More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3729 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_1498  enterobactin exporter EntS  78.92 
 
 
432 aa  650    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.201643  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1327  enterobactin exporter EntS  79.67 
 
 
424 aa  649    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00590508  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3729  enterobactin exporter EntS  100 
 
 
426 aa  825    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.818592  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3423  enterobactin exporter EntS  53.19 
 
 
422 aa  387  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.408147  normal  0.319337 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0689  enterobactin exporter EntS  49.21 
 
 
414 aa  350  4e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.38667 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0705  enterobactin exporter EntS  49.86 
 
 
414 aa  345  7e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.427412  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0632  enterobactin exporter EntS  49.59 
 
 
414 aa  343  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.314833  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0646  enterobactin exporter EntS  49.59 
 
 
414 aa  344  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0751  enterobactin exporter EntS  49.59 
 
 
414 aa  344  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0493  enterobactin exporter EntS  49.86 
 
 
416 aa  339  5.9999999999999996e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00558  predicted transporter  49.59 
 
 
416 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3035  major facilitator superfamily MFS_1  49.59 
 
 
416 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0611  enterobactin exporter EntS  49.59 
 
 
416 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0611  enterobactin exporter EntS  49.59 
 
 
416 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3053  enterobactin exporter EntS  49.59 
 
 
416 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00547  hypothetical protein  49.59 
 
 
416 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0642  enterobactin exporter EntS  49.59 
 
 
416 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1123  enterobactin exporter EntS  47.42 
 
 
415 aa  338  9.999999999999999e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.115316  normal  0.860817 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0676  enterobactin exporter EntS  49.59 
 
 
416 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.565934  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0363  major facilitator superfamily MFS_1  42.57 
 
 
455 aa  280  4e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1861  enterobactin exporter EntS  40.71 
 
 
443 aa  203  4e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6079  hypothetical protein  29.98 
 
 
420 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.533874  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2780  major facilitator superfamily MFS_1  28.32 
 
 
423 aa  134  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.018642 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  31.25 
 
 
415 aa  132  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2647  major facilitator transporter  30.65 
 
 
524 aa  130  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0830  major facilitator superfamily MFS_1  30.83 
 
 
422 aa  130  6e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0559019  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1007  hypothetical protein  30.03 
 
 
415 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.767675  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4653  major facilitator superfamily MFS_1  30.38 
 
 
438 aa  126  8.000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.689399  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2608  major facilitator superfamily MFS_1  30.83 
 
 
426 aa  123  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.669442  normal  0.388396 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4618  major facilitator transporter  31.07 
 
 
426 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1264  major facilitator superfamily MFS_1  33.1 
 
 
422 aa  121  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.62642  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3075  major facilitator transporter  28.45 
 
 
423 aa  120  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0850  major facilitator superfamily MFS_1  31 
 
 
408 aa  119  9e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.427056  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3555  major facilitator superfamily MFS_1  28.78 
 
 
449 aa  117  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194127  normal  0.458265 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4774  major facilitator transporter  28.97 
 
 
443 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1719  major facilitator superfamily MFS_1  25.5 
 
 
447 aa  113  8.000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  25.36 
 
 
428 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4706  major facilitator superfamily MFS_1  27.2 
 
 
445 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.93667 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0836  major facilitator superfamily MFS_1  28.23 
 
 
443 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33800  Major Facilitator Superfamily transporter  27.32 
 
 
505 aa  108  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.714924  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5333  hypothetical protein  26.49 
 
 
415 aa  107  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1221  major facilitator transporter  28.02 
 
 
451 aa  106  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0719879 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0063  major facilitator superfamily protein  25.5 
 
 
419 aa  106  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.586585  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1388  hypothetical protein  24.93 
 
 
404 aa  105  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5805  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  26.96 
 
 
419 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.774942 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0832  major facilitator superfamily MFS_1  30.17 
 
 
443 aa  105  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.533006  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2356  major facilitator superfamily MFS_1  27.55 
 
 
426 aa  102  9e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1420  major facilitator superfamily MFS_1  26.2 
 
 
420 aa  102  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3881  major facilitator transporter  27.49 
 
 
509 aa  101  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1693  major facilitator superfamily MFS_1  29.63 
 
 
422 aa  101  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00531073  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  26.57 
 
 
440 aa  100  4e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3573  major facilitator transporter  28.3 
 
 
416 aa  100  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0309  drug:proton antiporter  25.32 
 
 
414 aa  100  6e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4368  major facilitator superfamily permease  27.89 
 
 
431 aa  99.8  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1608  hypothetical protein  25.21 
 
 
404 aa  99.4  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3145  major facilitator superfamily MFS_1  25.52 
 
 
440 aa  99.4  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.985088  normal  0.131643 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10048  putative transporter  23.99 
 
 
424 aa  98.2  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3284  major facilitator transporter  27.03 
 
 
403 aa  96.7  7e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4481  major facilitator transporter  27.6 
 
 
416 aa  96.7  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3031  major facilitator transporter  26.43 
 
 
420 aa  95.5  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036629 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  26.78 
 
 
474 aa  95.9  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  26.67 
 
 
436 aa  95.5  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0786  major facilitator transporter  25.19 
 
 
406 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3976  major facilitator transporter  26.08 
 
 
407 aa  95.5  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5006  major facilitator transporter  27.14 
 
 
416 aa  94.4  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.641572  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61170  putative transmembrane protein  26.37 
 
 
403 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  26.81 
 
 
433 aa  94.4  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4894  hypothetical protein  25.07 
 
 
412 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2160  major facilitator superfamily permease  25.19 
 
 
427 aa  94  4e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.797788 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0591  major facilitator transporter  23.57 
 
 
427 aa  93.6  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.584321  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4356  major facilitator superfamily MFS_1  28.7 
 
 
388 aa  93.6  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  normal  0.27139 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3575  major facilitator superfamily MFS_1  27.18 
 
 
416 aa  93.2  8e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0261  major facilitator superfamily MFS_1  30.5 
 
 
438 aa  92.4  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0905059 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3197  major facilitator superfamily MFS_1  27.87 
 
 
427 aa  92  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000392196 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2101  major facilitator superfamily MFS_1  28.19 
 
 
479 aa  91.7  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  26.12 
 
 
442 aa  91.7  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5268  MFS family transporter  26.63 
 
 
403 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4646  major facilitator transporter  25 
 
 
409 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0279  major facilitator transporter  24.35 
 
 
418 aa  91.7  3e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3228  hypothetical protein  27.14 
 
 
405 aa  90.9  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65431  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  25 
 
 
412 aa  90.9  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1952  major facilitator superfamily MFS_1  25.51 
 
 
418 aa  90.9  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  23.56 
 
 
430 aa  90.9  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5216  major facilitator transporter  27.02 
 
 
416 aa  89.7  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0124  major facilitator transporter  28.05 
 
 
403 aa  89.7  9e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137137  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0425  major facilitator transporter  29.76 
 
 
430 aa  89.7  9e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4652  major facilitator superfamily MFS_1  24.68 
 
 
406 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4514  major facilitator transporter  24.68 
 
 
406 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4246  major facilitator transporter  27.09 
 
 
415 aa  89.4  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000179551  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2475  major facilitator superfamily MFS_1  29.26 
 
 
494 aa  88.6  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.495662  normal  0.811847 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2641  major facilitator transporter  25.48 
 
 
499 aa  88.6  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.893021  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3670  major facilitator superfamily MFS_1  26.9 
 
 
475 aa  87.8  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3130  major facilitator superfamily MFS_1  28.28 
 
 
406 aa  88.2  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0513  major facilitator transporter  29.35 
 
 
430 aa  87.8  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.629333  decreased coverage  0.000815548 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4201  major facilitator superfamily MFS_1  27.11 
 
 
432 aa  87.4  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  26.05 
 
 
431 aa  87.4  4e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4311  major facilitator superfamily MFS_1  27.11 
 
 
432 aa  87.4  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.204415  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2940  major facilitator superfamily MFS_1  26.91 
 
 
422 aa  87.8  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3460  major facilitator transporter  24.7 
 
 
421 aa  87  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  hitchhiker  0.00919031 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5069  major facilitator transporter  26.95 
 
 
416 aa  87.4  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>