33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1300 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1300  WxcM domain protein domain protein  100 
 
 		 131 aa  270  7e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3028  WxcM domain-containing protein  64 
 
 		 143 aa  176  9e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.437654  normal  0.160839 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00207  NDP-hexose isomerase  58.27 
 
 		 143 aa  167  7e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0636  WxcM domain protein  55.56 
 
 		 136 aa  158  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.72572 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1400  WxcM domain-containing protein  59.2 
 
 		 132 aa  157  5e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1784  WxcM domain protein  52.76 
 
 		 134 aa  144  4.0000000000000006e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1699  WxcM domain-containing protein  50 
 
 		 136 aa  130  9e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00150  hypothetical protein  49.12 
 
 		 138 aa  115  9.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2242  WxcM domain-containing protein  44.27 
 
 		 130 aa  115  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1424  hypothetical protein  47.37 
 
 		 138 aa  114  3.9999999999999997e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1289  WxcM domain-containing protein  44.44 
 
 		 138 aa  113  7.999999999999999e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1190  WxcM domain-containing protein  42.86 
 
 		 137 aa  110  5e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.432823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3191  WxcM domain-containing protein  45.6 
 
 		 138 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1238  WxcM-like  44.74 
 
 		 312 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.219256  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3422  WxcM-like  46.03 
 
 		 136 aa  106  9.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0396977  normal  0.668724 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2940  WxcM domain protein  43.55 
 
 		 145 aa  106  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1609  WxcM domain protein  44.35 
 
 		 310 aa  105  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.875347  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0690  WxcM-like  42.61 
 
 		 313 aa  105  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3930  WxcM domain-containing protein  39.52 
 
 		 317 aa  104  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.505027  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1070  lipopolysaccharide biosynthesis protein  37.6 
 
 		 316 aa  102  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710053  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0251  WxcM domain protein domain protein  43.1 
 
 		 127 aa  102  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0692  WxcM domain-containing protein  38.89 
 
 		 315 aa  101  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1324  WxcM-like protein  37.6 
 
 		 309 aa  97.4  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2309  WxcM domain-containing protein  41.23 
 
 		 136 aa  96.3  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.132972 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2659  WxcM-like protein  39.52 
 
 		 304 aa  95.5  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2772  WxcM domain-containing protein  38.46 
 
 		 156 aa  95.1  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522279 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2509  hypothetical protein  39.34 
 
 		 134 aa  88.2  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3416  WxcM domain protein  38.79 
 
 		 131 aa  86.3  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0289  WxcM domain protein  36.22 
 
 		 135 aa  81.3  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.213456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0404  WxcM domain protein  37.07 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.461118 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7034  WxcM domain protein domain protein  29.27 
 
 		 140 aa  62  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1550  WxcM domain protein  29.91 
 
 		 122 aa  50.8  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.657767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2485  hypothetical protein  36.67 
 
 		 118 aa  47.8  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>