27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2485 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2485  hypothetical protein  100 
 
 		 118 aa  242  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2309  WxcM domain-containing protein  67.35 
 
 		 136 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.132972 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1699  WxcM domain-containing protein  39.74 
 
 		 136 aa  68.2  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1324  WxcM-like protein  50.94 
 
 		 309 aa  68.2  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1609  WxcM domain protein  52.83 
 
 		 310 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.875347  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1289  WxcM domain-containing protein  39.02 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3191  WxcM domain-containing protein  46.03 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3422  WxcM-like  46.03 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0396977  normal  0.668724 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1424  hypothetical protein  42.68 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2940  WxcM domain protein  46.88 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2242  WxcM domain-containing protein  47.62 
 
 		 130 aa  62.4  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00150  hypothetical protein  41.89 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3930  WxcM domain-containing protein  38.46 
 
 		 317 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.505027  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0692  WxcM domain-containing protein  42.86 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0690  WxcM-like  37.7 
 
 		 313 aa  57  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0636  WxcM domain protein  40 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.72572 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1400  WxcM domain-containing protein  40.62 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1238  WxcM-like  39.22 
 
 		 312 aa  52  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.219256  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1070  lipopolysaccharide biosynthesis protein  35.29 
 
 		 316 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710053  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1190  WxcM domain-containing protein  42.37 
 
 		 137 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.432823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2772  WxcM domain-containing protein  32.53 
 
 		 156 aa  47.8  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522279 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1300  WxcM domain protein domain protein  36.67 
 
 		 131 aa  47.8  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2659  WxcM-like protein  33.33 
 
 		 304 aa  44.3  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1784  WxcM domain protein  32.81 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00207  NDP-hexose isomerase  30 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3028  WxcM domain-containing protein  37.5 
 
 		 143 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.437654  normal  0.160839 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2509  hypothetical protein  40.38 
 
 		 134 aa  41.2  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>