More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1070 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1070  lipopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 316 aa  655    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710053  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3930  WxcM domain-containing protein  86.86 
 
 		 317 aa  577  1e-164  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.505027  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0692  WxcM domain-containing protein  64.38 
 
 		 315 aa  423  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1609  WxcM domain protein  61.97 
 
 		 310 aa  418  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.875347  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0690  WxcM-like  62.5 
 
 		 313 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1238  WxcM-like  63.07 
 
 		 312 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.219256  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2659  WxcM-like protein  58.31 
 
 		 304 aa  386  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1324  WxcM-like protein  55.74 
 
 		 309 aa  366  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3027  WxcM-like protein  57.89 
 
 		 153 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0683597  normal  0.28553 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1783  WxcM-like protein  56.67 
 
 		 171 aa  176  4e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1738  N-acetylglucosamine-1- phosphateuridyltransferase-like protein  52.32 
 
 		 201 aa  173  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1080  hexapaptide repeat-containing transferase  50.94 
 
 		 203 aa  159  5e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00205406  normal  0.0149533 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0895  hexapaptide repeat-containing transferase  47.47 
 
 		 202 aa  158  1e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1458  hexapaptide repeat-containing transferase  52.35 
 
 		 189 aa  151  1e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.532773  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0206  hexapaptide repeat-containing transferase  42.95 
 
 		 191 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.238916  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0290  acetyltransferase  46.1 
 
 		 194 aa  143  3e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1940  putative acetyltransferase  49.34 
 
 		 191 aa  143  4e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1820  hexapaptide repeat-containing transferase  48.05 
 
 		 187 aa  142  6e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0704  hexapeptide transferase family protein  45.81 
 
 		 194 aa  142  9e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000306748  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1694  hypothetical protein  45.45 
 
 		 182 aa  141  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.373843  normal  0.731728 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2258  putative acetyltransferase  46.75 
 
 		 193 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0569631  hitchhiker  0.00196203 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1692  hypothetical protein  45.45 
 
 		 182 aa  140  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.733433  decreased coverage  0.000199621 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0577  transferase hexapeptide repeat containing protein  46.54 
 
 		 194 aa  139  4.999999999999999e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2008  hexapaptide repeat-containing transferase  45.09 
 
 		 186 aa  139  7e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.500963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0550  transferase hexapeptide repeat containing protein  45.86 
 
 		 193 aa  138  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.259438  normal  0.0248751 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0246  hexapaptide repeat-containing transferase  47.74 
 
 		 193 aa  138  1e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.35108 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0823  WbbJ protein  42.94 
 
 		 193 aa  137  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1724  hexapaptide repeat-containing transferase  43.18 
 
 		 182 aa  137  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1859  Serine acetyltransferase-like protein  41.28 
 
 		 194 aa  137  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.127737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0357  transferase hexapeptide repeat containing protein  44.03 
 
 		 192 aa  137  3.0000000000000003e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1122  hexapeptide repeat-containing transferase  41.56 
 
 		 517 aa  137  3.0000000000000003e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2971  putative acetyltransferase  48.25 
 
 		 192 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.727659  normal  0.708619 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0893  NAD-dependent oxidoreductase  41.56 
 
 		 517 aa  136  6.0000000000000005e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0951  hexapaptide repeat-containing transferase  44.31 
 
 		 189 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0641  transferase hexapeptide repeat containing protein  46.41 
 
 		 192 aa  135  9.999999999999999e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.312071 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1928  transferase hexapeptide repeat containing protein  42.68 
 
 		 196 aa  135  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.746546  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4761  transferase hexapeptide repeat containing protein  42.86 
 
 		 190 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000053665  normal  0.125318 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3256  transferase hexapeptide repeat containing protein  41.94 
 
 		 236 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3128  putative acetyltransferase WbpD  45.83 
 
 		 194 aa  132  5e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1985  transferase hexapeptide repeat containing protein  43.51 
 
 		 203 aa  132  9e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0062564 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1673  transferase hexapeptide repeat containing protein  43.75 
 
 		 192 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.160587  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1421  hexapaptide repeat-containing transferase  41.18 
 
 		 192 aa  130  3e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4289  putative acetyltransferase  42.25 
 
 		 197 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.934275  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4429  hexapaptide repeat-containing transferase  41.51 
 
 		 207 aa  129  6e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.520075 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3016  putative acetyltransferase  44.08 
 
 		 215 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0002  hexapeptide transferase family protein  45.1 
 
 		 190 aa  127  2.0000000000000002e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00123717 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1298  putative acetyltransferase  42.86 
 
 		 207 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.248019  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0541  hexapaptide repeat-containing transferase  39.87 
 
 		 191 aa  127  3e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3315  hexapaptide repeat-containing transferase  43.14 
 
 		 196 aa  126  5e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.711982 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0871  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  42.11 
 
 		 189 aa  124  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0783  hexapaptide repeat-containing transferase  38.75 
 
 		 212 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.989182  normal  0.702768 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0038  transferase hexapeptide repeat containing protein  41.51 
 
 		 196 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1971  transferase hexapeptide repeat containing protein  37.5 
 
 		 207 aa  119  7e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365375 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2875  hexapaptide repeat-containing transferase  44.9 
 
 		 159 aa  116  6e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1699  WxcM domain-containing protein  47.01 
 
 		 136 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1509  transferase hexapeptide repeat containing protein  42.21 
 
 		 214 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6855  transferase hexapeptide repeat containing protein  42.77 
 
 		 197 aa  110  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0929755 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2940  WxcM domain protein  39.69 
 
 		 145 aa  108  8.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5772  transferase hexapeptide repeat containing protein  43.79 
 
 		 168 aa  108  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1784  WxcM domain protein  40.31 
 
 		 134 aa  108  1e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00207  NDP-hexose isomerase  40.46 
 
 		 143 aa  107  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3028  WxcM domain-containing protein  39.34 
 
 		 143 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.437654  normal  0.160839 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1300  WxcM domain protein domain protein  37.6 
 
 		 131 aa  102  7e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3422  WxcM-like  37.98 
 
 		 136 aa  102  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0396977  normal  0.668724 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0973  hexapaptide repeat-containing transferase  36.81 
 
 		 160 aa  100  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0161902  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6224  transferase hexapeptide repeat containing protein  43.57 
 
 		 168 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.164318 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0605  hexapaptide repeat-containing transferase  49.17 
 
 		 227 aa  99.8  6e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.51526  normal  0.572168 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2309  WxcM domain-containing protein  38.79 
 
 		 136 aa  98.2  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.132972 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1190  WxcM domain-containing protein  39.34 
 
 		 137 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.432823  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3195  transferase hexapeptide repeat protein  37.5 
 
 		 175 aa  97.8  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1066  transferase hexapeptide repeat  36.81 
 
 		 175 aa  97.1  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3191  WxcM domain-containing protein  36.72 
 
 		 138 aa  96.7  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1289  WxcM domain-containing protein  33.83 
 
 		 138 aa  95.9  7e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00150  hypothetical protein  35.88 
 
 		 138 aa  95.9  7e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4052  putative acetyltransferase  39.33 
 
 		 198 aa  95.5  9e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6420  transferase hexapeptide repeat containing protein  42.45 
 
 		 167 aa  95.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.45706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2036  transferase hexapeptide repeat containing protein  43.28 
 
 		 193 aa  94.7  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.327248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3038  hexapaptide repeat-containing transferase  37.25 
 
 		 169 aa  94.4  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1400  WxcM domain-containing protein  37.7 
 
 		 132 aa  94  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5179  transferase hexapeptide repeat containing protein  44.17 
 
 		 192 aa  94  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.781731  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1396  acetyltransferase  39.31 
 
 		 159 aa  94  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21040  N-acetylglucosamine-1-phosphate uridylyltransferase/acetyltransferase  34.73 
 
 		 228 aa  93.6  4e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.94293  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1136  acetyltransferase  39.1 
 
 		 240 aa  92.8  8e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0120  hexapaptide repeat-containing transferase  41.04 
 
 		 221 aa  92.4  8e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0636  WxcM domain protein  38.46 
 
 		 136 aa  92  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.72572 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4804  hexapaptide repeat-containing transferase  37.5 
 
 		 166 aa  92  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.159641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2425  putative acetyltransferase  37.41 
 
 		 194 aa  91.3  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0318047 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2242  WxcM domain-containing protein  34.4 
 
 		 130 aa  90.5  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0803  acetyl/acyl transferase related protein  47.06 
 
 		 212 aa  89.7  6e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4612  hexapaptide repeat-containing transferase  34.97 
 
 		 182 aa  89.4  7e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.796744  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1424  hypothetical protein  42 
 
 		 138 aa  89  9e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0167  hexapaptide repeat-containing transferase  38.13 
 
 		 254 aa  89  9e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.290287  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1029  hexapaptide repeat-containing transferase  40.71 
 
 		 252 aa  88.6  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2143  hexapaptide repeat-containing transferase  42.24 
 
 		 198 aa  88.2  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.748162 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2232  hexapaptide repeat-containing transferase  43.48 
 
 		 199 aa  87  4e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1480  hexapaptide repeat-containing transferase  40.77 
 
 		 251 aa  86.7  5e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1022  hexapaptide repeat-containing transferase  42.19 
 
 		 251 aa  86.7  5e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0413  acetyl/acyl transferase related protein  42.37 
 
 		 230 aa  86.7  5e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0476  hexapaptide repeat-containing transferase  39.22 
 
 		 193 aa  85.9  8e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.269907  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0251  WxcM domain protein domain protein  36.75 
 
 		 127 aa  85.9  9e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124345  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>