299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0058 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_0058  MgtC/SapB transporter  100 
 
 
173 aa  338  2.9999999999999998e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.460783 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3446  MgtC/SapB transporter  46.99 
 
 
164 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.209232  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3628  MgtC/SapB transporter  47.33 
 
 
170 aa  131  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0348  MgtC/SapB transporter  45.22 
 
 
185 aa  127  5.0000000000000004e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.184436 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3329  MgtC/SapB transporter  47.68 
 
 
170 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.689759  normal  0.197682 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1889  MgtC/SapB transporter  50.77 
 
 
166 aa  123  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.296352  normal  0.742707 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3921  MgtC/SapB transporter  46.62 
 
 
167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3897  MgtC/SapB transporter  43.7 
 
 
178 aa  114  7.999999999999999e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.174225 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1249  MgtC/SapB transporter  56.36 
 
 
157 aa  111  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1909  MgtC/SapB transporter  42.07 
 
 
227 aa  106  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2314  MgtC/SapB transporter  41.1 
 
 
228 aa  102  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000678509  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1929  MgtC family protein  37.76 
 
 
225 aa  100  9e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2953  MgtC/SapB transporter  38.24 
 
 
150 aa  100  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.932886  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2811  MgtC/SapB transporter  36.81 
 
 
227 aa  99.8  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0558  cation transport ATPase yqgG  34 
 
 
240 aa  95.1  4e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1155  MgtC/SapB transporter  38.41 
 
 
235 aa  95.1  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.100649  normal  0.496718 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0572  MgtC family protein  33.33 
 
 
240 aa  94.4  6e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2106  MgtC/SapB transporter  39.57 
 
 
163 aa  93.6  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2623  MgtC/SapB transporter  42.48 
 
 
242 aa  92  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.55252 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1155  MgtC family protein  38.35 
 
 
228 aa  92.4  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0257745  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2209  putative Mg(2+) transport ATPase  36.96 
 
 
219 aa  92  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.849166  normal  0.287318 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1805  putative Mg(2+) transport ATPase  36.96 
 
 
219 aa  92  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1915  putative Mg(2+) transport ATPase  36.96 
 
 
219 aa  92  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0823  MgtC/SapB transporter  38.46 
 
 
237 aa  90.9  9e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.131 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1302  MgtC/SapB transporter  37.69 
 
 
210 aa  90.1  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0531  MgtC/SapB transporter  37.74 
 
 
245 aa  90.5  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.772543  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6903  MgtC/SapB transporter  42.25 
 
 
228 aa  89.7  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.275178 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1323  MgtC/SapB transporter  37.06 
 
 
228 aa  89.7  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2398  MgtC/SapB transporter  37.75 
 
 
156 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1679  mgtC family protein  37.29 
 
 
225 aa  89  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00131484  hitchhiker  2.42161e-20 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3637  mgtC family protein  37.29 
 
 
225 aa  89  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0469  MgtC/SapB transporter  34.48 
 
 
165 aa  88.2  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5837  MgtC/SapB transporter  49.49 
 
 
170 aa  88.2  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.574002  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3287  MgtC/SapB family membrane protein  36.44 
 
 
225 aa  88.2  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1981  MgtC/SapB transporter  36.8 
 
 
225 aa  87.8  6e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0166435  normal  0.0845453 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2114  MgtC/SapB transporter  35 
 
 
178 aa  87.8  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.170064 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3543  mgtC family protein  36.44 
 
 
225 aa  87.4  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.82916  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0515  MgtC/SapB transporter  36.02 
 
 
233 aa  87.4  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.14823  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1988  MgtC/SapB transporter  35.97 
 
 
162 aa  87.4  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.45523 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2363  MgtC/SapB transporter  41.1 
 
 
150 aa  87  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0487  MgtC/SapB transporter  36.13 
 
 
232 aa  87  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3230  MgtC/SapB transporter  36.22 
 
 
225 aa  87.4  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0894  MgtC family protein  34.25 
 
 
221 aa  86.7  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00160229  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3541  mgtC family protein  35.59 
 
 
225 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3324  mgtC family protein  36.59 
 
 
225 aa  86.7  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.230158  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3239  MgtC/SapB family membrane protein  36.59 
 
 
225 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3539  mgtC family protein  36.59 
 
 
225 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.980840000000001e-24 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3585  mgtC family protein  36.59 
 
 
225 aa  86.7  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2209  Mg2+ transporter  37.14 
 
 
162 aa  86.7  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60782  normal  0.0151422 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2948  MgtC/SapB family transporter  41.55 
 
 
228 aa  86.3  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.349809  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2506  MgtC/SapB transporter  40 
 
 
189 aa  85.9  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.174906  normal  0.0242046 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0017  Mg2+ transporter  33.74 
 
 
233 aa  86.7  2e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0915905 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2216  MgtC/SapB transporter  36.44 
 
 
225 aa  85.9  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000668009  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0293  MgtC/SapB transporter  32.64 
 
 
231 aa  85.9  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0520  MgtC/SapB transporter  35.4 
 
 
233 aa  85.9  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.960712  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2886  MgtC/SapB transporter  40.69 
 
 
226 aa  85.5  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0361104  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6895  MgtC/SapB transporter  34.39 
 
 
164 aa  85.5  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.651851  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1919  MgtC/SapB transporter  34.13 
 
 
232 aa  85.1  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000262716  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2236  MgtC/SapB transporter  35.62 
 
 
159 aa  84.7  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0175  MgtC/SapB transporter  34.87 
 
 
229 aa  84.7  6e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171884 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3054  MgtC/SapB transporter  36.84 
 
 
239 aa  84.7  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.362097 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3112  MgtC/SapB transporter  40 
 
 
226 aa  84  9e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.706726  normal  0.28104 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1354  MgtC/SapB transporter  39.26 
 
 
189 aa  83.6  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154231  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4104  MgtC/SapB transporter  31.08 
 
 
168 aa  84  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0214315  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1355  MgtC/SapB transporter  34.27 
 
 
238 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.928186 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4307  MgtC/SapB transporter  36.43 
 
 
228 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177022  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3009  MgtC/SapB transporter  39.44 
 
 
226 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.794391  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2849  MgtC/SapB transporter  36.57 
 
 
225 aa  82.4  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2176  MgtC family protein  39.57 
 
 
231 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.373098  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0397  MgtC family membrane protein  39.57 
 
 
243 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1106  mgtC family protein  33.6 
 
 
237 aa  81.6  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0921  MgtC/SapB transporter  32.19 
 
 
248 aa  82  0.000000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000837465  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2137  MgtC/SapB transporter  36.02 
 
 
245 aa  81.6  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2512  MgtC/SapB transporter  34.46 
 
 
231 aa  80.9  0.000000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.775208  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2993  MgtC/SapB transporter  37.31 
 
 
225 aa  80.9  0.000000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1728  Mg2+ transporter  35.82 
 
 
223 aa  80.9  0.000000000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0882538  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2126  MgtC family protein  39.57 
 
 
243 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1856  MgtC family protein  40 
 
 
231 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.306879  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3389  MgtC/SapB transporter  33.54 
 
 
151 aa  80.5  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1748  MgtC family protein  40 
 
 
231 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.840494  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1150  MgtC family protein  40 
 
 
231 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0862  MgtC family protein  39.57 
 
 
243 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0307  MgtC family membrane protein  39.57 
 
 
243 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.808223  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5378  MgtC/SapB transporter  39.01 
 
 
232 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.368068 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2643  MgtC/SapB transporter  41.28 
 
 
221 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.139935  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1861  MgtC/SapB transporter  37.24 
 
 
238 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2797  MgtC/SapB transporter  35.71 
 
 
226 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.956195 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4773  MgtC/SapB transporter  38.85 
 
 
232 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.347441 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5362  MgtC/SapB transporter  38.85 
 
 
232 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0134811  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5498  MgtC/SapB transporter  38.85 
 
 
232 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.178344  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0626  MgtC/SapB transporter  39.29 
 
 
219 aa  78.6  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.473392  normal  0.489512 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4832  MgtC/SapB transporter  39.01 
 
 
232 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0957  MgtC family protein  37.76 
 
 
238 aa  78.2  0.00000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0790763  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3295  MgtC/SapB transporter  41.13 
 
 
231 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0387472 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0271  MgtC/SapB transporter  32.59 
 
 
215 aa  77.4  0.00000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000391256  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1965  putative MgtC family protein  35 
 
 
233 aa  77  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000332806  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3350  MgtC/SapB transporter  33.54 
 
 
166 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.412283  normal  0.0394509 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3994  putative Mg(2+) transport ATPase  34.72 
 
 
215 aa  77  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2296  MgtC/SapB transporter  38.46 
 
 
174 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897409  hitchhiker  0.00000501406 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05375  Mg(2+) transport protein C, mgtC family protein  35.2 
 
 
141 aa  76.3  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.229985  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>