More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0690 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0690  WxcM-like  100 
 
 		 313 aa  649    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1070  lipopolysaccharide biosynthesis protein  62.5 
 
 		 316 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710053  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3930  WxcM domain-containing protein  61.78 
 
 		 317 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.505027  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1609  WxcM domain protein  58.36 
 
 		 310 aa  393  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.875347  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1238  WxcM-like  59.49 
 
 		 312 aa  379  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.219256  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0692  WxcM domain-containing protein  59.42 
 
 		 315 aa  372  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2659  WxcM-like protein  59.47 
 
 		 304 aa  369  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1324  WxcM-like protein  56.35 
 
 		 309 aa  361  8e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3027  WxcM-like protein  56.38 
 
 		 153 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0683597  normal  0.28553 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1783  WxcM-like protein  53.99 
 
 		 171 aa  171  2e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1738  N-acetylglucosamine-1- phosphateuridyltransferase-like protein  46.37 
 
 		 201 aa  158  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1080  hexapaptide repeat-containing transferase  48.75 
 
 		 203 aa  149  6e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00205406  normal  0.0149533 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0895  hexapaptide repeat-containing transferase  51.95 
 
 		 202 aa  149  6e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1458  hexapaptide repeat-containing transferase  51.95 
 
 		 189 aa  147  3e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.532773  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0206  hexapaptide repeat-containing transferase  38.89 
 
 		 191 aa  144  2e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.238916  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1859  Serine acetyltransferase-like protein  43.4 
 
 		 194 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.127737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1673  transferase hexapeptide repeat containing protein  45.86 
 
 		 192 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.160587  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2008  hexapaptide repeat-containing transferase  51.37 
 
 		 186 aa  130  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.500963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0357  transferase hexapeptide repeat containing protein  45.51 
 
 		 192 aa  129  4.0000000000000003e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1724  hexapaptide repeat-containing transferase  48.65 
 
 		 182 aa  130  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0290  acetyltransferase  38.3 
 
 		 194 aa  129  5.0000000000000004e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1122  hexapeptide repeat-containing transferase  44.16 
 
 		 517 aa  127  3e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0246  hexapaptide repeat-containing transferase  38.59 
 
 		 193 aa  125  7e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.35108 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0893  NAD-dependent oxidoreductase  44.16 
 
 		 517 aa  125  7e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3256  transferase hexapeptide repeat containing protein  43.42 
 
 		 236 aa  125  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4289  putative acetyltransferase  46.62 
 
 		 197 aa  124  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.934275  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1820  hexapaptide repeat-containing transferase  43.42 
 
 		 187 aa  124  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1692  hypothetical protein  42.69 
 
 		 182 aa  124  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.733433  decreased coverage  0.000199621 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1694  hypothetical protein  40.94 
 
 		 182 aa  123  4e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.373843  normal  0.731728 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0823  WbbJ protein  39.75 
 
 		 193 aa  122  7e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2258  putative acetyltransferase  38.29 
 
 		 193 aa  122  7e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0569631  hitchhiker  0.00196203 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1298  putative acetyltransferase  44.93 
 
 		 207 aa  122  8e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.248019  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4761  transferase hexapeptide repeat containing protein  43.79 
 
 		 190 aa  121  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000053665  normal  0.125318 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0951  hexapaptide repeat-containing transferase  41.76 
 
 		 189 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0704  hexapeptide transferase family protein  37.97 
 
 		 194 aa  121  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000306748  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1985  transferase hexapeptide repeat containing protein  42.6 
 
 		 203 aa  120  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0062564 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0577  transferase hexapeptide repeat containing protein  43.79 
 
 		 194 aa  120  3e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3128  putative acetyltransferase WbpD  41.18 
 
 		 194 aa  120  3.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0002  hexapeptide transferase family protein  44.37 
 
 		 190 aa  119  7.999999999999999e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00123717 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4429  hexapaptide repeat-containing transferase  42.58 
 
 		 207 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.520075 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3028  WxcM domain-containing protein  41.86 
 
 		 143 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.437654  normal  0.160839 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1971  transferase hexapeptide repeat containing protein  41.46 
 
 		 207 aa  119  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365375 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1928  transferase hexapeptide repeat containing protein  42.76 
 
 		 196 aa  118  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.746546  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0783  hexapaptide repeat-containing transferase  41.1 
 
 		 212 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.989182  normal  0.702768 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1699  WxcM domain-containing protein  45.45 
 
 		 136 aa  117  3e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2971  putative acetyltransferase  40.13 
 
 		 192 aa  116  5e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.727659  normal  0.708619 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1940  putative acetyltransferase  42.24 
 
 		 191 aa  116  5e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3016  putative acetyltransferase  40 
 
 		 215 aa  116  6e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1421  hexapaptide repeat-containing transferase  37.2 
 
 		 192 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3422  WxcM-like  46.34 
 
 		 136 aa  115  7.999999999999999e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0396977  normal  0.668724 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3315  hexapaptide repeat-containing transferase  43.14 
 
 		 196 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.711982 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0038  transferase hexapeptide repeat containing protein  41.03 
 
 		 196 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0550  transferase hexapeptide repeat containing protein  41.61 
 
 		 193 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.259438  normal  0.0248751 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0641  transferase hexapeptide repeat containing protein  41.77 
 
 		 192 aa  114  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.312071 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0541  hexapaptide repeat-containing transferase  39.87 
 
 		 191 aa  114  3e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0871  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  42.95 
 
 		 189 aa  113  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2309  WxcM domain-containing protein  45.05 
 
 		 136 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.132972 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1289  WxcM domain-containing protein  43.09 
 
 		 138 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2940  WxcM domain protein  43.08 
 
 		 145 aa  109  7.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1784  WxcM domain protein  39.06 
 
 		 134 aa  107  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6420  transferase hexapeptide repeat containing protein  45.99 
 
 		 167 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.45706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1400  WxcM domain-containing protein  42.15 
 
 		 132 aa  107  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6224  transferase hexapeptide repeat containing protein  46.32 
 
 		 168 aa  106  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.164318 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1300  WxcM domain protein domain protein  42.61 
 
 		 131 aa  105  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2875  hexapaptide repeat-containing transferase  44.37 
 
 		 159 aa  105  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1509  transferase hexapeptide repeat containing protein  40.13 
 
 		 214 aa  103  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0636  WxcM domain protein  40.8 
 
 		 136 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.72572 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00150  hypothetical protein  41.67 
 
 		 138 aa  103  3e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3191  WxcM domain-containing protein  41.94 
 
 		 138 aa  101  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2242  WxcM domain-containing protein  41.32 
 
 		 130 aa  100  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00207  NDP-hexose isomerase  40.34 
 
 		 143 aa  96.7  5e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6855  transferase hexapeptide repeat containing protein  44.74 
 
 		 197 aa  96.3  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0929755 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4804  hexapaptide repeat-containing transferase  42.45 
 
 		 166 aa  95.5  9e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.159641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4612  hexapaptide repeat-containing transferase  38.1 
 
 		 182 aa  95.5  9e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.796744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0973  hexapaptide repeat-containing transferase  41.96 
 
 		 160 aa  95.5  9e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0161902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1396  acetyltransferase  40.67 
 
 		 159 aa  93.2  5e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21040  N-acetylglucosamine-1-phosphate uridylyltransferase/acetyltransferase  33.77 
 
 		 228 aa  93.2  5e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.94293  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2772  WxcM domain-containing protein  37.93 
 
 		 156 aa  92  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522279 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1066  transferase hexapeptide repeat  41.67 
 
 		 175 aa  91.7  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0251  WxcM domain protein domain protein  44.55 
 
 		 127 aa  91.7  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3195  transferase hexapeptide repeat protein  40.28 
 
 		 175 aa  90.9  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0167  hexapaptide repeat-containing transferase  43.09 
 
 		 254 aa  90.1  4e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.290287  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7631  putative acetyltransferase  34.21 
 
 		 206 aa  89.7  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.196092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1190  WxcM domain-containing protein  38.52 
 
 		 137 aa  89.7  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.432823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2143  hexapaptide repeat-containing transferase  43.59 
 
 		 198 aa  89.4  7e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.748162 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5772  transferase hexapeptide repeat containing protein  39.13 
 
 		 168 aa  89.4  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2425  putative acetyltransferase  37.41 
 
 		 194 aa  89.4  8e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0318047 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3038  hexapaptide repeat-containing transferase  37.66 
 
 		 169 aa  89.4  8e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1424  hypothetical protein  41.18 
 
 		 138 aa  88.6  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2688  transferase hexapeptide repeat containing protein  35.85 
 
 		 198 aa  87  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00225103  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2232  hexapaptide repeat-containing transferase  43.97 
 
 		 199 aa  87  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2036  transferase hexapeptide repeat containing protein  40.79 
 
 		 193 aa  87  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.327248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4052  putative acetyltransferase  36.24 
 
 		 198 aa  86.7  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0605  hexapaptide repeat-containing transferase  39.86 
 
 		 227 aa  86.3  7e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.51526  normal  0.572168 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1022  hexapaptide repeat-containing transferase  40.62 
 
 		 251 aa  85.9  8e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0169  hexapaptide repeat-containing transferase  38.31 
 
 		 254 aa  85.5  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0546103  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0120  hexapaptide repeat-containing transferase  40.52 
 
 		 221 aa  85.1  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2509  hypothetical protein  37.5 
 
 		 134 aa  84.3  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1136  acetyltransferase  39.84 
 
 		 240 aa  84  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0813  transferase hexapeptide repeat containing protein  41.88 
 
 		 198 aa  82.4  0.000000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.434904  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>