More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0645 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03198  Mg/Co/Ni transporter MgtE (contains CBS domain)  73.01 
 
 		 452 aa  667    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000340775  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0645  magnesium transporter  100 
 
 		 452 aa  908    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0824163  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4549  magnesium transporter  63.64 
 
 		 452 aa  565  1e-160  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4245  magnesium transporter  57.62 
 
 		 454 aa  547  1e-154  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.036971  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3316  magnesium transporter  57.59 
 
 		 455 aa  543  1e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.497245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0702  magnesium transporter  56.29 
 
 		 454 aa  541  1e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.952021 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0721  magnesium transporter  58.06 
 
 		 454 aa  544  1e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.167519 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3966  magnesium transporter  55.93 
 
 		 454 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3673  magnesium transporter  56.07 
 
 		 454 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0193522  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0711  magnesium transporter  56.29 
 
 		 454 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194916  normal  0.348771 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0668  magnesium transporter  55.63 
 
 		 454 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.175865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3354  magnesium transporter  55.63 
 
 		 454 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.399526  normal  0.0702195 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0667  magnesium transporter  55.41 
 
 		 454 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0861056  normal  0.126448 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0681  magnesium transporter  56.29 
 
 		 454 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.299447  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3622  magnesium transporter  57.37 
 
 		 454 aa  537  1e-151  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.135678  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0710  magnesium transporter  55.19 
 
 		 454 aa  533  1e-150  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000631089  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3093  magnesium transporter  59.11 
 
 		 454 aa  531  1e-150  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3382  magnesium transporter  56.01 
 
 		 454 aa  526  1e-148  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.363371  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2896  magnesium transporter  55.65 
 
 		 453 aa  525  1e-148  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0679732  normal  0.300943 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03669  hypothetical protein  54.99 
 
 		 451 aa  507  9.999999999999999e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002398  magnesium transporter  54.77 
 
 		 452 aa  505  9.999999999999999e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2114  magnesium transporter  56.85 
 
 		 453 aa  505  9.999999999999999e-143  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0493  magnesium transporter  54.55 
 
 		 451 aa  491  9.999999999999999e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.862314  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2720  magnesium transporter  51.22 
 
 		 453 aa  470  1.0000000000000001e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.786081  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2421  magnesium transporter  49.89 
 
 		 450 aa  434  1e-120  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.545313  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2231  magnesium transporter  48.99 
 
 		 450 aa  423  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.555024  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3183  magnesium transporter  47.54 
 
 		 455 aa  401  9.999999999999999e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2801  divalent cation transporter  48.12 
 
 		 452 aa  389  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02217  magnesium transporter  44.66 
 
 		 422 aa  376  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0994421  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0946  magnesium transporter  42.26 
 
 		 453 aa  369  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.313196  normal  0.57653 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1840  divalent cation transporter  41.89 
 
 		 453 aa  367  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0971  magnesium transporter  40.55 
 
 		 453 aa  344  2e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000190733  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0306  magnesium transporter  41.82 
 
 		 479 aa  343  4e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.13146  hitchhiker  0.00174841 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3760  magnesium transporter  41.12 
 
 		 480 aa  332  6e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00964036  normal  0.880674 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3074  magnesium transporter  43.6 
 
 		 475 aa  331  1e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687941 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4271  divalent cation transporter  40.52 
 
 		 480 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000733148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1567  magnesium transporter  39.28 
 
 		 481 aa  327  3e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3976  magnesium transporter  40.05 
 
 		 480 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2899  magnesium transporter  40.28 
 
 		 480 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4471  magnesium transporter  39.81 
 
 		 480 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.223346 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1444  magnesium transporter  39.81 
 
 		 480 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0516873  normal  0.652895 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3552  divalent cation transporter  38.89 
 
 		 480 aa  322  7e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0662808  normal  0.235563 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1846  magnesium transporter  38.67 
 
 		 480 aa  322  8e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.268327  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3682  magnesium transporter  41.22 
 
 		 480 aa  319  6e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0108  magnesium transporter  39.73 
 
 		 481 aa  318  1e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2060  magnesium transporter  37.77 
 
 		 492 aa  317  3e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000417993  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2506  divalent cation transporter  40.91 
 
 		 494 aa  316  5e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4599  putative Mg transporter MgtE  37.61 
 
 		 482 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52460  putative Mg transporter MgtE  37.61 
 
 		 482 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3011  magnesium transporter  38.84 
 
 		 451 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1224  magnesium transporter  35.17 
 
 		 491 aa  300  3e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1341  magnesium transporter  35.17 
 
 		 491 aa  300  3e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3111  magnesium transporter  35.17 
 
 		 491 aa  300  3e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34420  magnesium transporter; MgtE  38.88 
 
 		 480 aa  298  9e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.902296  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2790  magnesium transporter  36.68 
 
 		 478 aa  298  1e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.559033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3545  magnesium transporter  37.39 
 
 		 477 aa  298  1e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2874  MgtE intracellular region  40.38 
 
 		 456 aa  297  2e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000391262  hitchhiker  0.000117357 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2772  MgtE intracellular region  40.38 
 
 		 456 aa  296  4e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000125234  hitchhiker  0.00666763 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2704  MgtE intracellular region  40.38 
 
 		 456 aa  296  6e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000714396  hitchhiker  0.000367704 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1033  magnesium transporter  36.89 
 
 		 473 aa  295  1e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1083  magnesium transporter  37.81 
 
 		 471 aa  295  1e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.939247  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1565  magnesium transporter, putative  39.67 
 
 		 456 aa  294  3e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3911  serine/threonine protein kinase  37.26 
 
 		 446 aa  292  8e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2763  MgtE intracellular region  37.97 
 
 		 465 aa  292  9e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00201718  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1060  MgtE intracellular region  38.12 
 
 		 443 aa  289  8e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.217148 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1301  magnesium transporter  39.67 
 
 		 484 aa  289  9e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1081  magnesium transporter, putative  39.29 
 
 		 454 aa  286  4e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00154782  normal  0.461647 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2551  magnesium transporter  35.62 
 
 		 458 aa  282  8.000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0540  magnesium transporter  37.36 
 
 		 478 aa  280  3e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2620  magnesium transport protein  36.03 
 
 		 471 aa  280  4e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.475029  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1995  divalent cation transporter  37.53 
 
 		 476 aa  279  9e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4045  magnesium transporter  37.5 
 
 		 472 aa  278  1e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1408  magnesium transporter  39.44 
 
 		 456 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0463641  normal  0.12261 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1369  magnesium transporter  39.44 
 
 		 456 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1385  magnesium transporter  39.44 
 
 		 456 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.778738  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00197  putative Magnesium transporter  38.5 
 
 		 445 aa  278  2e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00518446  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2974  magnesium transporter  39.44 
 
 		 456 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.467265  normal  0.0484227 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3528  MgtE intracellular region  36.97 
 
 		 455 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000114236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1450  magnesium transporter  36.04 
 
 		 445 aa  274  2.0000000000000002e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.103194  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2778  magnesium transporter  37.87 
 
 		 461 aa  271  1e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.854072  normal  0.0326796 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1255  magnesium transporter  36.58 
 
 		 445 aa  272  1e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.029906  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1327  magnesium transporter  35.21 
 
 		 492 aa  271  2e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0965  magnesium transporter  35.73 
 
 		 481 aa  271  2e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105361  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1825  magnesium transporter  38.06 
 
 		 463 aa  271  2e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202182  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000565  putative magnesium transporter MgtE  35.35 
 
 		 448 aa  271  2e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000005121  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0582  Mg/Co/Ni transporter MgtE  36.24 
 
 		 467 aa  268  1e-70  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2951  magnesium transporter  35.53 
 
 		 492 aa  268  2e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2069  magnesium transporter  36.72 
 
 		 471 aa  268  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0262  MgtE intracellular region  38.07 
 
 		 445 aa  266  7e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1866  magnesium transporter  36.49 
 
 		 471 aa  265  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.165676  normal  0.0535205 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05323  hypothetical protein  35.59 
 
 		 448 aa  265  2e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0571  magnesium transporter  35.24 
 
 		 467 aa  264  3e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1904  magnesium transporter  37.68 
 
 		 462 aa  264  3e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4084  magnesium transporter  37.68 
 
 		 470 aa  261  2e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1994  divalent cation transporter  35.58 
 
 		 442 aa  259  6e-68  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0416  putative magnesium transporter MgtE  34.59 
 
 		 448 aa  256  7e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000019  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3533  magnesium transporter  35.02 
 
 		 471 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.206013 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0471  magnesium transporter  35.23 
 
 		 482 aa  253  7e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.963916 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1386  magnesium transporter  33.71 
 
 		 485 aa  253  7e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1147  magnesium transporter  35.17 
 
 		 479 aa  252  1e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.552524 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>