34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3422 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3422  WxcM-like  100 
 
 		 136 aa  283  5.999999999999999e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0396977  normal  0.668724 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3191  WxcM domain-containing protein  68.61 
 
 		 138 aa  202  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1289  WxcM domain-containing protein  65.44 
 
 		 138 aa  198  1.9999999999999998e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1699  WxcM domain-containing protein  61.76 
 
 		 136 aa  187  5e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2940  WxcM domain protein  59.85 
 
 		 145 aa  177  2.9999999999999997e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2309  WxcM domain-containing protein  59.26 
 
 		 136 aa  168  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.132972 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2242  WxcM domain-containing protein  51.97 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1424  hypothetical protein  49.23 
 
 		 138 aa  133  6.0000000000000005e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1190  WxcM domain-containing protein  50.4 
 
 		 137 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.432823  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00150  hypothetical protein  44.96 
 
 		 138 aa  128  3e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0690  WxcM-like  46.34 
 
 		 313 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1609  WxcM domain protein  42.64 
 
 		 310 aa  114  5e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.875347  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3028  WxcM domain-containing protein  41.67 
 
 		 143 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.437654  normal  0.160839 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1238  WxcM-like  43.65 
 
 		 312 aa  111  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.219256  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1400  WxcM domain-containing protein  45.31 
 
 		 132 aa  111  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1324  WxcM-like protein  41.35 
 
 		 309 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1300  WxcM domain protein domain protein  46.03 
 
 		 131 aa  106  9.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1784  WxcM domain protein  42.15 
 
 		 134 aa  105  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3930  WxcM domain-containing protein  39.53 
 
 		 317 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.505027  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00207  NDP-hexose isomerase  42.19 
 
 		 143 aa  104  4e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0692  WxcM domain-containing protein  40.8 
 
 		 315 aa  102  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253812  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1070  lipopolysaccharide biosynthesis protein  37.98 
 
 		 316 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710053  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2772  WxcM domain-containing protein  40.34 
 
 		 156 aa  100  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522279 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0636  WxcM domain protein  35.61 
 
 		 136 aa  100  8e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.72572 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2659  WxcM-like protein  39.39 
 
 		 304 aa  96.7  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2509  hypothetical protein  34.88 
 
 		 134 aa  84  6e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0251  WxcM domain protein domain protein  39.66 
 
 		 127 aa  77.4  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3416  WxcM domain protein  35.34 
 
 		 131 aa  70.9  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0404  WxcM domain protein  32.23 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.461118 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0289  WxcM domain protein  33.9 
 
 		 135 aa  67.4  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.213456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2485  hypothetical protein  46.03 
 
 		 118 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7034  WxcM domain protein domain protein  33.33 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1550  WxcM domain protein  28.93 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.657767  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1423  hypothetical protein  26.61 
 
 		 115 aa  42  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>