34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1699 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1699  WxcM domain-containing protein  100 
 
 
136 aa  285  1e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3191  WxcM domain-containing protein  65.44 
 
 
138 aa  197  3e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1289  WxcM domain-containing protein  61.76 
 
 
138 aa  194  3e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2940  WxcM domain protein  65.15 
 
 
145 aa  187  5e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3422  WxcM-like  61.76 
 
 
136 aa  187  5e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0396977  normal  0.668724 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2242  WxcM domain-containing protein  61.42 
 
 
130 aa  175  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2309  WxcM domain-containing protein  61.94 
 
 
136 aa  173  9e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.132972 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1190  WxcM domain-containing protein  60 
 
 
137 aa  156  7e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.432823  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00150  hypothetical protein  52.89 
 
 
138 aa  146  8e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1424  hypothetical protein  50.78 
 
 
138 aa  132  9.999999999999999e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3028  WxcM domain-containing protein  46.92 
 
 
143 aa  130  5e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.437654  normal  0.160839 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1300  WxcM domain protein domain protein  50 
 
 
131 aa  130  9e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1400  WxcM domain-containing protein  47.58 
 
 
132 aa  123  9e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1609  WxcM domain protein  48.41 
 
 
310 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.875347  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0690  WxcM-like  45.45 
 
 
313 aa  117  7e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1238  WxcM-like  46.22 
 
 
312 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.219256  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0636  WxcM domain protein  40.6 
 
 
136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.72572 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3930  WxcM domain-containing protein  44.44 
 
 
317 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.505027  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1070  lipopolysaccharide biosynthesis protein  47.01 
 
 
316 aa  114  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710053  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00207  NDP-hexose isomerase  42.11 
 
 
143 aa  114  6e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0692  WxcM domain-containing protein  45.53 
 
 
315 aa  113  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253812  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1784  WxcM domain protein  42.15 
 
 
134 aa  111  3e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1324  WxcM-like protein  42.19 
 
 
309 aa  110  5e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2659  WxcM-like protein  43.33 
 
 
304 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2509  hypothetical protein  45.38 
 
 
134 aa  105  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2772  WxcM domain-containing protein  41.18 
 
 
156 aa  103  9e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.522279 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0251  WxcM domain protein domain protein  40 
 
 
127 aa  87  8e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124345  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0404  WxcM domain protein  37.5 
 
 
124 aa  86.3  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.461118 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0289  WxcM domain protein  36.59 
 
 
135 aa  78.2  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.213456  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3416  WxcM domain protein  35.65 
 
 
131 aa  76.3  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2485  hypothetical protein  39.74 
 
 
118 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7034  WxcM domain protein domain protein  34.17 
 
 
140 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1550  WxcM domain protein  35.04 
 
 
122 aa  56.2  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.657767  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1423  hypothetical protein  57.58 
 
 
115 aa  43.9  0.0007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>