30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0289 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0289  WxcM domain protein  100 
 
 		 135 aa  284  2.9999999999999996e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.213456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3416  WxcM domain protein  63.85 
 
 		 131 aa  184  3e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0251  WxcM domain protein domain protein  48.33 
 
 		 127 aa  134  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0404  WxcM domain protein  47.86 
 
 		 124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.461118 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1550  WxcM domain protein  36.22 
 
 		 122 aa  84.7  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.657767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3028  WxcM domain-containing protein  37.38 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.437654  normal  0.160839 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1300  WxcM domain protein domain protein  36.22 
 
 		 131 aa  81.3  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1699  WxcM domain-containing protein  36.59 
 
 		 136 aa  78.2  0.00000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0636  WxcM domain protein  34.29 
 
 		 136 aa  77.8  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.72572 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2242  WxcM domain-containing protein  36.52 
 
 		 130 aa  77  0.00000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1400  WxcM domain-containing protein  31.09 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0690  WxcM-like  37.14 
 
 		 313 aa  72.8  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1609  WxcM domain protein  31.03 
 
 		 310 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.875347  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3930  WxcM domain-containing protein  33.33 
 
 		 317 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.505027  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1784  WxcM domain protein  35.24 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3191  WxcM domain-containing protein  33.33 
 
 		 138 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3422  WxcM-like  33.9 
 
 		 136 aa  67.4  0.00000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0396977  normal  0.668724 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2659  WxcM-like protein  38.1 
 
 		 304 aa  67  0.00000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0692  WxcM domain-containing protein  32.2 
 
 		 315 aa  65.9  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1190  WxcM domain-containing protein  33.91 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.432823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1238  WxcM-like  36.19 
 
 		 312 aa  65.5  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.219256  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1289  WxcM domain-containing protein  33.65 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1070  lipopolysaccharide biosynthesis protein  34.69 
 
 		 316 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710053  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2772  WxcM domain-containing protein  29.2 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522279 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00150  hypothetical protein  31.13 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2309  WxcM domain-containing protein  33.33 
 
 		 136 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.132972 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1324  WxcM-like protein  31.63 
 
 		 309 aa  60.8  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2940  WxcM domain protein  32.77 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00207  NDP-hexose isomerase  30.17 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1424  hypothetical protein  28.87 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>