33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0636 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0636  WxcM domain protein  100 
 
 		 136 aa  285  1e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.72572 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1300  WxcM domain protein domain protein  55.56 
 
 		 131 aa  158  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3028  WxcM domain-containing protein  50.78 
 
 		 143 aa  150  8e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.437654  normal  0.160839 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1400  WxcM domain-containing protein  47.62 
 
 		 132 aa  140  7e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00207  NDP-hexose isomerase  49.21 
 
 		 143 aa  135  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1784  WxcM domain protein  44.7 
 
 		 134 aa  124  6e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1609  WxcM domain protein  44.62 
 
 		 310 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.875347  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1699  WxcM domain-containing protein  40.6 
 
 		 136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1324  WxcM-like protein  40.6 
 
 		 309 aa  114  5e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0692  WxcM domain-containing protein  47.9 
 
 		 315 aa  111  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1289  WxcM domain-containing protein  37.12 
 
 		 138 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3191  WxcM domain-containing protein  39.17 
 
 		 138 aa  105  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00150  hypothetical protein  43.1 
 
 		 138 aa  104  5e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0690  WxcM-like  40.8 
 
 		 313 aa  103  7e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2242  WxcM domain-containing protein  36.15 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1190  WxcM domain-containing protein  37.9 
 
 		 137 aa  102  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.432823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2772  WxcM domain-containing protein  39.83 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522279 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2659  WxcM-like protein  39.84 
 
 		 304 aa  101  4e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3422  WxcM-like  35.61 
 
 		 136 aa  100  8e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0396977  normal  0.668724 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3930  WxcM domain-containing protein  40.17 
 
 		 317 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.505027  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2309  WxcM domain-containing protein  39.66 
 
 		 136 aa  95.5  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.132972 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1424  hypothetical protein  36.75 
 
 		 138 aa  94  6e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1238  WxcM-like  40.35 
 
 		 312 aa  94  7e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.219256  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0251  WxcM domain protein domain protein  38.79 
 
 		 127 aa  92  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124345  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1070  lipopolysaccharide biosynthesis protein  38.46 
 
 		 316 aa  92  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710053  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2940  WxcM domain protein  34.85 
 
 		 145 aa  87  7e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0404  WxcM domain protein  37.93 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.461118 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2509  hypothetical protein  33.33 
 
 		 134 aa  79.3  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3416  WxcM domain protein  34.48 
 
 		 131 aa  77.8  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0289  WxcM domain protein  34.29 
 
 		 135 aa  77.8  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.213456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7034  WxcM domain protein domain protein  33.05 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2485  hypothetical protein  40 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1550  WxcM domain protein  23.08 
 
 		 122 aa  42.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.657767  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>