More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0262 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0262  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 310 aa  613  9.999999999999999e-175  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0975  methionyl-tRNA formyltransferase  64.45 
 
 		 306 aa  379  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.569216  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1034  methionyl-tRNA formyltransferase  64.45 
 
 		 306 aa  379  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.79271  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1345  methionyl-tRNA formyltransferase  63.46 
 
 		 306 aa  376  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4239  methionyl-tRNA formyltransferase  62.18 
 
 		 310 aa  365  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.856785  decreased coverage  0.00163892 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4748  methionyl-tRNA formyltransferase  60.9 
 
 		 310 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130868  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2577  methionyl-tRNA formyltransferase  59.87 
 
 		 308 aa  352  4e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4212  hitchhiker  0.000000800769 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0446  methionyl-tRNA formyltransferase  60.65 
 
 		 311 aa  352  5e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0642  methionyl-tRNA formyltransferase  64.03 
 
 		 297 aa  351  1e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.183207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4568  methionyl-tRNA formyltransferase  59.55 
 
 		 312 aa  350  2e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7336  methionyl-tRNA formyltransferase  58.31 
 
 		 311 aa  347  1e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.685492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0393  methionyl-tRNA formyltransferase  58.96 
 
 		 311 aa  346  2e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3304  methionyl-tRNA formyltransferase  61.56 
 
 		 307 aa  345  6e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0607232  normal  0.664052 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0181  methionyl-tRNA formyltransferase  62.71 
 
 		 299 aa  338  5e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.142178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1599  methionyl-tRNA formyltransferase  57.88 
 
 		 309 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0493449 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0080  methionyl-tRNA formyltransferase  56.31 
 
 		 310 aa  336  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.450016  normal  0.0632026 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3147  methionyl-tRNA formyltransferase  56.59 
 
 		 313 aa  335  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  0.377579 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0055  methionyl-tRNA formyltransferase  58.14 
 
 		 311 aa  335  7e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000555853 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0674  methionyl-tRNA formyltransferase  55.81 
 
 		 312 aa  334  1e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0541  methionyl-tRNA formyltransferase  54.78 
 
 		 320 aa  333  3e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.743734  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0151  methionyl-tRNA formyltransferase  59.48 
 
 		 302 aa  332  5e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.338305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0875  methionyl-tRNA formyltransferase  59.15 
 
 		 302 aa  331  9e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0469  methionyl-tRNA formyltransferase  57.52 
 
 		 301 aa  330  1e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2535  methionyl-tRNA formyltransferase  59.15 
 
 		 302 aa  329  3e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.614949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1320  methionyl-tRNA formyltransferase  55.81 
 
 		 309 aa  328  6e-89  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0058  methionyl-tRNA formyltransferase  55.37 
 
 		 311 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.820848  normal  0.0373513 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3694  methionyl-tRNA formyltransferase  59.34 
 
 		 310 aa  327  1.0000000000000001e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0626  methionyl-tRNA formyltransferase  54.05 
 
 		 310 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.274146  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3065  methionyl-tRNA formyltransferase  55.34 
 
 		 314 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38579  normal  0.372111 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0806  methionyl-tRNA formyltransferase  58.03 
 
 		 310 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.283838 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1635  methionyl-tRNA formyltransferase  56.68 
 
 		 309 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.138536  normal  0.117912 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0075  methionyl-tRNA formyltransferase  55.05 
 
 		 311 aa  323  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.716754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1129  methionyl-tRNA formyltransferase  60.6 
 
 		 312 aa  323  3e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158103 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1917  methionyl-tRNA formyltransferase  56.03 
 
 		 309 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.741308  normal  0.233989 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0497  methionyl-tRNA formyltransferase  56.91 
 
 		 317 aa  317  2e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.12463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2894  methionyl-tRNA formyltransferase  56.03 
 
 		 301 aa  314  9.999999999999999e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3351  methionyl-tRNA formyltransferase  56.45 
 
 		 309 aa  311  9e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4042  methionyl-tRNA formyltransferase  55.73 
 
 		 308 aa  310  2e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  55.84 
 
 		 307 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0347  methionyl-tRNA formyltransferase  53.14 
 
 		 305 aa  301  9e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.342124  normal  0.0280325 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0249  methionyl-tRNA formyltransferase  52.06 
 
 		 306 aa  296  3e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.153512 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0410  methionyl-tRNA formyltransferase  53.82 
 
 		 301 aa  287  1e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  48.51 
 
 		 308 aa  285  5.999999999999999e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  48.08 
 
 		 311 aa  283  2.0000000000000002e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0090  methionyl-tRNA formyltransferase  49.37 
 
 		 314 aa  281  9e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0186427  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2096  methionyl-tRNA formyltransferase  49.37 
 
 		 314 aa  281  9e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156857  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0310  methionyl-tRNA formyltransferase  50.16 
 
 		 328 aa  280  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0186  methionyl-tRNA formyltransferase  49.03 
 
 		 308 aa  280  2e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823971 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0094  methionyl-tRNA formyltransferase  52.56 
 
 		 320 aa  280  2e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.922112  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  48.67 
 
 		 315 aa  279  4e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  48.67 
 
 		 315 aa  279  4e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  48.67 
 
 		 315 aa  279  4e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  48.67 
 
 		 315 aa  279  4e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  48.67 
 
 		 315 aa  279  4e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3584  methionyl-tRNA formyltransferase  53.31 
 
 		 307 aa  279  5e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  48.33 
 
 		 315 aa  279  5e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  48.67 
 
 		 315 aa  278  6e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3064  methionyl-tRNA formyltransferase  50.93 
 
 		 327 aa  278  7e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0284  methionyl-tRNA formyltransferase  52.44 
 
 		 315 aa  277  1e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0176978 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3181  methionyl-tRNA formyltransferase  50.62 
 
 		 327 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  48.68 
 
 		 315 aa  278  1e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0143  methionyl-tRNA formyltransferase  51.25 
 
 		 327 aa  276  2e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.853701  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  48.33 
 
 		 315 aa  276  2e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2805  methionyl-tRNA formyltransferase  51.25 
 
 		 337 aa  276  2e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2275  methionyl-tRNA formyltransferase  51.25 
 
 		 337 aa  276  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0151  methionyl-tRNA formyltransferase  51.25 
 
 		 327 aa  276  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3123  methionyl-tRNA formyltransferase  50 
 
 		 327 aa  276  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.760657  normal  0.204185 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2353  methionyl-tRNA formyltransferase  51.25 
 
 		 337 aa  276  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0347  methionyl-tRNA formyltransferase  51.25 
 
 		 327 aa  276  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6477  methionyl-tRNA formyltransferase  50.31 
 
 		 327 aa  276  3e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.79537 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0160  methionyl-tRNA formyltransferase  51.25 
 
 		 327 aa  276  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.701485  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4053  methionyl-tRNA formyltransferase  49.69 
 
 		 323 aa  275  5e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04056  methionyl-tRNA formyltransferase  52.82 
 
 		 307 aa  275  5e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0129  methionyl-tRNA formyltransferase  50.79 
 
 		 328 aa  275  6e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0831  methionyl-tRNA formyltransferase  50.47 
 
 		 327 aa  275  6e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3354  methionyl-tRNA formyltransferase  49.07 
 
 		 327 aa  275  7e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3677  methionyl-tRNA formyltransferase  49.07 
 
 		 327 aa  275  9e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3877  methionyl-tRNA formyltransferase  48.44 
 
 		 323 aa  275  9e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3398  methionyl-tRNA formyltransferase  49.37 
 
 		 323 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.726388  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0086  methionyl-tRNA formyltransferase  49.67 
 
 		 310 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2251  hitchhiker  0.0000000986218 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  47.37 
 
 		 312 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4690  methionyl-tRNA formyltransferase  50.46 
 
 		 329 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  44.66 
 
 		 318 aa  272  6e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2078  methionyl-tRNA formyltransferase  48.28 
 
 		 332 aa  271  7e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4415  methionyl-tRNA formyltransferase  50.16 
 
 		 328 aa  271  9e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.628902 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0019  methionyl-tRNA formyltransferase  50.52 
 
 		 310 aa  271  1e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.107334  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  49 
 
 		 310 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417966  decreased coverage  0.00000000000000611556 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0355  methionyl-tRNA formyltransferase  46.35 
 
 		 313 aa  271  1e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.36252  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  44.55 
 
 		 315 aa  271  1e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1928  methionyl-tRNA formyltransferase  51.16 
 
 		 307 aa  271  1e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2868  methionyl-tRNA formyltransferase  49.84 
 
 		 325 aa  270  2e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2512  methionyl-tRNA formyltransferase  48.92 
 
 		 330 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3126  methionyl-tRNA formyltransferase  48.92 
 
 		 330 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.879337  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3774  methionyl-tRNA formyltransferase  48 
 
 		 315 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3142  methionyl-tRNA formyltransferase  48.92 
 
 		 330 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.757511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  46.33 
 
 		 321 aa  269  4e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  44.66 
 
 		 318 aa  269  4e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000257015 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  44.34 
 
 		 318 aa  269  5e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0028  methionyl-tRNA formyltransferase  44.34 
 
 		 318 aa  268  8e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.709441  hitchhiker  0.00475764 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4512  methionyl-tRNA formyltransferase  45.87 
 
 		 314 aa  268  8.999999999999999e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.017466  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>