32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2772 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2772  WxcM domain-containing protein  100 
 
 
156 aa  321  3e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.522279 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1400  WxcM domain-containing protein  42.86 
 
 
132 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3028  WxcM domain-containing protein  43.75 
 
 
143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.437654  normal  0.160839 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1289  WxcM domain-containing protein  42.98 
 
 
138 aa  105  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1190  WxcM domain-containing protein  43.1 
 
 
137 aa  103  9e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.432823  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1699  WxcM domain-containing protein  41.18 
 
 
136 aa  103  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0636  WxcM domain protein  39.83 
 
 
136 aa  102  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.72572 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3422  WxcM-like  40.34 
 
 
136 aa  100  6e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0396977  normal  0.668724 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2940  WxcM domain protein  40.48 
 
 
145 aa  100  7e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1424  hypothetical protein  37.84 
 
 
138 aa  99.8  1e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2242  WxcM domain-containing protein  40.35 
 
 
130 aa  99.4  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2659  WxcM-like protein  34.72 
 
 
304 aa  98.2  4e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00207  NDP-hexose isomerase  40.77 
 
 
143 aa  97.8  5e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3191  WxcM domain-containing protein  37.4 
 
 
138 aa  95.5  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1300  WxcM domain protein domain protein  38.46 
 
 
131 aa  95.1  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1324  WxcM-like protein  35.51 
 
 
309 aa  94.7  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00150  hypothetical protein  36.3 
 
 
138 aa  92.4  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0690  WxcM-like  37.93 
 
 
313 aa  92  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1609  WxcM domain protein  37.5 
 
 
310 aa  90.5  8e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.875347  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0692  WxcM domain-containing protein  38.14 
 
 
315 aa  90.1  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253812  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1238  WxcM-like  37.39 
 
 
312 aa  89.4  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.219256  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2309  WxcM domain-containing protein  41.35 
 
 
136 aa  88.2  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.132972 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0251  WxcM domain protein domain protein  39.17 
 
 
127 aa  85.9  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124345  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1784  WxcM domain protein  33.91 
 
 
134 aa  85.1  4e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1070  lipopolysaccharide biosynthesis protein  35.83 
 
 
316 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710053  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3930  WxcM domain-containing protein  34.75 
 
 
317 aa  84.7  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.505027  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3416  WxcM domain protein  31.3 
 
 
131 aa  71.6  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2509  hypothetical protein  35.9 
 
 
134 aa  70.9  0.000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0404  WxcM domain protein  32.63 
 
 
124 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.461118 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0289  WxcM domain protein  29.2 
 
 
135 aa  63.2  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.213456  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2485  hypothetical protein  32.53 
 
 
118 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1550  WxcM domain protein  23.71 
 
 
122 aa  40.4  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.657767  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>