33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_00150 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_00150  hypothetical protein  100 
 
 
138 aa  283  7e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2242  WxcM domain-containing protein  56.25 
 
 
130 aa  160  6e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1699  WxcM domain-containing protein  52.89 
 
 
136 aa  146  8e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2940  WxcM domain protein  50.77 
 
 
145 aa  144  3e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3191  WxcM domain-containing protein  52.34 
 
 
138 aa  144  4.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1289  WxcM domain-containing protein  47.76 
 
 
138 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3422  WxcM-like  44.96 
 
 
136 aa  128  3e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0396977  normal  0.668724 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1190  WxcM domain-containing protein  45.24 
 
 
137 aa  123  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.432823  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2309  WxcM domain-containing protein  49.15 
 
 
136 aa  120  7e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.132972 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1424  hypothetical protein  48.74 
 
 
138 aa  119  1.9999999999999998e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1300  WxcM domain protein domain protein  49.12 
 
 
131 aa  115  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3028  WxcM domain-containing protein  42.74 
 
 
143 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.437654  normal  0.160839 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0636  WxcM domain protein  43.1 
 
 
136 aa  104  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.72572 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0690  WxcM-like  41.67 
 
 
313 aa  103  7e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1400  WxcM domain-containing protein  40.31 
 
 
132 aa  102  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00207  NDP-hexose isomerase  42.24 
 
 
143 aa  100  6e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1238  WxcM-like  37.4 
 
 
312 aa  98.6  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.219256  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1070  lipopolysaccharide biosynthesis protein  35.88 
 
 
316 aa  95.9  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710053  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3930  WxcM domain-containing protein  36.09 
 
 
317 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.505027  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2659  WxcM-like protein  38.35 
 
 
304 aa  95.9  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2772  WxcM domain-containing protein  36.3 
 
 
156 aa  92.4  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.522279 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1324  WxcM-like protein  36.09 
 
 
309 aa  92.4  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1609  WxcM domain protein  34.06 
 
 
310 aa  91.7  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.875347  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0692  WxcM domain-containing protein  37.21 
 
 
315 aa  89.7  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253812  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1784  WxcM domain protein  38.6 
 
 
134 aa  87.8  4e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0251  WxcM domain protein domain protein  36.75 
 
 
127 aa  86.7  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124345  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2509  hypothetical protein  38.79 
 
 
134 aa  82.4  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3416  WxcM domain protein  36.79 
 
 
131 aa  77  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0404  WxcM domain protein  35.34 
 
 
124 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.461118 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0289  WxcM domain protein  31.13 
 
 
135 aa  62.8  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.213456  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2485  hypothetical protein  41.89 
 
 
118 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7034  WxcM domain protein domain protein  32.26 
 
 
140 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1550  WxcM domain protein  29.91 
 
 
122 aa  50.8  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.657767  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>