More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1609 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1609  WxcM domain protein  100 
 
 		 310 aa  643    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.875347  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3930  WxcM domain-containing protein  62.95 
 
 		 317 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.505027  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1070  lipopolysaccharide biosynthesis protein  61.97 
 
 		 316 aa  418  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710053  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1324  WxcM-like protein  62.87 
 
 		 309 aa  417  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0692  WxcM domain-containing protein  59.74 
 
 		 315 aa  399  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0690  WxcM-like  58.36 
 
 		 313 aa  393  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2659  WxcM-like protein  57.24 
 
 		 304 aa  378  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1238  WxcM-like  55.88 
 
 		 312 aa  377  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.219256  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3027  WxcM-like protein  60.67 
 
 		 153 aa  189  4e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0683597  normal  0.28553 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1783  WxcM-like protein  54 
 
 		 171 aa  177  2e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1738  N-acetylglucosamine-1- phosphateuridyltransferase-like protein  54.3 
 
 		 201 aa  172  5.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1080  hexapaptide repeat-containing transferase  51.16 
 
 		 203 aa  167  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00205406  normal  0.0149533 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0895  hexapaptide repeat-containing transferase  52.29 
 
 		 202 aa  163  3e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1458  hexapaptide repeat-containing transferase  52.6 
 
 		 189 aa  159  5e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.532773  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0206  hexapaptide repeat-containing transferase  43.87 
 
 		 191 aa  154  2e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.238916  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0704  hexapeptide transferase family protein  44.44 
 
 		 194 aa  151  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000306748  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4761  transferase hexapeptide repeat containing protein  45.4 
 
 		 190 aa  150  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000053665  normal  0.125318 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1694  hypothetical protein  46.06 
 
 		 182 aa  149  5e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.373843  normal  0.731728 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1940  putative acetyltransferase  50.33 
 
 		 191 aa  148  9e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0357  transferase hexapeptide repeat containing protein  45.91 
 
 		 192 aa  145  9e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1692  hypothetical protein  48.05 
 
 		 182 aa  145  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.733433  decreased coverage  0.000199621 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0641  transferase hexapeptide repeat containing protein  43.48 
 
 		 192 aa  144  1e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.312071 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0577  transferase hexapeptide repeat containing protein  48.41 
 
 		 194 aa  144  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1122  hexapeptide repeat-containing transferase  47.4 
 
 		 517 aa  143  3e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0550  transferase hexapeptide repeat containing protein  49.03 
 
 		 193 aa  144  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.259438  normal  0.0248751 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1673  transferase hexapeptide repeat containing protein  46.15 
 
 		 192 aa  143  4e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.160587  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0893  NAD-dependent oxidoreductase  47.4 
 
 		 517 aa  142  6e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2258  putative acetyltransferase  43.27 
 
 		 193 aa  142  6e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0569631  hitchhiker  0.00196203 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0290  acetyltransferase  42.42 
 
 		 194 aa  142  7e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4289  putative acetyltransferase  42.22 
 
 		 197 aa  142  7e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.934275  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1820  hexapaptide repeat-containing transferase  47.4 
 
 		 187 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0002  hexapeptide transferase family protein  46.2 
 
 		 190 aa  140  1.9999999999999998e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00123717 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1985  transferase hexapeptide repeat containing protein  45.24 
 
 		 203 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0062564 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2008  hexapaptide repeat-containing transferase  41.85 
 
 		 186 aa  139  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.500963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2971  putative acetyltransferase  39.43 
 
 		 192 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.727659  normal  0.708619 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1928  transferase hexapeptide repeat containing protein  39.18 
 
 		 196 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.746546  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0246  hexapaptide repeat-containing transferase  43.29 
 
 		 193 aa  137  2e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.35108 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4429  hexapaptide repeat-containing transferase  43.23 
 
 		 207 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.520075 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0823  WbbJ protein  38.83 
 
 		 193 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0951  hexapaptide repeat-containing transferase  43.48 
 
 		 189 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0541  hexapaptide repeat-containing transferase  42.95 
 
 		 191 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1859  Serine acetyltransferase-like protein  39.31 
 
 		 194 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.127737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0871  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  42.31 
 
 		 189 aa  134  3e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3256  transferase hexapeptide repeat containing protein  39.1 
 
 		 236 aa  133  3e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1971  transferase hexapeptide repeat containing protein  42.21 
 
 		 207 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365375 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1421  hexapaptide repeat-containing transferase  41.67 
 
 		 192 aa  133  5e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3315  hexapaptide repeat-containing transferase  44.52 
 
 		 196 aa  131  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.711982 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0783  hexapaptide repeat-containing transferase  41.67 
 
 		 212 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.989182  normal  0.702768 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1724  hexapaptide repeat-containing transferase  39.66 
 
 		 182 aa  129  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1298  putative acetyltransferase  43.48 
 
 		 207 aa  130  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.248019  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3128  putative acetyltransferase WbpD  41.67 
 
 		 194 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0038  transferase hexapeptide repeat containing protein  42.86 
 
 		 196 aa  125  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1509  transferase hexapeptide repeat containing protein  43.23 
 
 		 214 aa  122  8e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2875  hexapaptide repeat-containing transferase  46.85 
 
 		 159 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3016  putative acetyltransferase  39.52 
 
 		 215 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1699  WxcM domain-containing protein  48.41 
 
 		 136 aa  119  7.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6855  transferase hexapeptide repeat containing protein  45.16 
 
 		 197 aa  118  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0929755 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0636  WxcM domain protein  44.62 
 
 		 136 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.72572 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3422  WxcM-like  42.64 
 
 		 136 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0396977  normal  0.668724 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5772  transferase hexapeptide repeat containing protein  45.03 
 
 		 168 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1784  WxcM domain protein  40.94 
 
 		 134 aa  112  9e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0973  hexapaptide repeat-containing transferase  42.25 
 
 		 160 aa  109  6e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0161902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1066  transferase hexapeptide repeat  37.87 
 
 		 175 aa  108  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3195  transferase hexapeptide repeat protein  38.46 
 
 		 175 aa  108  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3028  WxcM domain-containing protein  39.5 
 
 		 143 aa  106  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.437654  normal  0.160839 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1400  WxcM domain-containing protein  45.3 
 
 		 132 aa  106  5e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1300  WxcM domain protein domain protein  44.35 
 
 		 131 aa  105  9e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2309  WxcM domain-containing protein  42.2 
 
 		 136 aa  102  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.132972 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0413  acetyl/acyl transferase related protein  39.57 
 
 		 230 aa  102  7e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3191  WxcM domain-containing protein  38.97 
 
 		 138 aa  102  8e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0605  hexapaptide repeat-containing transferase  43.66 
 
 		 227 aa  102  9e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.51526  normal  0.572168 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1396  acetyltransferase  40.94 
 
 		 159 aa  101  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6224  transferase hexapeptide repeat containing protein  44.53 
 
 		 168 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.164318 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0120  hexapaptide repeat-containing transferase  40.97 
 
 		 221 aa  101  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1289  WxcM domain-containing protein  37.21 
 
 		 138 aa  101  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1136  acetyltransferase  42.65 
 
 		 240 aa  100  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21040  N-acetylglucosamine-1-phosphate uridylyltransferase/acetyltransferase  39.87 
 
 		 228 aa  100  4e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.94293  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6420  transferase hexapeptide repeat containing protein  44.85 
 
 		 167 aa  100  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.45706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4052  putative acetyltransferase  41.06 
 
 		 198 aa  99.4  7e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4804  hexapaptide repeat-containing transferase  41.21 
 
 		 166 aa  99.4  8e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.159641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1190  WxcM domain-containing protein  38.84 
 
 		 137 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.432823  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2940  WxcM domain protein  38.58 
 
 		 145 aa  97.4  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3038  hexapaptide repeat-containing transferase  38.73 
 
 		 169 aa  97.1  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2425  putative acetyltransferase  42.57 
 
 		 194 aa  96.3  7e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0318047 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00207  NDP-hexose isomerase  40.52 
 
 		 143 aa  95.9  8e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1029  hexapaptide repeat-containing transferase  40 
 
 		 252 aa  95.5  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2688  transferase hexapeptide repeat containing protein  36.94 
 
 		 198 aa  94.4  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00225103  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1424  hypothetical protein  40.95 
 
 		 138 aa  93.6  4e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4612  hexapaptide repeat-containing transferase  36.07 
 
 		 182 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.796744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3687  hexapaptide repeat-containing transferase  43.29 
 
 		 174 aa  93.2  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.222409 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2242  WxcM domain-containing protein  40.38 
 
 		 130 aa  93.2  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4209  putative acetyltransferase  37.04 
 
 		 198 aa  92.4  9e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0813  transferase hexapeptide repeat containing protein  37.78 
 
 		 198 aa  92  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.434904  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00150  hypothetical protein  34.06 
 
 		 138 aa  91.7  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2036  transferase hexapeptide repeat containing protein  37.31 
 
 		 193 aa  91.7  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.327248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2772  WxcM domain-containing protein  37.5 
 
 		 156 aa  90.5  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522279 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5179  transferase hexapeptide repeat containing protein  39.17 
 
 		 192 aa  90.5  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.781731  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0803  acetyl/acyl transferase related protein  45.76 
 
 		 212 aa  90.1  4e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2232  hexapaptide repeat-containing transferase  44.07 
 
 		 199 aa  89.7  6e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2143  hexapaptide repeat-containing transferase  36.94 
 
 		 198 aa  89  8e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.748162 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>