More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1859 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1859  NifU-like protein  100 
 
 		 122 aa  253  5e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319001  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3580  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  67.23 
 
 		 124 aa  178  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1651  nitrogen-fixing NifU-like  66.12 
 
 		 125 aa  176  9e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.86354  normal  0.0135811 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2273  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  67.23 
 
 		 124 aa  176  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.913167  hitchhiker  0.00000451937 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0765  NifU domain-containing protein  64.96 
 
 		 123 aa  170  5e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00307292  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0721  nitrogen-fixing NifU-like protein  63.11 
 
 		 149 aa  168  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0316213  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2038  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  59.66 
 
 		 142 aa  164  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1754  nifU protein  59.66 
 
 		 144 aa  164  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00241183  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2126  NifU domain-containing protein  63.56 
 
 		 144 aa  163  6.9999999999999995e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08890  nitrogen-fixing NifU domain protein  60.5 
 
 		 138 aa  162  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453527  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0265  hypothetical protein  64.96 
 
 		 143 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.164856 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1836  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  61.86 
 
 		 145 aa  161  2.0000000000000002e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0842476 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1713  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  63.25 
 
 		 127 aa  160  4.0000000000000004e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000127457  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2425  NifU protein  63.79 
 
 		 129 aa  160  5.0000000000000005e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.191396 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2214  nitrogen-fixing NifU-like  59.02 
 
 		 143 aa  157  4e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.728312 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0755  NifU domain-containing protein  59.84 
 
 		 173 aa  153  9e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000803052  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2146  NifU domain-containing protein  57.63 
 
 		 129 aa  153  9e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.480493  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0303  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  61.02 
 
 		 137 aa  152  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.11332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1931  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  59.02 
 
 		 153 aa  152  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000270101  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0741  NifU domain-containing protein  58.62 
 
 		 129 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0422  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  59.83 
 
 		 137 aa  149  8.999999999999999e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0312726  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2906  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  56.56 
 
 		 146 aa  149  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274717  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1416  nitrogen-fixing NifU-like  57.63 
 
 		 139 aa  149  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000796101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1673  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  55.93 
 
 		 131 aa  148  3e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.439756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0206  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  55.17 
 
 		 150 aa  142  1e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00147996  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3621  Fe-S cluster assembly protein NifU  54.62 
 
 		 344 aa  142  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.237955 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1508  nitrogen fixation protein nifU  55.46 
 
 		 291 aa  141  3e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.63468  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1226  Fe-S cluster assembly protein NifU  55.46 
 
 		 291 aa  141  3e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000342519 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0101  Fe-S cluster assembly protein NifU  54.7 
 
 		 283 aa  140  8e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1568  Fe-S cluster assembly protein NifU  53.66 
 
 		 284 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000157708  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2648  Fe-S cluster assembly protein NifU  53.66 
 
 		 284 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000357887 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1298  nitrogen-fixing NifU domain protein  54.24 
 
 		 153 aa  138  1.9999999999999998e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.114268  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1832  Fe-S cluster assembly protein NifU  54.62 
 
 		 286 aa  138  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000450727  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0406  nitrogen-fixing NifU domain protein  53.39 
 
 		 154 aa  138  3e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.54432  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0720  nitrogen-fixing NifU domain protein  54.24 
 
 		 207 aa  137  6e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.985893  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1559  Fe-S cluster assembly protein NifU  52.1 
 
 		 309 aa  136  8.999999999999999e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.746235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0174  NifU domain-containing protein  59.66 
 
 		 125 aa  136  1e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0436  Fe-S cluster assembly protein NifU  52.5 
 
 		 284 aa  135  1e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1913  NifU domain-containing protein  57.63 
 
 		 147 aa  135  2e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3202  nitrogen fixation protein  60.17 
 
 		 129 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0956766  normal  0.0289436 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1514  Fe-S cluster assembly protein NifU  53.78 
 
 		 298 aa  133  6.0000000000000005e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1409  NifU-like domain-containing protein  50.82 
 
 		 131 aa  133  7.000000000000001e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.817294  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2443  NifU-like protein  52.99 
 
 		 128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2712  nitrogen-fixing NifU domain protein  50.43 
 
 		 124 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.1157 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3582  Fe-S cluster assembly protein NifU  51.26 
 
 		 329 aa  131  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.370448  normal  0.0119473 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0831  FeS cluster assembly scaffold IscU  54.92 
 
 		 133 aa  131  3e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.728943  normal  0.471167 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0689  Fe-S cluster assembly protein NifU  52.1 
 
 		 277 aa  130  7.999999999999999e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0701297  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1020  scaffold protein  53.23 
 
 		 133 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.154036  normal  0.455207 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0503  Fe-S cluster assembly protein NifU  51.26 
 
 		 277 aa  128  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1736  NifU protein  49.59 
 
 		 211 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.495331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0288  nitrogen-fixing NifU-like protein  48.33 
 
 		 211 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01620  Nitrogen fixation Fe-S cluster scaffold protein  50.42 
 
 		 312 aa  127  4.0000000000000003e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0248  scaffold protein  53.72 
 
 		 139 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0885  scaffold protein  51.61 
 
 		 133 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.541754  normal  0.110729 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2660  Fe-S cluster assembly protein NifU  51.28 
 
 		 281 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.729914 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0950  scaffold protein  51.61 
 
 		 133 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.850633  normal  0.0311736 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1492  FeS cluster assembly scaffold IscU  51.61 
 
 		 128 aa  125  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1554  scaffold protein  51.61 
 
 		 137 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.115759  normal  0.0775897 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2578  scaffold protein  51.61 
 
 		 138 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115419  hitchhiker  0.00110358 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1947  NifU domain-containing protein  48.28 
 
 		 133 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0470  FeS cluster assembly scaffold IscU  50.81 
 
 		 128 aa  124  3e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0220387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2204  scaffold protein  51.61 
 
 		 127 aa  124  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00285299  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2143  FeS cluster assembly scaffold IscU  52.46 
 
 		 133 aa  125  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760622 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1639  FeS cluster assembly scaffold IscU  52.46 
 
 		 133 aa  125  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3030  scaffold protein  53.72 
 
 		 128 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1245  scaffold protein  53.72 
 
 		 128 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969333  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1488  FeS cluster assembly scaffold IscU  50.81 
 
 		 134 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000147326  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2058  FeS cluster assembly scaffold IscU  50 
 
 		 135 aa  124  5e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.110723  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2143  FeS cluster assembly scaffold IscU  52.46 
 
 		 139 aa  124  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26628  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1876  scaffold protein  50.81 
 
 		 135 aa  124  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.473661  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2178  scaffold protein  51.22 
 
 		 132 aa  124  5e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00857387  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1059  scaffold protein  50.81 
 
 		 133 aa  124  6e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446364  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1457  FeS cluster assembly scaffold IscU  50.81 
 
 		 135 aa  124  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40390  scaffold protein  51.24 
 
 		 128 aa  123  7e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.960049  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1165  scaffold protein  51.64 
 
 		 128 aa  123  7e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0089491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1026  scaffold protein  50.81 
 
 		 133 aa  123  7e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00834233  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3998  FeS cluster assembly scaffold IscU  51.64 
 
 		 132 aa  122  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0455021  hitchhiker  0.00958668 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2444  FeS cluster assembly scaffold IscU  51.64 
 
 		 132 aa  123  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.463921  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2750  FeS cluster assembly scaffold IscU  52.89 
 
 		 128 aa  122  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.101913  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1325  scaffold protein  52.89 
 
 		 128 aa  123  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.149472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3026  scaffold protein  52.89 
 
 		 128 aa  122  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.050274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3626  scaffold protein  51.2 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.284747  normal  0.811196 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2035  scaffold protein  50.82 
 
 		 135 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.710086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2162  scaffold protein  50.82 
 
 		 135 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.789596  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3510  scaffold protein  50.82 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.7882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2289  scaffold protein  48.41 
 
 		 133 aa  121  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0320081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5431  scaffold protein  50.82 
 
 		 135 aa  121  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.113721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1300  scaffold protein  50 
 
 		 128 aa  121  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.129436  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5952  scaffold protein  50.82 
 
 		 135 aa  121  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2142  scaffold protein  50.82 
 
 		 135 aa  121  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.615742 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14740  scaffold protein  50 
 
 		 128 aa  121  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2125  scaffold protein  50.82 
 
 		 135 aa  121  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1145  scaffold protein  50 
 
 		 135 aa  120  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108874  normal  0.133708 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2261  (Fe-S) cluster formation/repair protein  50 
 
 		 138 aa  121  4e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.516044 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1105  FeS cluster assembly scaffold IscU  52.07 
 
 		 128 aa  121  4e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0168211  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3061  scaffold protein  50.82 
 
 		 130 aa  120  4e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.969828  unclonable  0.000000668017 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1707  scaffold protein  50 
 
 		 135 aa  120  5e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2654  scaffold protein  50 
 
 		 135 aa  120  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.978602  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3104  scaffold protein  50 
 
 		 135 aa  120  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.653609  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2216  scaffold protein  50 
 
 		 135 aa  120  5e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>