More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2213 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2213  N-acetylneuraminate lyase  100 
 
 		 308 aa  631  1e-180  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3023  dihydrodipicolinate synthetase  42.71 
 
 		 313 aa  252  4.0000000000000004e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.530069 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1374  dihydrodipicolinate synthetase family protein  40.8 
 
 		 298 aa  241  9e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3256  dihydrodipicolinate synthetase  38.82 
 
 		 314 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0185396  normal  0.0566926 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0899  dihydropicolinate synthase  39.93 
 
 		 297 aa  231  2e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.442458  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1522  dihydrodipicolinate synthetase  39.6 
 
 		 301 aa  226  4e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1293  putative N-acetylneuraminate lyase  40.91 
 
 		 297 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.519377  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1400  dihydrodipicolinate synthetase  40.91 
 
 		 297 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.13834  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2776  putative N-acetylneuraminate lyase  40.91 
 
 		 297 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216717 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2063  N-acetylneuraminate lyase  40.4 
 
 		 307 aa  219  7e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000000571385  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1946  dihydrodipicolinate synthetase  40.6 
 
 		 305 aa  214  9.999999999999999e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191392  normal  0.0845217 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2625  dihydrodipicolinate synthetase  37.29 
 
 		 315 aa  198  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0998284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1149  dihydrodipicolinate synthase  31.27 
 
 		 298 aa  135  7.000000000000001e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0962  dihydrodipicolinate synthase  29.25 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  28.86 
 
 		 294 aa  127  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1762  dihydrodipicolinate synthase  28.76 
 
 		 293 aa  126  5e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3832  N-acetylneuraminate lyase  28.52 
 
 		 302 aa  125  8.000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.217271  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  28.86 
 
 		 294 aa  124  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1847  dihydrodipicolinate synthase  29.45 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.284862 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1047  N-acetylneuraminate lyase  28.23 
 
 		 309 aa  124  2e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  28.86 
 
 		 294 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_002936  DET0973  dihydrodipicolinate synthase  30.61 
 
 		 297 aa  124  3e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  30.61 
 
 		 293 aa  122  5e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  31.42 
 
 		 293 aa  122  9e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0864  dihydrodipicolinate synthase  30.61 
 
 		 297 aa  122  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  29.51 
 
 		 319 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3586  dihydrodipicolinate synthase  26.28 
 
 		 297 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0588  dihydrodipicolinate synthase  28.08 
 
 		 296 aa  122  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.144122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_846  dihydrodipicolinate synthase  30.95 
 
 		 297 aa  121  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0454  dihydrodipicolinate synthetase  30.89 
 
 		 302 aa  120  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3705  dihydrodipicolinate synthetase  27.39 
 
 		 305 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  27.36 
 
 		 289 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2156  dihydrodipicolinate synthetase  28.57 
 
 		 298 aa  120  3e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.157479  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1068  dihydrodipicolinate synthase  30.14 
 
 		 292 aa  120  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126267  normal  0.042063 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  28.42 
 
 		 290 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  26.44 
 
 		 291 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2918  dihydrodipicolinate synthase  27.44 
 
 		 294 aa  119  6e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3702  dihydrodipicolinate synthetase  29.79 
 
 		 301 aa  119  7e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  28.62 
 
 		 294 aa  119  7e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  27.7 
 
 		 289 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  28.72 
 
 		 300 aa  119  9e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  27.03 
 
 		 289 aa  119  9e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  30.41 
 
 		 300 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  30.41 
 
 		 300 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  30.41 
 
 		 300 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0622  dihydrodipicolinate synthase  29.25 
 
 		 296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.260695  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  27.99 
 
 		 290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  28.18 
 
 		 292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3337  dihydrodipicolinate synthetase  29.92 
 
 		 302 aa  117  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.426658  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3607  dihydrodipicolinate synthase  26.57 
 
 		 294 aa  117  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  29.63 
 
 		 292 aa  117  3e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  26.85 
 
 		 289 aa  117  3e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  30.07 
 
 		 301 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1196  dihydrodipicolinate synthase  28.86 
 
 		 321 aa  117  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  28.52 
 
 		 292 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3170  dihydrodipicolinate synthase  28.52 
 
 		 323 aa  117  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0819147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  28.52 
 
 		 292 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1427  dihydrodipicolinate synthase  29.49 
 
 		 302 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.544407 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3650  dihydrodipicolinate synthase  28.52 
 
 		 292 aa  116  5e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3540  dihydrodipicolinate synthase  28.52 
 
 		 292 aa  116  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3558  dihydrodipicolinate synthase  28.52 
 
 		 292 aa  116  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.238358  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3935  dihydrodipicolinate synthase  28.52 
 
 		 292 aa  116  5e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000721965  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3846  dihydrodipicolinate synthase  28.52 
 
 		 292 aa  116  5e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000642983  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3810  dihydrodipicolinate synthase  28.52 
 
 		 292 aa  116  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27976e-50 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0039  N-acetylneuraminate lyase, putative  26.58 
 
 		 305 aa  116  6e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  28.38 
 
 		 300 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  28.38 
 
 		 300 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  28.38 
 
 		 300 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  28.38 
 
 		 300 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  28.38 
 
 		 300 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  28.38 
 
 		 300 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  28.38 
 
 		 300 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  26.9 
 
 		 297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1613  dihydrodipicolinate synthase  28.28 
 
 		 296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.390661 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2579  dihydrodipicolinate synthase  28.62 
 
 		 303 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  28.57 
 
 		 297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  29.39 
 
 		 301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3342  dihydrodipicolinate synthase  28.77 
 
 		 292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  29.73 
 
 		 301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1611  dihydrodipicolinate synthase  28.04 
 
 		 292 aa  113  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  29.73 
 
 		 301 aa  113  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0575  dihydrodipicolinate synthase  29.15 
 
 		 296 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0358  dihydrodipicolinate synthase  28.87 
 
 		 290 aa  112  5e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.672086  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3520  N-acetylneuraminate lyase  26.95 
 
 		 297 aa  112  5e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0303093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1200  dihydrodipicolinate synthase  28.14 
 
 		 296 aa  113  5e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0593  dihydrodipicolinate synthase  29.9 
 
 		 297 aa  112  6e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.147808 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0924  dihydrodipicolinate synthase  27.8 
 
 		 298 aa  112  6e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1010  dihydrodipicolinate synthase  27.8 
 
 		 298 aa  112  6e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03085  N-acetylneuraminate lyase  26.95 
 
 		 297 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616118  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0481  N-acetylneuraminate lyase  26.95 
 
 		 297 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3707  N-acetylneuraminate lyase  26.95 
 
 		 297 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0487465  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3413  N-acetylneuraminate lyase  26.95 
 
 		 297 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0759607  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0481  N-acetylneuraminate lyase  26.95 
 
 		 297 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.556937 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4542  N-acetylneuraminate lyase  26.95 
 
 		 297 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3551  N-acetylneuraminate lyase  26.95 
 
 		 297 aa  112  7.000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.35374  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03036  hypothetical protein  26.95 
 
 		 297 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.84784  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3661  N-acetylneuraminate lyase  26.5 
 
 		 297 aa  112  7.000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.529009  normal  0.169481 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0695  N-acetylneuraminate lyase  28.47 
 
 		 292 aa  112  9e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  29.96 
 
 		 290 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0178  N-acetylneuraminate lyase  26.79 
 
 		 288 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>