More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4429 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4429  hexapaptide repeat-containing transferase  100 
 
 
207 aa  421  1e-117  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.520075 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1971  transferase hexapeptide repeat containing protein  91.22 
 
 
207 aa  393  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365375 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0783  hexapaptide repeat-containing transferase  92.12 
 
 
212 aa  389  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.989182  normal  0.702768 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1985  transferase hexapeptide repeat containing protein  74.62 
 
 
203 aa  310  6.999999999999999e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0062564 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3256  transferase hexapeptide repeat containing protein  58.59 
 
 
236 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0577  transferase hexapeptide repeat containing protein  63.98 
 
 
194 aa  247  8e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1509  transferase hexapeptide repeat containing protein  59.7 
 
 
214 aa  234  5.0000000000000005e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0290  acetyltransferase  63.24 
 
 
194 aa  231  5e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0893  NAD-dependent oxidoreductase  61.24 
 
 
517 aa  229  2e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3016  putative acetyltransferase  62.01 
 
 
215 aa  229  2e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1859  Serine acetyltransferase-like protein  62.09 
 
 
194 aa  226  1e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.127737  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1122  hexapeptide repeat-containing transferase  60.67 
 
 
517 aa  227  1e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0704  hexapeptide transferase family protein  57.37 
 
 
194 aa  226  1e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000306748  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0951  hexapaptide repeat-containing transferase  61.83 
 
 
189 aa  226  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0246  hexapaptide repeat-containing transferase  56.25 
 
 
193 aa  224  5.0000000000000005e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.35108 
 
 
-
 
NC_002950  PG0002  hexapeptide transferase family protein  58.89 
 
 
190 aa  220  9.999999999999999e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00123717 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1928  transferase hexapeptide repeat containing protein  57.59 
 
 
196 aa  218  5e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.746546  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0357  transferase hexapeptide repeat containing protein  60.32 
 
 
192 aa  218  6e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4761  transferase hexapeptide repeat containing protein  57.67 
 
 
190 aa  217  7.999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000053665  normal  0.125318 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1820  hexapaptide repeat-containing transferase  59.22 
 
 
187 aa  215  4e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0823  WbbJ protein  55.25 
 
 
193 aa  214  5.9999999999999996e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1421  hexapaptide repeat-containing transferase  53.4 
 
 
192 aa  214  7e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3128  putative acetyltransferase WbpD  56.08 
 
 
194 aa  214  7e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1673  transferase hexapeptide repeat containing protein  65.22 
 
 
192 aa  211  4.9999999999999996e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.160587  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2258  putative acetyltransferase  56.04 
 
 
193 aa  211  5.999999999999999e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0569631  hitchhiker  0.00196203 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0871  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  55.25 
 
 
189 aa  209  3e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0541  hexapaptide repeat-containing transferase  54.21 
 
 
191 aa  209  3e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3315  hexapaptide repeat-containing transferase  58.33 
 
 
196 aa  208  4e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.711982 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2971  putative acetyltransferase  53.85 
 
 
192 aa  204  8e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.727659  normal  0.708619 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0550  transferase hexapeptide repeat containing protein  52.38 
 
 
193 aa  204  1e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.259438  normal  0.0248751 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1298  putative acetyltransferase  49.73 
 
 
207 aa  198  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.248019  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0641  transferase hexapeptide repeat containing protein  58.64 
 
 
192 aa  192  2e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.312071 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6855  transferase hexapeptide repeat containing protein  66.25 
 
 
197 aa  186  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0929755 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0895  hexapaptide repeat-containing transferase  56.6 
 
 
202 aa  176  1e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1692  hypothetical protein  55.28 
 
 
182 aa  174  7e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.733433  decreased coverage  0.000199621 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1694  hypothetical protein  54.04 
 
 
182 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.373843  normal  0.731728 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1458  hexapaptide repeat-containing transferase  56.52 
 
 
189 aa  168  6e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.532773  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1080  hexapaptide repeat-containing transferase  47.62 
 
 
203 aa  165  5e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00205406  normal  0.0149533 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0206  hexapaptide repeat-containing transferase  51.53 
 
 
191 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.238916  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4289  putative acetyltransferase  53.01 
 
 
197 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.934275  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1940  putative acetyltransferase  48.86 
 
 
191 aa  156  2e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2008  hexapaptide repeat-containing transferase  46.67 
 
 
186 aa  149  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.500963  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1724  hexapaptide repeat-containing transferase  47.27 
 
 
182 aa  148  6e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0038  transferase hexapeptide repeat containing protein  47.62 
 
 
196 aa  144  7.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1738  N-acetylglucosamine-1- phosphateuridyltransferase-like protein  42.7 
 
 
201 aa  144  9e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7631  putative acetyltransferase  42.31 
 
 
206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.196092  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21040  N-acetylglucosamine-1-phosphate uridylyltransferase/acetyltransferase  41.15 
 
 
228 aa  136  3.0000000000000003e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.94293  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1609  WxcM domain protein  43.23 
 
 
310 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.875347  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2659  WxcM-like protein  37.5 
 
 
304 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0692  WxcM domain-containing protein  44.17 
 
 
315 aa  132  3.9999999999999996e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253812  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1783  WxcM-like protein  43.67 
 
 
171 aa  132  5e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3930  WxcM domain-containing protein  41.51 
 
 
317 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.505027  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1070  lipopolysaccharide biosynthesis protein  41.51 
 
 
316 aa  129  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710053  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2425  putative acetyltransferase  42.11 
 
 
194 aa  129  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0318047 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08610  N-acetylglucosamine-1-phosphate uridylyltransferase/acetyltransferase  39.15 
 
 
198 aa  125  5e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.351534 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4209  putative acetyltransferase  40.91 
 
 
198 aa  125  5e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1324  WxcM-like protein  42.11 
 
 
309 aa  124  8.000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2688  transferase hexapeptide repeat containing protein  41.44 
 
 
198 aa  124  8.000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00225103  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4052  putative acetyltransferase  37.31 
 
 
198 aa  124  9e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08990  hypothetical protein  37.7 
 
 
207 aa  122  5e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0690  WxcM-like  42.58 
 
 
313 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1238  WxcM-like  42.11 
 
 
312 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.219256  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3027  WxcM-like protein  36.13 
 
 
153 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0683597  normal  0.28553 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5772  transferase hexapeptide repeat containing protein  42.38 
 
 
168 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6224  transferase hexapeptide repeat containing protein  40.99 
 
 
168 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.164318 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6420  transferase hexapeptide repeat containing protein  41.98 
 
 
167 aa  95.5  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.45706  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1136  acetyltransferase  38.97 
 
 
240 aa  92  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1066  transferase hexapeptide repeat  36.05 
 
 
175 aa  91.7  7e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3195  transferase hexapeptide repeat protein  34.9 
 
 
175 aa  90.1  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0120  hexapaptide repeat-containing transferase  35.76 
 
 
221 aa  89  4e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4804  hexapaptide repeat-containing transferase  40.38 
 
 
166 aa  88.6  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.159641  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2875  hexapaptide repeat-containing transferase  36.55 
 
 
159 aa  88.2  8e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1396  acetyltransferase  37.11 
 
 
159 aa  86.3  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0973  hexapaptide repeat-containing transferase  38.26 
 
 
160 aa  85.1  7e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0161902  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2143  hexapaptide repeat-containing transferase  36.97 
 
 
198 aa  84.7  8e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.748162 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0476  hexapaptide repeat-containing transferase  38.85 
 
 
193 aa  83.6  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.269907  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3038  hexapaptide repeat-containing transferase  37.42 
 
 
169 aa  82.8  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3011  hexapaptide repeat-containing transferase  36.03 
 
 
192 aa  82.4  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0167  hexapaptide repeat-containing transferase  32.69 
 
 
254 aa  82  0.000000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.290287  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0605  hexapaptide repeat-containing transferase  42.55 
 
 
227 aa  80.5  0.00000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.51526  normal  0.572168 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5179  transferase hexapeptide repeat containing protein  32.56 
 
 
192 aa  79.3  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.781731  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4612  hexapaptide repeat-containing transferase  37.76 
 
 
182 aa  79  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.796744  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0245  acetyltransferase  31.72 
 
 
158 aa  79  0.00000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2036  transferase hexapeptide repeat containing protein  35.29 
 
 
193 aa  77.4  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.327248  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2232  hexapaptide repeat-containing transferase  37.23 
 
 
199 aa  76.6  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0803  acetyl/acyl transferase related protein  38.61 
 
 
212 aa  76.6  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0413  acetyl/acyl transferase related protein  35.21 
 
 
230 aa  76.6  0.0000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0169  hexapaptide repeat-containing transferase  30.86 
 
 
254 aa  75.9  0.0000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0546103  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3687  hexapaptide repeat-containing transferase  41.67 
 
 
174 aa  75.5  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.222409 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1240  hexapaptide repeat-containing transferase  31.68 
 
 
246 aa  74.7  0.0000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0813  transferase hexapeptide repeat containing protein  33.82 
 
 
198 aa  74.7  0.0000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.434904  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1527  transferase hexapeptide repeat containing protein  33.52 
 
 
211 aa  73.6  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.584038  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1022  hexapaptide repeat-containing transferase  31.82 
 
 
251 aa  69.3  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3255  acetyltransferase  34.97 
 
 
243 aa  69.3  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1029  hexapaptide repeat-containing transferase  30.97 
 
 
252 aa  68.9  0.00000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1609  acetyltransferase  32.59 
 
 
207 aa  69.3  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1824  hexapaptide repeat-containing transferase  38.21 
 
 
224 aa  68.9  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1480  hexapaptide repeat-containing transferase  29.14 
 
 
251 aa  68.2  0.00000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1570  acetyl/acyl transferase related protein  35.48 
 
 
227 aa  68.2  0.00000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5491  transferase hexapeptide repeat containing protein  33.8 
 
 
219 aa  67  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>