More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1506 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1506  GTP-binding proten HflX  100 
 
 
433 aa  884    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00115562  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0970  GTP-binding proten HflX  78.75 
 
 
433 aa  712    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1737  GTP-binding protein, HSR1-related  73.57 
 
 
434 aa  636    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.260139  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1355  GTP-binding protein HflX  72.95 
 
 
435 aa  625  1e-178  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1731  GTP-binding proten HflX  71.12 
 
 
434 aa  619  1e-176  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1584  GTP-binding proten HflX  71.03 
 
 
434 aa  608  1e-173  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1174  GTP-binding protein HflX  67.92 
 
 
431 aa  595  1e-169  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.929711  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  54.29 
 
 
442 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4167  GTP-binding proten HflX  52.32 
 
 
396 aa  380  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000123151  unclonable  0.00000000000307153 
 
 
-
 
NC_002950  PG1886  GTP-binding protein HflX  47.32 
 
 
406 aa  352  5.9999999999999994e-96  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.968139 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0477  GTP-binding proten HflX  46.67 
 
 
401 aa  347  2e-94  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00918489  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1171  GTP-binding protein, HSR1-related  49.22 
 
 
409 aa  346  6e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1232  hypothetical protein  48.17 
 
 
395 aa  344  2e-93  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.125901 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3121  GTP-binding proten HflX  46.42 
 
 
411 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.653968 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04515  GTP-binding protein HflX  46.87 
 
 
407 aa  332  1e-89  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.546831  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6253  GTP-binding proten HflX  52.85 
 
 
426 aa  329  6e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0590  GTP-binding proten HflX  48.95 
 
 
396 aa  327  3e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3840  GTP1/OBG family GTP-binding protein  47.76 
 
 
392 aa  316  7e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1713  GTP-binding proten HflX  44.97 
 
 
464 aa  314  1.9999999999999998e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.639031  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2979  GTP-binding protein, HSR1-related  49.28 
 
 
384 aa  313  5.999999999999999e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.908653  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4893  GTP-binding protein HflX  48.37 
 
 
433 aa  312  7.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4769  GTP-binding protein, HSR1-related  48.37 
 
 
433 aa  312  7.999999999999999e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4945  GTP-binding proten HflX  48.37 
 
 
433 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0574  GTP-binding protein, HSR1-related  47.48 
 
 
421 aa  310  2e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227405  hitchhiker  0.000000000264606 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0898  GTP-binding proten HflX  45.56 
 
 
417 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0010  hypothetical protein  44.06 
 
 
414 aa  303  4.0000000000000003e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0010  hypothetical protein  44.06 
 
 
414 aa  303  4.0000000000000003e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10790  GTP-binding proten HflX  43 
 
 
433 aa  303  6.000000000000001e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000931239  unclonable  0.00000000274038 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  45.55 
 
 
433 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3310  GTP-binding protein, HSR1-related  43.31 
 
 
435 aa  301  2e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  45.72 
 
 
433 aa  301  2e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1469  GTP-binding proten HflX  49.16 
 
 
396 aa  300  3e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.795442  normal  0.339069 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0636  GTP-binding protein, HSR1-related  49.25 
 
 
433 aa  299  6e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0477069 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0772  GTP-binding proten HflX  41.15 
 
 
437 aa  299  7e-80  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.426006  normal  0.338027 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2183  GTP-binding proten HflX  48.45 
 
 
387 aa  299  7e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1434  GTP-binding protein HSR1-related  41.23 
 
 
419 aa  299  8e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2349  GTP-binding protein HflX  48.45 
 
 
392 aa  298  9e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0068  GTP-binding protein HflX  48.45 
 
 
387 aa  298  9e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0515568  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1100  GTP-binding protein HflX  48.45 
 
 
387 aa  298  9e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1828  GTP-binding protein HflX  48.45 
 
 
387 aa  298  9e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2221  GTP-binding proten HflX  48.45 
 
 
387 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.997598  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  45.99 
 
 
461 aa  298  1e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2768  GTP-binding protein, HSR1-related  43.59 
 
 
432 aa  298  1e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1087  small GTP-binding protein domain-containing protein  41.16 
 
 
436 aa  297  3e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.824642  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2240  GTP-binding protein HflX  48.17 
 
 
392 aa  297  3e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.224831  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1612  GTP-binding proten HflX  43.07 
 
 
436 aa  297  3e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000211402  unclonable  5.44053e-16 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  45.75 
 
 
413 aa  297  3e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1339  GTP-binding protein HflX  48.17 
 
 
387 aa  296  4e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.519508  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2081  small GTP-binding protein  45.71 
 
 
582 aa  296  4e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00812611  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  45.53 
 
 
429 aa  296  4e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1689  GTP1/OBG protein  39.76 
 
 
419 aa  296  7e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3539  small GTP-binding protein  44.27 
 
 
431 aa  296  7e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0887499  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1835  GTP-binding protein  40.44 
 
 
419 aa  296  7e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  43.15 
 
 
441 aa  295  8e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2589  GTP-binding protein, HSR1-related  47.45 
 
 
382 aa  295  8e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0427105  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1868  GTP-binding protein, HSR1-related  41.39 
 
 
481 aa  295  8e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0249572  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1982  GTP-binding protein  44.65 
 
 
433 aa  295  1e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.699413  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1693  GTP-binding protein  40.73 
 
 
419 aa  295  1e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.78132  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1828  GTP-binding protein  40.73 
 
 
419 aa  295  1e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  45.45 
 
 
422 aa  295  1e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1717  GTP-binding proten HflX  48.31 
 
 
396 aa  295  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.658318  normal  0.277641 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1674  GTP-binding protein  40.19 
 
 
419 aa  294  2e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.887073  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0567  GTP-binding protein, HSR1-related  43.53 
 
 
432 aa  295  2e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.102684  normal  0.249219 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3204  GTP-binding protein, HSR1-related  43.26 
 
 
435 aa  294  2e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1414  GTP-binding proten HflX  48.03 
 
 
414 aa  294  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000434774 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2631  GTP-binding protein HSR1-related  43.51 
 
 
429 aa  294  2e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315157  unclonable  0.00000000000608691 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1650  GTP-binding protein  40.19 
 
 
419 aa  293  3e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101149  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5107  small GTP-binding protein  48.17 
 
 
396 aa  293  3e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245706  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1951  GTP-binding protein  40.44 
 
 
419 aa  293  3e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.697887  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1872  GTP-binding protein  40.69 
 
 
419 aa  294  3e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000726379 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1830  GTP-binding proten HflX  48.17 
 
 
395 aa  293  4e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1806  small GTP-binding protein  48.17 
 
 
395 aa  293  4e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1744  small GTP-binding protein  48.17 
 
 
396 aa  293  5e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3508  GTP-binding protein  40.73 
 
 
419 aa  292  7e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  45.82 
 
 
421 aa  292  8e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  44.11 
 
 
440 aa  292  8e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11140  small GTP-binding protein  46.54 
 
 
395 aa  290  2e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2535  GTP-binding proten HflX  49.26 
 
 
404 aa  291  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0955087  hitchhiker  0.0000726108 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00093  putative GTPase HflX  44.02 
 
 
429 aa  291  2e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1600  small GTP-binding protein  49.26 
 
 
404 aa  291  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0793347  normal  0.128476 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0396  GTP-binding protein, HSR1-related  42.67 
 
 
489 aa  290  4e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3979  GTP-binding protein, HSR1-related  42.18 
 
 
432 aa  290  4e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3720  putative GTPase HflX  42.93 
 
 
426 aa  289  7e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00523075  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2759  putative GTPase HflX  40.43 
 
 
429 aa  289  9e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.563886  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  46.11 
 
 
454 aa  288  1e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0355  GTP - binding protein, phage lambda cII repressor  42.4 
 
 
489 aa  288  1e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4169  GTP-binding proten HflX  44.28 
 
 
432 aa  288  1e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00885496  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0599  GTP-binding protein, HSR1-related  44.03 
 
 
435 aa  288  1e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00843062  hitchhiker  0.00021975 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3431  GTP-binding protein, HSR1-related  44.03 
 
 
435 aa  288  1e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.253406  normal  0.0436905 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2776  putative GTPase HflX  40.8 
 
 
439 aa  288  1e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.114582  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  47.41 
 
 
454 aa  287  2e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3918  putative GTPase HflX  42.93 
 
 
426 aa  287  2e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.240209  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0598  GTP-binding protein, HSR1-related  43.78 
 
 
435 aa  288  2e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.472321  hitchhiker  0.00000215533 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2262  GTP-binding proten HflX  41.43 
 
 
435 aa  286  4e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0798  GTP-binding protein, HSR1-related  44.28 
 
 
432 aa  286  4e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00968624 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3820  GTP-binding proten HflX  42.63 
 
 
426 aa  286  5e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0373648  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4684  GTP-binding proten HflX  50.15 
 
 
433 aa  286  5e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.712247  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4630  putative GTPase HflX  42.36 
 
 
426 aa  286  7e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.048412  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4780  putative GTPase HflX  42.36 
 
 
426 aa  286  7e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0452958  normal  0.331117 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4723  putative GTPase HflX  42.36 
 
 
426 aa  286  7e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>