More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4902 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4902  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 		 146 aa  299  8.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38070  3-dehydroquinate dehydratase  81.38 
 
 		 147 aa  244  4e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.633165  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2407  3-dehydroquinate dehydratase  76.55 
 
 		 149 aa  237  5e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0668809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3288  3-dehydroquinate dehydratase  76.55 
 
 		 152 aa  236  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.796587 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2041  3-dehydroquinate dehydratase  75.17 
 
 		 149 aa  235  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.775923 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1913  3-dehydroquinate dehydratase  73.79 
 
 		 152 aa  231  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.643127  normal  0.307548 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0330  3-dehydroquinate dehydratase  73.79 
 
 		 148 aa  218  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7522  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03030  3-dehydroquinate dehydratase  71.72 
 
 		 148 aa  215  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.343672  hitchhiker  0.0000797805 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0337  3-dehydroquinate dehydratase  65.28 
 
 		 146 aa  192  1e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4568  3-dehydroquinate dehydratase  64.08 
 
 		 151 aa  190  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0883  3-dehydroquinate dehydratase  65.96 
 
 		 160 aa  189  9e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.893545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2094  3-dehydroquinate dehydratase, type II  64.66 
 
 		 142 aa  187  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.641417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2058  3-dehydroquinate dehydratase  62.24 
 
 		 193 aa  187  4e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0849  3-dehydroquinate dehydratase  62.5 
 
 		 151 aa  184  3e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1753  3-dehydroquinate dehydratase  62.5 
 
 		 151 aa  184  3e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111772  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0892  3-dehydroquinate dehydratase  62.5 
 
 		 151 aa  184  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.396481  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2207  3-dehydroquinate dehydratase  62.5 
 
 		 151 aa  184  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0482  3-dehydroquinate dehydratase  62.5 
 
 		 193 aa  184  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.644593  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1896  3-dehydroquinate dehydratase  62.5 
 
 		 193 aa  184  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0579  3-dehydroquinate dehydratase  61.81 
 
 		 193 aa  184  5e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4964  3-dehydroquinate dehydratase  65.69 
 
 		 151 aa  183  8e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0222066 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3063  3-dehydroquinate dehydratase  65.69 
 
 		 151 aa  183  8e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.816098  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5304  3-dehydroquinate dehydratase  65.69 
 
 		 151 aa  183  8e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5193  3-dehydroquinate dehydratase  65.69 
 
 		 151 aa  182  9e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0344  3-dehydroquinate dehydratase  64.23 
 
 		 151 aa  181  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960001  normal  0.658958 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4665  3-dehydroquinate dehydratase  64.23 
 
 		 151 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560222  normal  0.542393 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2491  3-dehydroquinate dehydratase  60.14 
 
 		 147 aa  179  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.254685  normal  0.906535 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2272  3-dehydroquinate dehydratase  59.85 
 
 		 176 aa  179  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156045  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3419  3-dehydroquinate dehydratase  62.86 
 
 		 151 aa  179  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0105986  normal  0.197082 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2187  3-dehydroquinate dehydratase  57.24 
 
 		 156 aa  179  1e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.379626  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2715  3-dehydroquinate dehydratase  57.24 
 
 		 151 aa  178  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3018  3-dehydroquinate dehydratase  57.93 
 
 		 151 aa  179  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.572032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5319  3-dehydroquinate dehydratase  60.96 
 
 		 149 aa  177  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2433  3-dehydroquinate dehydratase  56.16 
 
 		 156 aa  177  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2104  3-dehydroquinate dehydratase  57.82 
 
 		 148 aa  177  4.999999999999999e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2433  3-dehydroquinate dehydratase  64.18 
 
 		 149 aa  177  4.999999999999999e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.587468  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1751  3-dehydroquinate dehydratase  55.86 
 
 		 156 aa  176  7e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0911231  normal  0.235606 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1610  3-dehydroquinate dehydratase  57.82 
 
 		 148 aa  176  7e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0468975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3174  3-dehydroquinate dehydratase  60.71 
 
 		 153 aa  176  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.715681 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5032  3-dehydroquinate dehydratase  57.82 
 
 		 151 aa  175  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2867  3-dehydroquinate dehydratase  55.86 
 
 		 151 aa  174  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0904  3-dehydroquinate dehydratase  59.12 
 
 		 176 aa  174  3e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.92679  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3467  3-dehydroquinate dehydratase  60.56 
 
 		 149 aa  174  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3290  3-dehydroquinate dehydratase  56.43 
 
 		 152 aa  174  3e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267239  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0908  3-dehydroquinate dehydratase  59.12 
 
 		 157 aa  174  4e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3392  3-dehydroquinate dehydratase  59.42 
 
 		 158 aa  174  4e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21280  3-dehydroquinate dehydratase  58.87 
 
 		 150 aa  173  6e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.775201  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2302  3-dehydroquinate dehydratase  59.15 
 
 		 177 aa  173  6e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.708414  hitchhiker  0.00337586 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4214  3-dehydroquinate dehydratase  56.74 
 
 		 163 aa  173  7e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1551  3-dehydroquinate dehydratase  58.21 
 
 		 150 aa  172  9.999999999999999e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.961806  normal  0.25542 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3022  3-dehydroquinate dehydratase  58.22 
 
 		 147 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00285164  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1397  3-dehydroquinate dehydratase  61.59 
 
 		 154 aa  170  5e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000192408  normal  0.601404 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3376  3-dehydroquinate dehydratase  58.22 
 
 		 147 aa  170  5e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0045  3-dehydroquinate dehydratase, type II  60 
 
 		 144 aa  170  5e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1538  3-dehydroquinate dehydratase  55.8 
 
 		 145 aa  170  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3916  3-dehydroquinate dehydratase  56.16 
 
 		 150 aa  170  5.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.491166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0668  3-dehydroquinate dehydratase  58.96 
 
 		 156 aa  170  5.999999999999999e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2377  3-dehydroquinate dehydratase  61.54 
 
 		 149 aa  169  1e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0845  3-dehydroquinate dehydratase, type II  58.33 
 
 		 145 aa  168  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1732  3-dehydroquinate dehydratase  55.47 
 
 		 145 aa  168  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676815  normal  0.0717581 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0246  3-dehydroquinate dehydratase, type II  56.12 
 
 		 156 aa  169  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0954  3-dehydroquinate dehydratase  54.74 
 
 		 148 aa  167  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0330586 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1841  3-dehydroquinate dehydratase  58.27 
 
 		 143 aa  167  4e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.226528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5950  3-dehydroquinate dehydratase  56.52 
 
 		 149 aa  167  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0375239  normal  0.0174964 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1789  3-dehydroquinate dehydratase  55.07 
 
 		 145 aa  167  6e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2300  3-dehydroquinate dehydratase  53.9 
 
 		 148 aa  167  6e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.562117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1559  3-dehydroquinate dehydratase  57.14 
 
 		 149 aa  167  6e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.897026  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0511  3-dehydroquinate dehydratase  57.75 
 
 		 144 aa  167  6e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1714  3-dehydroquinate dehydratase  61.19 
 
 		 145 aa  166  7e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.011115  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2299  3-dehydroquinate dehydratase  57.34 
 
 		 159 aa  166  8e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.926726  normal  0.99105 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1848  3-dehydroquinate dehydratase  56.74 
 
 		 143 aa  166  9e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.690997  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4133  3-dehydroquinate dehydratase, type II  57.86 
 
 		 148 aa  166  1e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.817948  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01135  Catabolic 3-dehydroquinase (EC 4.2.1.10)(3-dehydroquinate dehydratase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P05147]  52.41 
 
 		 153 aa  165  2e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.174731 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2657  3-dehydroquinate dehydratase  56.43 
 
 		 149 aa  165  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000254633 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0948  3-dehydroquinate dehydratase  58.21 
 
 		 153 aa  164  2.9999999999999998e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00455713  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0512  3-dehydroquinate dehydratase  57.45 
 
 		 146 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0511  3-dehydroquinate dehydratase  57.04 
 
 		 144 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3520  3-dehydroquinate dehydratase  57.04 
 
 		 144 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3940  3-dehydroquinate dehydratase  58.27 
 
 		 141 aa  164  4e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000739911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3443  3-dehydroquinate dehydratase, type II  60.28 
 
 		 146 aa  164  4e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7090  3-dehydroquinate dehydratase  55.32 
 
 		 147 aa  164  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5453  3-dehydroquinate dehydratase  56.03 
 
 		 147 aa  164  5e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.747889  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1707  3-dehydroquinate dehydratase  55.07 
 
 		 146 aa  163  8e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0599881  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3143  3-dehydroquinate dehydratase type II  59.12 
 
 		 145 aa  163  9e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.993688  hitchhiker  0.00640997 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1784  3-dehydroquinate dehydratase  60 
 
 		 147 aa  162  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.851396 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3063  3-dehydroquinate dehydratase  59.56 
 
 		 162 aa  161  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3348  3-dehydroquinate dehydratase  54.11 
 
 		 144 aa  161  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0620  3-dehydroquinate dehydratase  59.15 
 
 		 151 aa  161  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0159708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5566  3-dehydroquinate dehydratase  59.15 
 
 		 147 aa  161  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64090  3-dehydroquinate dehydratase  59.15 
 
 		 147 aa  161  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5252  3-dehydroquinate dehydratase  55.4 
 
 		 146 aa  160  5.0000000000000005e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.667512  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2864  3-dehydroquinate dehydratase  61.03 
 
 		 162 aa  160  7e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3145  3-dehydroquinate dehydratase  56.2 
 
 		 146 aa  160  7e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.35351  normal  0.502836 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2834  3-dehydroquinate dehydratase  54.93 
 
 		 149 aa  160  7e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0506337  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3500  3-dehydroquinate dehydratase  59.85 
 
 		 155 aa  160  7e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.651593 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3205  3-dehydroquinate dehydratase  59.44 
 
 		 148 aa  159  9e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087334 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002198  3-dehydroquinate dehydratase II  54.93 
 
 		 149 aa  159  9e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0180031  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5387  3-dehydroquinate dehydratase  55.17 
 
 		 153 aa  159  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.878433  normal  0.435849 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3692  3-dehydroquinate dehydratase  54.61 
 
 		 150 aa  159  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.526895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2054  3-dehydroquinate dehydratase  53.52 
 
 		 151 aa  159  1e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>