32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1424 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1424  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  282  1.0000000000000001e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1289  WxcM domain-containing protein  49.58 
 
 		 138 aa  134  4e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3422  WxcM-like  49.23 
 
 		 136 aa  133  6.0000000000000005e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0396977  normal  0.668724 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1699  WxcM domain-containing protein  50.78 
 
 		 136 aa  132  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2242  WxcM domain-containing protein  57.14 
 
 		 130 aa  131  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3191  WxcM domain-containing protein  50.39 
 
 		 138 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00150  hypothetical protein  48.74 
 
 		 138 aa  119  1.9999999999999998e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2940  WxcM domain protein  43.2 
 
 		 145 aa  114  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1300  WxcM domain protein domain protein  47.37 
 
 		 131 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2309  WxcM domain-containing protein  47.9 
 
 		 136 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.132972 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1400  WxcM domain-containing protein  49.5 
 
 		 132 aa  108  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1190  WxcM domain-containing protein  38.66 
 
 		 137 aa  107  6e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.432823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2509  hypothetical protein  47.17 
 
 		 134 aa  101  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3028  WxcM domain-containing protein  44.12 
 
 		 143 aa  101  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.437654  normal  0.160839 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00207  NDP-hexose isomerase  40.19 
 
 		 143 aa  100  7e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2772  WxcM domain-containing protein  37.84 
 
 		 156 aa  99.8  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522279 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2659  WxcM-like protein  41.9 
 
 		 304 aa  95.5  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1784  WxcM domain protein  46.08 
 
 		 134 aa  95.5  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3930  WxcM domain-containing protein  43 
 
 		 317 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.505027  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0636  WxcM domain protein  36.75 
 
 		 136 aa  94  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.72572 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1609  WxcM domain protein  40.95 
 
 		 310 aa  93.6  9e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.875347  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0692  WxcM domain-containing protein  42.72 
 
 		 315 aa  91.7  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253812  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1070  lipopolysaccharide biosynthesis protein  42 
 
 		 316 aa  89  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710053  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0690  WxcM-like  41.18 
 
 		 313 aa  88.6  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1238  WxcM-like  35.29 
 
 		 312 aa  86.3  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.219256  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1324  WxcM-like protein  39.05 
 
 		 309 aa  85.9  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0251  WxcM domain protein domain protein  39.18 
 
 		 127 aa  84.3  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0404  WxcM domain protein  40.62 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.461118 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3416  WxcM domain protein  32.99 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2485  hypothetical protein  42.68 
 
 		 118 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0289  WxcM domain protein  28.87 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.213456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7034  WxcM domain protein domain protein  33.33 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>