34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2309 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_2309  WxcM domain-containing protein  100 
 
 
136 aa  285  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.132972 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3191  WxcM domain-containing protein  64.71 
 
 
138 aa  195  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1699  WxcM domain-containing protein  61.94 
 
 
136 aa  188  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3422  WxcM-like  59.26 
 
 
136 aa  182  1.0000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0396977  normal  0.668724 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1289  WxcM domain-containing protein  57.04 
 
 
138 aa  179  8.000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2940  WxcM domain protein  54.55 
 
 
145 aa  166  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2242  WxcM domain-containing protein  51.18 
 
 
130 aa  145  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1190  WxcM domain-containing protein  50.4 
 
 
137 aa  135  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.432823  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00150  hypothetical protein  48.46 
 
 
138 aa  133  9.999999999999999e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1424  hypothetical protein  48.84 
 
 
138 aa  125  1.0000000000000001e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0690  WxcM-like  45.16 
 
 
313 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1324  WxcM-like protein  42.19 
 
 
309 aa  122  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3028  WxcM domain-containing protein  45.31 
 
 
143 aa  120  4e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.437654  normal  0.160839 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1609  WxcM domain protein  44.26 
 
 
310 aa  120  6e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.875347  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1400  WxcM domain-containing protein  43.75 
 
 
132 aa  117  6e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3930  WxcM domain-containing protein  36.84 
 
 
317 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.505027  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1238  WxcM-like  40 
 
 
312 aa  111  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.219256  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1300  WxcM domain protein domain protein  42.74 
 
 
131 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1070  lipopolysaccharide biosynthesis protein  38.58 
 
 
316 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710053  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0636  WxcM domain protein  38.06 
 
 
136 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.72572 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1784  WxcM domain protein  40.48 
 
 
134 aa  107  8.000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0692  WxcM domain-containing protein  39.84 
 
 
315 aa  106  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253812  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2772  WxcM domain-containing protein  41.67 
 
 
156 aa  102  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.522279 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00207  NDP-hexose isomerase  38.76 
 
 
143 aa  100  8e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2485  hypothetical protein  68.25 
 
 
118 aa  99  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2659  WxcM-like protein  37.5 
 
 
304 aa  97.8  4e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2509  hypothetical protein  40.8 
 
 
134 aa  97.4  6e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0251  WxcM domain protein domain protein  38.26 
 
 
127 aa  81.6  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124345  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0404  WxcM domain protein  36.67 
 
 
124 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.461118 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0289  WxcM domain protein  32.76 
 
 
135 aa  65.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.213456  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7034  WxcM domain protein domain protein  35.78 
 
 
140 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3416  WxcM domain protein  29.57 
 
 
131 aa  61.6  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1550  WxcM domain protein  31.86 
 
 
122 aa  53.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.657767  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1423  hypothetical protein  29.91 
 
 
115 aa  46.6  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>