34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_3028 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_3028  WxcM domain-containing protein  100 
 
 		 143 aa  299  8.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.437654  normal  0.160839 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1300  WxcM domain protein domain protein  64 
 
 		 131 aa  176  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1400  WxcM domain-containing protein  60.94 
 
 		 132 aa  168  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1784  WxcM domain protein  58.4 
 
 		 134 aa  160  4.0000000000000004e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0636  WxcM domain protein  50.78 
 
 		 136 aa  150  8e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.72572 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00207  NDP-hexose isomerase  49.26 
 
 		 143 aa  144  4.0000000000000006e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1699  WxcM domain-containing protein  46.92 
 
 		 136 aa  130  5e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2242  WxcM domain-containing protein  44.09 
 
 		 130 aa  119  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0690  WxcM-like  41.86 
 
 		 313 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1289  WxcM domain-containing protein  46.03 
 
 		 138 aa  118  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3191  WxcM domain-containing protein  45.45 
 
 		 138 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0251  WxcM domain protein domain protein  45.38 
 
 		 127 aa  114  5e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1190  WxcM domain-containing protein  40.6 
 
 		 137 aa  114  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.432823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3422  WxcM-like  41.67 
 
 		 136 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0396977  normal  0.668724 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2940  WxcM domain protein  40.77 
 
 		 145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00150  hypothetical protein  42.74 
 
 		 138 aa  111  3e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2659  WxcM-like protein  39.23 
 
 		 304 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3930  WxcM domain-containing protein  41.8 
 
 		 317 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.505027  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2772  WxcM domain-containing protein  43.75 
 
 		 156 aa  108  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522279 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2309  WxcM domain-containing protein  45.31 
 
 		 136 aa  108  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.132972 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1238  WxcM-like  39.53 
 
 		 312 aa  108  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.219256  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1609  WxcM domain protein  39.5 
 
 		 310 aa  106  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.875347  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1324  WxcM-like protein  39.84 
 
 		 309 aa  106  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1070  lipopolysaccharide biosynthesis protein  39.34 
 
 		 316 aa  103  8e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710053  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1424  hypothetical protein  44.12 
 
 		 138 aa  101  3e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0404  WxcM domain protein  38.84 
 
 		 124 aa  99  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.461118 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0692  WxcM domain-containing protein  38.26 
 
 		 315 aa  98.2  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2509  hypothetical protein  37.4 
 
 		 134 aa  91.7  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3416  WxcM domain protein  36.44 
 
 		 131 aa  88.2  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0289  WxcM domain protein  37.38 
 
 		 135 aa  82.4  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.213456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1550  WxcM domain protein  32.52 
 
 		 122 aa  75.1  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.657767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7034  WxcM domain protein domain protein  30 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2485  hypothetical protein  37.5 
 
 		 118 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1110  WxcM domain protein  27.66 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>