More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0897 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0897  dimethyladenosine transferase  100 
 
 		 282 aa  556  1e-157  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00367265  normal  0.802625 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0944  dimethyladenosine transferase  80.51 
 
 		 280 aa  455  1e-127  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.621806 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1116  dimethyladenosine transferase  78.42 
 
 		 278 aa  433  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0735586 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1185  dimethyladenosine transferase  77.42 
 
 		 280 aa  431  1e-120  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.230549  normal  0.468097 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2905  dimethyladenosine transferase  77.34 
 
 		 278 aa  427  1e-118  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1549  dimethyladenosine transferase  76.98 
 
 		 278 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1809  dimethyladenosine transferase  74.91 
 
 		 305 aa  409  1e-113  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.957431  normal  0.3003 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3343  dimethyladenosine transferase  64.71 
 
 		 281 aa  335  5.999999999999999e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281566 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0760  dimethyladenosine transferase  62.82 
 
 		 274 aa  333  1e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.676822  normal  0.117293 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1206  dimethyladenosine transferase  63.44 
 
 		 275 aa  332  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.547269  hitchhiker  0.00130975 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1537  dimethyladenosine transferase  63.18 
 
 		 275 aa  332  6e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.22522  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1063  dimethyladenosine transferase  62.72 
 
 		 275 aa  329  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0156992 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2833  dimethyladenosine transferase  62.5 
 
 		 288 aa  322  4e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.137486  normal  0.146005 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1762  dimethyladenosine transferase  61.07 
 
 		 275 aa  317  1e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5102  dimethyladenosine transferase  61.96 
 
 		 285 aa  305  6e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0674  dimethyladenosine transferase  61.31 
 
 		 276 aa  305  7e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.533862  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0682  dimethyladenosine transferase  61.31 
 
 		 276 aa  305  7e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5840  dimethyladenosine transferase  60.28 
 
 		 283 aa  305  7e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3639  dimethyladenosine transferase  60.78 
 
 		 296 aa  302  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.227832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3924  dimethyladenosine transferase  60.5 
 
 		 291 aa  301  9e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.199476 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1682  dimethyladenosine transferase  57.6 
 
 		 287 aa  301  1e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3826  dimethyladenosine transferase  58.27 
 
 		 286 aa  300  2e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0535848 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2606  dimethyladenosine transferase  60 
 
 		 278 aa  299  3e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2345  dimethyladenosine transferase  57.35 
 
 		 287 aa  298  7e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3476  dimethyladenosine transferase  60.22 
 
 		 287 aa  297  1e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0552  dimethyladenosine transferase  63.04 
 
 		 292 aa  297  1e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0112102 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3931  dimethyladenosine transferase  60.07 
 
 		 296 aa  296  3e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2308  dimethyladenosine transferase  58.63 
 
 		 286 aa  295  6e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0717722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2971  dimethyladenosine transferase  58.63 
 
 		 287 aa  292  5e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.379865  normal  0.325884 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2475  dimethyladenosine transferase  58.99 
 
 		 287 aa  289  3e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0408  dimethyladenosine transferase  57.97 
 
 		 276 aa  288  7e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0413158 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0654  dimethyladenosine transferase  59.07 
 
 		 297 aa  288  1e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.712331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2226  dimethyladenosine transferase  58.84 
 
 		 288 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.587183 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0431  dimethyladenosine transferase  57.52 
 
 		 288 aa  278  7e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1221  dimethyladenosine transferase  55.63 
 
 		 289 aa  276  2e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.675859  normal  0.381466 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1478  dimethyladenosine transferase  58.12 
 
 		 271 aa  276  3e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.736244 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0886  dimethyladenosine transferase  57.25 
 
 		 273 aa  275  4e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.299134  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0503  dimethyladenosine transferase  53.26 
 
 		 276 aa  270  2e-71  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2525  dimethyladenosine transferase  57.3 
 
 		 288 aa  261  6.999999999999999e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2624  dimethyladenosine transferase  59.04 
 
 		 272 aa  255  7e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3042  dimethyladenosine transferase  56.04 
 
 		 275 aa  250  2e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.733787  normal  0.35073 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0392  dimethyladenosine transferase  39.45 
 
 		 262 aa  216  2e-55  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00834232  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0648  dimethyladenosine transferase  37.73 
 
 		 277 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0090  dimethyladenosine transferase  39.85 
 
 		 286 aa  211  1e-53  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0802861  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0718  dimethyladenosine transferase  36.71 
 
 		 294 aa  176  4e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616682  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2325  dimethyladenosine transferase  42.96 
 
 		 279 aa  175  9e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000317998  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07730  dimethyladenosine transferase  41.95 
 
 		 268 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0104234 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0362  dimethyladenosine transferase  39.62 
 
 		 262 aa  172  5.999999999999999e-42  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0736  dimethyladenosine transferase  42.05 
 
 		 268 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1848  dimethyladenosine transferase  45.83 
 
 		 264 aa  171  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0037  dimethyladenosine transferase  39.44 
 
 		 291 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0213  dimethyladenosine transferase  38.03 
 
 		 297 aa  167  2e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0131  dimethyladenosine transferase  42.29 
 
 		 284 aa  167  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.684706  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0035  dimethyladenosine transferase  38.16 
 
 		 293 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3635  dimethyladenosine transferase  40.6 
 
 		 272 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0602  dimethyladenosine transferase  39.85 
 
 		 272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3832  dimethyladenosine transferase  40.98 
 
 		 272 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0077  dimethyladenosine transferase  39.36 
 
 		 293 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000377526  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1143  dimethyladenosine transferase  44.16 
 
 		 281 aa  164  2.0000000000000002e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.114498  normal  0.0559603 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2309  dimethyladenosine transferase  37.04 
 
 		 275 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000265248  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46830  dimethyladenosine transferase  41.73 
 
 		 272 aa  162  7e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1457  dimethyladenosine transferase  39.48 
 
 		 272 aa  161  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0867671  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2840  dimethyladenosine transferase  36.63 
 
 		 285 aa  160  3e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2526  dimethyladenosine transferase  36.63 
 
 		 285 aa  160  3e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3656  dimethyladenosine transferase  38.22 
 
 		 255 aa  158  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0224155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2152  dimethyladenosine transferase  39.77 
 
 		 255 aa  157  3e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4013  dimethyladenosine transferase  39.86 
 
 		 269 aa  156  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1935  dimethyladenosine transferase  38.69 
 
 		 275 aa  156  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3444  dimethyladenosine transferase  38.72 
 
 		 272 aa  156  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.135482  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3573  dimethyladenosine transferase  38.72 
 
 		 272 aa  156  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2614  dimethyladenosine transferase  40.82 
 
 		 276 aa  156  4e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0432  dimethyladenosine transferase  38.87 
 
 		 266 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.509897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001665  dimethyladenosine transferase  38.46 
 
 		 269 aa  156  5.0000000000000005e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1772  dimethyladenosine transferase  35.92 
 
 		 290 aa  155  6e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0401  dimethyladenosine transferase  38.78 
 
 		 267 aa  155  7e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0563  dimethyladenosine transferase  38.95 
 
 		 272 aa  155  7e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1779  dimethyladenosine transferase  35.59 
 
 		 290 aa  155  8e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0435  dimethyladenosine transferase  38.78 
 
 		 267 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0772  dimethyladenosine transferase  38.35 
 
 		 272 aa  155  9e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0349133  normal  0.113375 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1613  dimethyladenosine transferase  36.99 
 
 		 295 aa  155  9e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5135  dimethyladenosine transferase  38.66 
 
 		 272 aa  154  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4801  dimethyladenosine transferase  39.18 
 
 		 266 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3899  dimethyladenosine transferase  37.18 
 
 		 290 aa  154  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247606  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00808  dimethyladenosine transferase  38.6 
 
 		 269 aa  154  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0563  dimethyladenosine transferase  35.98 
 
 		 271 aa  154  2e-36  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21720  dimethyladenosine transferase  35 
 
 		 301 aa  154  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.700032  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0724  dimethyladenosine transferase  38.95 
 
 		 272 aa  154  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.682335  normal  0.907502 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0171  dimethyladenosine transferase  33.69 
 
 		 290 aa  154  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0046  dimethyladenosine transferase  36.52 
 
 		 292 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0039  dimethyladenosine transferase  36.52 
 
 		 292 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0040  dimethyladenosine transferase  36.52 
 
 		 292 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0546968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0037  dimethyladenosine transferase  36.52 
 
 		 292 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0037  dimethyladenosine transferase  36.52 
 
 		 292 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00019411  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0039  dimethyladenosine transferase  36.52 
 
 		 292 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0050  dimethyladenosine transferase  36.52 
 
 		 292 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5270  dimethyladenosine transferase  36.52 
 
 		 292 aa  153  4e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2995  dimethyladenosine transferase  38.37 
 
 		 256 aa  153  4e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1304  dimethyladenosine transferase  38.38 
 
 		 275 aa  152  4e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000005204  normal  0.0246501 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0046  dimethyladenosine transferase  36.52 
 
 		 292 aa  153  4e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2288  dimethyladenosine transferase  38.69 
 
 		 275 aa  152  5e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.311251  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>