34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3191 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_3191  WxcM domain-containing protein  100 
 
 
138 aa  286  6e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1289  WxcM domain-containing protein  76.47 
 
 
138 aa  220  4.9999999999999996e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3422  WxcM-like  68.61 
 
 
136 aa  202  1e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0396977  normal  0.668724 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1699  WxcM domain-containing protein  65.44 
 
 
136 aa  197  3e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2940  WxcM domain protein  67.67 
 
 
145 aa  192  1e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2309  WxcM domain-containing protein  64.71 
 
 
136 aa  179  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.132972 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2242  WxcM domain-containing protein  53.91 
 
 
130 aa  150  7e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1190  WxcM domain-containing protein  54.48 
 
 
137 aa  150  8e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.432823  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00150  hypothetical protein  52.34 
 
 
138 aa  144  4.0000000000000006e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1424  hypothetical protein  50.39 
 
 
138 aa  129  1.0000000000000001e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3028  WxcM domain-containing protein  45.45 
 
 
143 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.437654  normal  0.160839 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1300  WxcM domain protein domain protein  45.6 
 
 
131 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1324  WxcM-like protein  41.6 
 
 
309 aa  106  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0636  WxcM domain protein  39.17 
 
 
136 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.72572 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00207  NDP-hexose isomerase  43.09 
 
 
143 aa  104  5e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1784  WxcM domain protein  39.37 
 
 
134 aa  103  9e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1609  WxcM domain protein  38.97 
 
 
310 aa  102  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.875347  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1238  WxcM-like  39.52 
 
 
312 aa  101  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.219256  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0690  WxcM-like  41.94 
 
 
313 aa  101  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3930  WxcM domain-containing protein  40.32 
 
 
317 aa  100  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.505027  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1400  WxcM domain-containing protein  41.09 
 
 
132 aa  100  8e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1070  lipopolysaccharide biosynthesis protein  36.72 
 
 
316 aa  96.7  9e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710053  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0692  WxcM domain-containing protein  38.1 
 
 
315 aa  95.9  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253812  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2772  WxcM domain-containing protein  37.4 
 
 
156 aa  95.5  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.522279 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2509  hypothetical protein  43.52 
 
 
134 aa  92.4  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2659  WxcM-like protein  39.32 
 
 
304 aa  90.9  5e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0251  WxcM domain protein domain protein  40.17 
 
 
127 aa  85.9  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124345  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0404  WxcM domain protein  34.71 
 
 
124 aa  75.9  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.461118 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3416  WxcM domain protein  33.33 
 
 
131 aa  69.3  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0289  WxcM domain protein  33.33 
 
 
135 aa  67.8  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.213456  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2485  hypothetical protein  46.03 
 
 
118 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1550  WxcM domain protein  33.91 
 
 
122 aa  61.2  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.657767  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7034  WxcM domain protein domain protein  33.33 
 
 
140 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1423  hypothetical protein  28.7 
 
 
115 aa  41.2  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>