33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2242 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2242  WxcM domain-containing protein  100 
 
 
130 aa  263  5.999999999999999e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1699  WxcM domain-containing protein  61.42 
 
 
136 aa  175  2e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00150  hypothetical protein  56.25 
 
 
138 aa  160  6e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3191  WxcM domain-containing protein  53.91 
 
 
138 aa  150  7e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1289  WxcM domain-containing protein  51.22 
 
 
138 aa  148  3e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3422  WxcM-like  51.97 
 
 
136 aa  142  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0396977  normal  0.668724 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2940  WxcM domain protein  51.54 
 
 
145 aa  137  6e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1190  WxcM domain-containing protein  46.83 
 
 
137 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.432823  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1424  hypothetical protein  57.14 
 
 
138 aa  131  3e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2309  WxcM domain-containing protein  51.79 
 
 
136 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.132972 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3028  WxcM domain-containing protein  44.09 
 
 
143 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.437654  normal  0.160839 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1300  WxcM domain protein domain protein  44.27 
 
 
131 aa  115  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1400  WxcM domain-containing protein  43.44 
 
 
132 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2509  hypothetical protein  45.76 
 
 
134 aa  102  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0636  WxcM domain protein  36.15 
 
 
136 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.72572 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0690  WxcM-like  41.32 
 
 
313 aa  100  8e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0692  WxcM domain-containing protein  35.71 
 
 
315 aa  99.8  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253812  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00207  NDP-hexose isomerase  37.17 
 
 
143 aa  100  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1784  WxcM domain protein  42.73 
 
 
134 aa  99.4  2e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2772  WxcM domain-containing protein  40.35 
 
 
156 aa  99.4  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.522279 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0251  WxcM domain protein domain protein  41.74 
 
 
127 aa  94.7  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124345  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3930  WxcM domain-containing protein  36.75 
 
 
317 aa  94  6e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.505027  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1609  WxcM domain protein  40.38 
 
 
310 aa  93.2  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.875347  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1238  WxcM-like  35.43 
 
 
312 aa  93.2  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.219256  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1070  lipopolysaccharide biosynthesis protein  34.4 
 
 
316 aa  90.5  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710053  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2659  WxcM-like protein  35.66 
 
 
304 aa  88.6  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1324  WxcM-like protein  33.33 
 
 
309 aa  88.6  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0404  WxcM domain protein  39 
 
 
124 aa  86.3  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.461118 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3416  WxcM domain protein  39.42 
 
 
131 aa  78.6  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0289  WxcM domain protein  36.52 
 
 
135 aa  77  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.213456  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2485  hypothetical protein  47.62 
 
 
118 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1550  WxcM domain protein  30.36 
 
 
122 aa  53.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.657767  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7034  WxcM domain protein domain protein  29.2 
 
 
140 aa  47  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>