272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4499 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_2475  sulfatase  70.55 
 
 
652 aa  895    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.84195 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4499  sulfatase  100 
 
 
649 aa  1313    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000368912 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3858  sulfatase  73.67 
 
 
647 aa  929    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.499421  normal  0.910234 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1932  sulfatase  63.05 
 
 
666 aa  838    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3723  sulfatase  44.16 
 
 
633 aa  533  1e-150  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0526  sulfatase  44.53 
 
 
633 aa  526  1e-148  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0320  sulfatase  42.81 
 
 
640 aa  528  1e-148  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1625  sulfatase  43.24 
 
 
635 aa  525  1e-147  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00413884  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3618  sulfatase  43.36 
 
 
633 aa  522  1e-147  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2948  hypothetical protein  44.71 
 
 
633 aa  521  1e-146  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.146367  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1405  sulfatase  48.94 
 
 
712 aa  504  1e-141  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4881  sulfatase  42.39 
 
 
695 aa  492  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.652285 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4465  sulfatase  42.7 
 
 
656 aa  472  1e-132  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3051  sulfatase  38.69 
 
 
652 aa  454  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.535064  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2881  sulfatase  38.66 
 
 
712 aa  448  1.0000000000000001e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.242387  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3537  sulfatase  39.38 
 
 
650 aa  437  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1118  sulfatase  40.62 
 
 
628 aa  424  1e-117  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1753  sulfatase  39.5 
 
 
696 aa  425  1e-117  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.100359  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0140  hypothetical protein  42.93 
 
 
633 aa  416  9.999999999999999e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.597793  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3884  sulfatase  32.98 
 
 
654 aa  288  2e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4628  sulfatase  32.7 
 
 
660 aa  286  7e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3808  sulfatase  32.39 
 
 
654 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4129  sulfatase  33.96 
 
 
654 aa  276  7e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4333  sulfatase  33.77 
 
 
654 aa  276  9e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0138  sulfatase  33.58 
 
 
654 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000529062  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4201  sulfatase  33.77 
 
 
654 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000207245  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4012  sulfatase  33.16 
 
 
654 aa  273  7e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3507  sulfatase  33.33 
 
 
646 aa  271  4e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3803  sulfatase  31.37 
 
 
654 aa  268  2e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003619  phosphoglycerol transferase I  30.46 
 
 
649 aa  269  2e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.878946  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3562  sulfatase  33.33 
 
 
682 aa  263  6e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1915  sulfatase  30.47 
 
 
654 aa  263  1e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.256965  normal  0.471265 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0174  sulfatase  32.67 
 
 
670 aa  261  2e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0432  phosphoglycerol transferase  29.69 
 
 
653 aa  259  9e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.504655  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3632  sulfatase  31.91 
 
 
662 aa  258  2e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2716  sulfatase domain-containing protein  30.88 
 
 
665 aa  256  7e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.324091  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02464  phosphoglycerol transferase  30.18 
 
 
645 aa  254  4.0000000000000004e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0240  sulfatase  32.2 
 
 
678 aa  251  2e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0154  sulfatase  31.62 
 
 
656 aa  247  4.9999999999999997e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5023  sulfatase  31.66 
 
 
646 aa  244  3e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0910313  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3456  sulfatase  32.71 
 
 
657 aa  244  3.9999999999999997e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.383156  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1979  sulfatase  32.21 
 
 
663 aa  237  6e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1399  sulfatase  30.31 
 
 
670 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0319  sulfatase  26.44 
 
 
646 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4108  sulfatase  27.05 
 
 
697 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.526454 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42670  hypothetical protein  26.56 
 
 
700 aa  195  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1416  sulfatase  27.57 
 
 
685 aa  195  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.934087  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1838  hypothetical protein  27.52 
 
 
685 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.8565  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3872  sulfatase  27.52 
 
 
685 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292904  normal  0.0933221 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1447  sulfatase  26.93 
 
 
690 aa  191  5e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.189062 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0080  sulfatase  27.61 
 
 
634 aa  189  1e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.204618  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3581  hypothetical protein  27.42 
 
 
700 aa  188  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.377432  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1865  sulfatase  27.26 
 
 
695 aa  182  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119974  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2056  hypothetical protein  26.92 
 
 
695 aa  177  7e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.814835  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2548  sulfatase  34.14 
 
 
621 aa  170  7e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25880  Sulfatase protein  28.57 
 
 
717 aa  167  4e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1899  sulfatase family protein  26.04 
 
 
677 aa  162  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3506  sulfatase  27.66 
 
 
677 aa  159  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.633638  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0445  sulfatase  26.36 
 
 
611 aa  159  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00137642  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1736  sulfatase  27.26 
 
 
597 aa  153  8e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2974  hypothetical protein  28.69 
 
 
550 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.113702 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0377  sulfatase  25.93 
 
 
671 aa  146  9e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000264889  hitchhiker  0.0000000000000148489 
 
 
-
 
NC_002950  PG2021  hypothetical protein  25.75 
 
 
643 aa  141  3.9999999999999997e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.112326 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2377  sulfatase  28.39 
 
 
643 aa  130  9.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1564  hypothetical protein  26.65 
 
 
651 aa  128  3e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1848  sulfatase  26.27 
 
 
645 aa  124  6e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1069  sulfatase  25.21 
 
 
641 aa  122  1.9999999999999998e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3855  sulfatase  26.45 
 
 
666 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.593214  normal  0.690048 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1996  sulphatase  26.81 
 
 
628 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.745737 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0309  sulfatase  25.98 
 
 
630 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2207  sulfatase  23.77 
 
 
627 aa  115  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1353  sulfatase  26.67 
 
 
639 aa  114  4.0000000000000004e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5404  sulfatase  26.14 
 
 
642 aa  110  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000849395  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5348  sulfatase  26.14 
 
 
642 aa  110  6e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000124675  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5606  sulfatase  25.82 
 
 
642 aa  109  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000063545  unclonable  7.68096e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5321  sulfatase  25.82 
 
 
642 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.10214e-55 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4913  sulfatase  25.82 
 
 
642 aa  108  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000919892  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5024  sulfatase  25.82 
 
 
642 aa  109  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00083521  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5353  sulfatase  25.82 
 
 
642 aa  109  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00171789  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5081  sulfatase  25.82 
 
 
642 aa  108  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140992  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4928  sulfatase  25.82 
 
 
642 aa  108  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5470  sulfatase  25.82 
 
 
642 aa  108  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000729601  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2501  sulfatase  23.83 
 
 
629 aa  108  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3766  sulfatase  25.49 
 
 
642 aa  108  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000560432  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3797  sulfatase  24.08 
 
 
639 aa  100  8e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000542687  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3535  sulfatase  22.95 
 
 
639 aa  100  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.009662  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1538  sulfatase  26.59 
 
 
628 aa  100  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3864  sulfatase  24.08 
 
 
639 aa  100  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00973329  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0371  sulfatase  25.32 
 
 
625 aa  99.4  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000394083  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3517  sulfatase  23.8 
 
 
639 aa  98.6  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3804  sulfatase  24.69 
 
 
639 aa  98.2  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00040285  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3505  sulfatase  24.36 
 
 
639 aa  97.4  7e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000809194  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1300  sulfatase; phosphoglycerol transferase  25.68 
 
 
628 aa  96.7  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1576  sulfatase  25.68 
 
 
628 aa  96.7  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1327  sulfatase  25.68 
 
 
628 aa  96.3  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1508  sulfatase  25.68 
 
 
628 aa  96.3  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221211 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3608  sulfatase  24.08 
 
 
639 aa  95.9  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1436  sulfatase  25.68 
 
 
628 aa  96.3  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.567309  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3776  sulfatase  24.08 
 
 
639 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000208589 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3895  sulfatase  24.08 
 
 
639 aa  95.9  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60461  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>