More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3216 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3216  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 414 aa  869    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.573386  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3429  glycosyl transferase group 1  40.96 
 
 		 440 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4705  glycosyl transferase group 1  42.34 
 
 		 440 aa  335  1e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.625922 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3806  glycosyl transferase group 1  42.89 
 
 		 428 aa  332  1e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.773329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2780  glycosyl transferase, group 1  38.46 
 
 		 425 aa  299  7e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.301884  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1118  group 1 glycosyltransferase  38.1 
 
 		 425 aa  299  8e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48856  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3432  glycosyl transferase group 1  40.15 
 
 		 419 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4708  glycosyl transferase group 1  36.74 
 
 		 418 aa  270  4e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.514087 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2778  glycosyl transferase, group 1  35.6 
 
 		 413 aa  229  6e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1116  glycosyltransferase  35.6 
 
 		 413 aa  229  8e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0458  glycosyl transferase group 1  28.26 
 
 		 447 aa  143  5e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0797  glycosyl transferase group 1  26.9 
 
 		 441 aa  136  6.0000000000000005e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.926616  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0613  glycosyl transferase, group 1 family protein / moaA/nifB/pqqE family protein  27.83 
 
 		 778 aa  135  9.999999999999999e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.12808  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4229  glycosyl transferase, group 1  27.78 
 
 		 445 aa  125  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378432 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1390  glycosyl transferase group 1  30.93 
 
 		 539 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0783  glycosyl transferase group 1  27.3 
 
 		 782 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2208  glycosyl transferase group 1  28.96 
 
 		 403 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120517  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2716  glycosyl transferase group 1  26.87 
 
 		 733 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3815  glycosyl transferase group 1  26.87 
 
 		 436 aa  106  7e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.2599  normal  0.775775 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4622  glycosyl transferase group 1  29.73 
 
 		 391 aa  103  7e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0028112 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5087  glycosyl transferase group 1  29.39 
 
 		 390 aa  102  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3107  glycosyl transferase, group 1  24.17 
 
 		 452 aa  97.4  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1051  putative transferase  27 
 
 		 384 aa  97.1  5e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1784  glycosyltransferase  25.82 
 
 		 401 aa  95.9  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2495  glycosyl transferase group 1  24.68 
 
 		 392 aa  95.1  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2400  glycosyl transferase, group 1  27.68 
 
 		 452 aa  94  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4356  glycosyl transferase group 1  28.38 
 
 		 409 aa  94.4  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.784045 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1804  glycosyl transferase group 1  27.3 
 
 		 415 aa  94  5e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0719  glycosyl transferase group 1  25.06 
 
 		 401 aa  93.6  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2588  glycosyl transferase, group 1  23.91 
 
 		 426 aa  92.8  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3293  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 		 392 aa  90.9  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2877  glycosyl transferase, group 1  25.9 
 
 		 426 aa  89.7  9e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0391  glycosyl transferase group 1  26.58 
 
 		 414 aa  89.4  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1100  glycosyl transferase group 1  25.59 
 
 		 924 aa  89.4  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4364  glycosyl transferase group 1  26.42 
 
 		 393 aa  86.3  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0079  glycosyltransferase, putative  24.94 
 
 		 403 aa  84.7  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.471525  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4972  glycosyl transferase group 1  24.83 
 
 		 445 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0082  glycosyl transferase group 1  24.94 
 
 		 403 aa  84.7  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1704  glycosyl transferase group 1  23.35 
 
 		 410 aa  84  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2766  glycosyl transferase group 1  32.19 
 
 		 413 aa  79.3  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.36427 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0177  glycosyl transferase group 1  25.17 
 
 		 445 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0643614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4248  glycosyl transferase group 1  24.25 
 
 		 405 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461257  normal  0.0976118 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0451  putative glycosyl transferase  25 
 
 		 401 aa  77.4  0.0000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3179  glycosyl transferase group 1  25.84 
 
 		 403 aa  77  0.0000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1173  glycosyl transferase group 1  22.51 
 
 		 391 aa  76.6  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0256  glycosyl transferase group 1  24.92 
 
 		 415 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4590  glycosyl transferase group 1  26.12 
 
 		 462 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3553  glycosyl transferase group 1  23.97 
 
 		 403 aa  76.3  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0516541  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0591  glycosyl transferase group 1  23.13 
 
 		 404 aa  76.3  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  27.06 
 
 		 386 aa  75.1  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3802  glycosyl transferase group 1  23.46 
 
 		 466 aa  74.3  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.30134 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13821  hypothetical protein  23.2 
 
 		 442 aa  73.9  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3317  glycosyl transferase group 1  27.18 
 
 		 396 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.356042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4167  glycosyl transferase, group 1  27.18 
 
 		 396 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4199  glycosyl transferase, group 1  27.18 
 
 		 396 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.59636 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2669  glycosyl transferase, group 1  21.92 
 
 		 404 aa  72.8  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2189  glycosyl transferase group 1  24.81 
 
 		 394 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3557  glycosyl transferase group 1  24.55 
 
 		 417 aa  72  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0744165  normal  0.646322 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2015  glycosyl transferase, group 1  34.09 
 
 		 382 aa  72  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2501  glycosyl transferase group 1  23.32 
 
 		 423 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0663849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2225  glycosyl transferase group 1  23.32 
 
 		 423 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0375  glycosyl transferase group 1  28.06 
 
 		 383 aa  70.5  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0236  glycosyl transferase group 1  25.18 
 
 		 1067 aa  70.1  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  27.87 
 
 		 423 aa  70.1  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3994  lipopolysaccharide 1,2-N-acetylglucosaminetransferase  24.32 
 
 		 381 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3926  glycosyl transferase group 1  26.87 
 
 		 410 aa  68.9  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760133 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  26.85 
 
 		 390 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3932  lipopolysaccharide 1,2-N-acetylglucosaminetransferase  24.66 
 
 		 381 aa  68.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  30.97 
 
 		 419 aa  68.2  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  27.31 
 
 		 390 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3913  lipopolysaccharide 1,2-N-acetylglucosaminetransferase  24.32 
 
 		 381 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.735836  normal  0.0414199 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4039  lipopolysaccharide 1,2-N-acetylglucosaminetransferase  24.32 
 
 		 381 aa  68.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4100  lipopolysaccharide 1,2-N-acetylglucosaminetransferase  24.32 
 
 		 381 aa  67.8  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.564193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2522  glycosyl transferase  28.57 
 
 		 364 aa  67  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.810552  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  24.94 
 
 		 417 aa  67  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  29.86 
 
 		 353 aa  67  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  25.08 
 
 		 375 aa  67  0.0000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2571  glycosyl transferase group 1  31.65 
 
 		 386 aa  66.2  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4996  lipopolysaccharide 1,2-N-acetylglucosaminetransferase  29.69 
 
 		 380 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0180671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3180  glycosyl transferase, group 1  27.72 
 
 		 409 aa  66.2  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.780891  normal  0.107104 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6389  glycosyl transferase group 1  21.78 
 
 		 387 aa  65.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.447732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2183  glycosyl transferase group 1  24.05 
 
 		 424 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0575473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6868  glycosyl transferase group 1  23.86 
 
 		 424 aa  63.5  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3512  glycosyl transferase group 1  27.66 
 
 		 369 aa  63.5  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.218401  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0355  glycosyl transferase, group 1  25.45 
 
 		 415 aa  63.5  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3684  glycosyl transferase group 1  23.26 
 
 		 1400 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1259  glycosyl transferase group 1  29.72 
 
 		 457 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00525262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0478  glycosyl transferase, group 1  20.72 
 
 		 442 aa  62  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.038549  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2630  glycosyl transferase, group 1  28.89 
 
 		 400 aa  62  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  26.73 
 
 		 381 aa  61.6  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  28.21 
 
 		 375 aa  62  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0581  glycosyl transferase, group 1  26.64 
 
 		 405 aa  61.2  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  30.34 
 
 		 396 aa  61.6  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  32.47 
 
 		 415 aa  61.2  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4043  glycosyl transferase, group 1  27.91 
 
 		 396 aa  61.2  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.121484  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  30.16 
 
 		 453 aa  60.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0080  glycosyl transferase group 1  26.79 
 
 		 404 aa  60.5  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0506  glycosyl transferase, group 1  29.25 
 
 		 425 aa  60.5  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0028  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.94 
 
 		 398 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.222793  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  28.02 
 
 		 409 aa  60.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>