraC family  47.22 
 
 		 323 aa  238  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3263  transcriptional regulator  44.51 
 
 		 322 aa  237  3e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0573  transcriptional regulator  42.77 
 
 		 342 aa  236  4e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0972711  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2287  transcriptional regulator, AraC family  45.11 
 
 		 328 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322568  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5330  AraC family transcriptional regulator  43.03 
 
 		 325 aa  235  7e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0697804 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1145  AraC family transcriptional regulator  46.86 
 
 		 326 aa  235  8e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.480921  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3225  transcriptional regulator, AraC family  44.87 
 
 		 322 aa  235  9e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.448526 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0972  AraC family transcriptional regulator  44.58 
 
 		 336 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5829  AraC family transcriptional regulator  43.79 
 
 		 338 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6950  transcriptional regulator  45.54 
 
 		 310 aa  233  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591911  normal  0.520078 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  43.67 
 
 		 338 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2808  transcriptional regulator, AraC family  38.27 
 
 		 330 aa  233  5e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.627946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0493  AraC family transcriptional regulator  44.05 
 
 		 315 aa  232  9e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1070  transcriptional regulator  43.4 
 
 		 331 aa  229  4e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2043  transcriptional regulator, AraC family  43.6 
 
 		 330 aa  230  4e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437  normal  0.109712 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2164  transcriptional regulator  43.32 
 
 		 340 aa  229  5e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.124166  normal  0.0201995 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5148  AraC family transcriptional regulator  44.98 
 
 		 328 aa  229  6e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0642429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1034  transcriptional regulator, AraC family  44.04 
 
 		 316 aa  229  6e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0108866  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5085  transcriptional regulator, AraC family  39.88 
 
 		 358 aa  229  7e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145128  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4716  transcriptional regulator, AraC family  42.06 
 
 		 341 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0152  transcriptional regulator, AraC family  45.03 
 
 		 318 aa  228  2e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.143566 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1295  AraC family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 317 aa  227  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4475  transcriptional regulator  43.73 
 
 		 311 aa  227  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00072916 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0776  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  43.96 
 
 		 321 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0731  transcriptional regulator  39.12 
 
 		 349 aa  228  2e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1772  AraC family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 321 aa  227  3e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2061  AraC family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 321 aa  227  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.284962  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1055  AraC family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 321 aa  227  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3889  transcriptional regulator, AraC family  45.11 
 
 		 311 aa  226  3e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1481  transcriptional regulator, AraC family  43.75 
 
 		 321 aa  226  3e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0687  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  43.96 
 
 		 321 aa  227  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4002  transcriptional regulator, AraC family  45.11 
 
 		 311 aa  226  3e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.474244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0762  AraC family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 321 aa  227  3e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1844  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 326 aa  226  4e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2121  transcriptional regulator, AraC family  39.62 
 
 		 341 aa  225  8e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2886  AraC family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 322 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0162981  normal  0.0527553 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0113  transcriptional regulator, AraC family  38.89 
 
 		 354 aa  225  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>