More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1859 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1859  Serine acetyltransferase-like protein  100 
 
 		 194 aa  402  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.127737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3016  putative acetyltransferase  81.28 
 
 		 215 aa  325  4.0000000000000003e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0823  WbbJ protein  79.47 
 
 		 193 aa  323  8.000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3128  putative acetyltransferase WbpD  80.53 
 
 		 194 aa  322  2e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0246  hexapaptide repeat-containing transferase  74.87 
 
 		 193 aa  310  7.999999999999999e-84  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.35108 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2971  putative acetyltransferase  69.47 
 
 		 192 aa  294  5e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.727659  normal  0.708619 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1928  transferase hexapeptide repeat containing protein  70.1 
 
 		 196 aa  293  1e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.746546  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2258  putative acetyltransferase  70.9 
 
 		 193 aa  291  5e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0569631  hitchhiker  0.00196203 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0290  acetyltransferase  67.37 
 
 		 194 aa  271  3e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0951  hexapaptide repeat-containing transferase  70.27 
 
 		 189 aa  272  3e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1298  putative acetyltransferase  58.92 
 
 		 207 aa  241  5e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.248019  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0577  transferase hexapeptide repeat containing protein  60.64 
 
 		 194 aa  231  4.0000000000000004e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0783  hexapaptide repeat-containing transferase  62.43 
 
 		 212 aa  227  7e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.989182  normal  0.702768 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4429  hexapaptide repeat-containing transferase  62.09 
 
 		 207 aa  226  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.520075 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1820  hexapaptide repeat-containing transferase  64.85 
 
 		 187 aa  225  3e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1673  transferase hexapeptide repeat containing protein  58.16 
 
 		 192 aa  225  3e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.160587  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1971  transferase hexapeptide repeat containing protein  61.33 
 
 		 207 aa  224  5.0000000000000005e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365375 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3315  hexapaptide repeat-containing transferase  59.89 
 
 		 196 aa  221  6e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.711982 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3256  transferase hexapeptide repeat containing protein  52.88 
 
 		 236 aa  218  6e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1985  transferase hexapeptide repeat containing protein  60.34 
 
 		 203 aa  215  2.9999999999999998e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0062564 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0357  transferase hexapeptide repeat containing protein  62.65 
 
 		 192 aa  214  4e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0541  hexapaptide repeat-containing transferase  53.93 
 
 		 191 aa  208  3e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4761  transferase hexapeptide repeat containing protein  53.68 
 
 		 190 aa  208  5e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000053665  normal  0.125318 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0893  NAD-dependent oxidoreductase  53.33 
 
 		 517 aa  205  3e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0871  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  52.13 
 
 		 189 aa  205  4e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1122  hexapeptide repeat-containing transferase  52.78 
 
 		 517 aa  203  2e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0002  hexapeptide transferase family protein  53.98 
 
 		 190 aa  199  1.9999999999999998e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00123717 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1421  hexapaptide repeat-containing transferase  50.27 
 
 		 192 aa  199  1.9999999999999998e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0704  hexapeptide transferase family protein  52.75 
 
 		 194 aa  199  1.9999999999999998e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000306748  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6855  transferase hexapeptide repeat containing protein  64.2 
 
 		 197 aa  196  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0929755 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0550  transferase hexapeptide repeat containing protein  51.58 
 
 		 193 aa  194  5.000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.259438  normal  0.0248751 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1509  transferase hexapeptide repeat containing protein  55.25 
 
 		 214 aa  185  5e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0641  transferase hexapeptide repeat containing protein  48.95 
 
 		 192 aa  176  1e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.312071 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0895  hexapaptide repeat-containing transferase  47.4 
 
 		 202 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1694  hypothetical protein  49.68 
 
 		 182 aa  164  5.9999999999999996e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.373843  normal  0.731728 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1692  hypothetical protein  49.68 
 
 		 182 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.733433  decreased coverage  0.000199621 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1458  hexapaptide repeat-containing transferase  51.23 
 
 		 189 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.532773  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4289  putative acetyltransferase  49.7 
 
 		 197 aa  160  7e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.934275  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1940  putative acetyltransferase  50.92 
 
 		 191 aa  158  4e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0206  hexapaptide repeat-containing transferase  48.15 
 
 		 191 aa  153  1e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.238916  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2008  hexapaptide repeat-containing transferase  47.27 
 
 		 186 aa  150  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.500963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7631  putative acetyltransferase  41.67 
 
 		 206 aa  150  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.196092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1724  hexapaptide repeat-containing transferase  46.63 
 
 		 182 aa  149  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1080  hexapaptide repeat-containing transferase  41.76 
 
 		 203 aa  148  4e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00205406  normal  0.0149533 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1738  N-acetylglucosamine-1- phosphateuridyltransferase-like protein  45.4 
 
 		 201 aa  145  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21040  N-acetylglucosamine-1-phosphate uridylyltransferase/acetyltransferase  39.58 
 
 		 228 aa  144  1e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.94293  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0038  transferase hexapeptide repeat containing protein  45.12 
 
 		 196 aa  140  9e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1070  lipopolysaccharide biosynthesis protein  41.28 
 
 		 316 aa  137  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710053  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4209  putative acetyltransferase  41.49 
 
 		 198 aa  136  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2688  transferase hexapeptide repeat containing protein  40.21 
 
 		 198 aa  136  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00225103  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1609  WxcM domain protein  39.31 
 
 		 310 aa  134  9e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.875347  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4052  putative acetyltransferase  41.99 
 
 		 198 aa  134  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1783  WxcM-like protein  44.74 
 
 		 171 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3930  WxcM domain-containing protein  41.94 
 
 		 317 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.505027  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0692  WxcM domain-containing protein  40.24 
 
 		 315 aa  132  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0690  WxcM-like  43.4 
 
 		 313 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2425  putative acetyltransferase  38.8 
 
 		 194 aa  128  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0318047 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1324  WxcM-like protein  44.37 
 
 		 309 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08990  hypothetical protein  35.53 
 
 		 207 aa  124  8.000000000000001e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2659  WxcM-like protein  41.96 
 
 		 304 aa  124  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08610  N-acetylglucosamine-1-phosphate uridylyltransferase/acetyltransferase  38.73 
 
 		 198 aa  122  4e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.351534 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1238  WxcM-like  38.15 
 
 		 312 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.219256  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3027  WxcM-like protein  38.62 
 
 		 153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0683597  normal  0.28553 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6420  transferase hexapeptide repeat containing protein  40.72 
 
 		 167 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.45706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1136  acetyltransferase  38.67 
 
 		 240 aa  101  6e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6224  transferase hexapeptide repeat containing protein  44.36 
 
 		 168 aa  101  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.164318 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5772  transferase hexapeptide repeat containing protein  35.37 
 
 		 168 aa  99.4  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4804  hexapaptide repeat-containing transferase  43.61 
 
 		 166 aa  99.4  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.159641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0605  hexapaptide repeat-containing transferase  42.28 
 
 		 227 aa  96.3  2e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.51526  normal  0.572168 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0120  hexapaptide repeat-containing transferase  34.38 
 
 		 221 aa  92  4e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5179  transferase hexapeptide repeat containing protein  39.1 
 
 		 192 aa  90.5  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.781731  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4612  hexapaptide repeat-containing transferase  36.77 
 
 		 182 aa  89  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.796744  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3195  transferase hexapeptide repeat protein  34.23 
 
 		 175 aa  89  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2875  hexapaptide repeat-containing transferase  31.29 
 
 		 159 aa  88.6  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1066  transferase hexapeptide repeat  34.01 
 
 		 175 aa  87  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2036  transferase hexapeptide repeat containing protein  39.26 
 
 		 193 aa  87.4  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.327248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3011  hexapaptide repeat-containing transferase  36.09 
 
 		 192 aa  87.4  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1240  hexapaptide repeat-containing transferase  35.17 
 
 		 246 aa  86.3  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0973  hexapaptide repeat-containing transferase  32.26 
 
 		 160 aa  85.9  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0161902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0167  hexapaptide repeat-containing transferase  35 
 
 		 254 aa  85.5  4e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.290287  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2143  hexapaptide repeat-containing transferase  36.71 
 
 		 198 aa  85.1  6e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.748162 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3038  hexapaptide repeat-containing transferase  32.3 
 
 		 169 aa  85.1  6e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1029  hexapaptide repeat-containing transferase  36.43 
 
 		 252 aa  84.7  8e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3255  acetyltransferase  35.76 
 
 		 243 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2232  hexapaptide repeat-containing transferase  33.95 
 
 		 199 aa  83.2  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1480  hexapaptide repeat-containing transferase  33.99 
 
 		 251 aa  82.8  0.000000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1396  acetyltransferase  33.55 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0169  hexapaptide repeat-containing transferase  36.18 
 
 		 254 aa  82  0.000000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0546103  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1022  hexapaptide repeat-containing transferase  35.92 
 
 		 251 aa  81.6  0.000000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0413  acetyl/acyl transferase related protein  34.18 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0476  hexapaptide repeat-containing transferase  33.77 
 
 		 193 aa  78.6  0.00000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.269907  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1609  acetyltransferase  33.56 
 
 		 207 aa  78.2  0.00000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0813  transferase hexapeptide repeat containing protein  32.09 
 
 		 198 aa  77.8  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.434904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0803  acetyl/acyl transferase related protein  37.58 
 
 		 212 aa  77.4  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0245  acetyltransferase  30.94 
 
 		 158 aa  76.6  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2194  hypothetical protein  35.51 
 
 		 185 aa  77  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.73675  decreased coverage  0.00108321 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5491  transferase hexapeptide repeat containing protein  33.8 
 
 		 219 aa  76.3  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0040  transferase hexapeptide repeat containing protein  34.04 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3687  hexapaptide repeat-containing transferase  41.04 
 
 		 174 aa  73.6  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.222409 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1570  acetyl/acyl transferase related protein  39.6 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>