More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0973 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0973  hexapaptide repeat-containing transferase  100 
 
 
160 aa  326  6e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0161902  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2875  hexapaptide repeat-containing transferase  73.38 
 
 
159 aa  244  4.9999999999999997e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1066  transferase hexapeptide repeat  67.09 
 
 
175 aa  229  8.000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3195  transferase hexapeptide repeat protein  66.46 
 
 
175 aa  228  3e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5772  transferase hexapeptide repeat containing protein  64.47 
 
 
168 aa  205  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6420  transferase hexapeptide repeat containing protein  63.06 
 
 
167 aa  198  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.45706  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1396  acetyltransferase  62.5 
 
 
159 aa  196  7.999999999999999e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3038  hexapaptide repeat-containing transferase  61.18 
 
 
169 aa  195  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6224  transferase hexapeptide repeat containing protein  62.58 
 
 
168 aa  194  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.164318 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4804  hexapaptide repeat-containing transferase  62.58 
 
 
166 aa  190  6e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.159641  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4612  hexapaptide repeat-containing transferase  55.1 
 
 
182 aa  167  5e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.796744  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3687  hexapaptide repeat-containing transferase  57.86 
 
 
174 aa  156  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.222409 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14121  hypothetical protein  48.32 
 
 
172 aa  139  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1362  hexapaptide repeat-containing transferase  50.34 
 
 
156 aa  128  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2423  acetyltransferase  45.7 
 
 
164 aa  128  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1724  hexapaptide repeat-containing transferase  43.21 
 
 
182 aa  121  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2688  transferase hexapeptide repeat containing protein  46.56 
 
 
198 aa  116  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00225103  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0895  hexapaptide repeat-containing transferase  44.08 
 
 
202 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2008  hexapaptide repeat-containing transferase  43.54 
 
 
186 aa  115  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.500963  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0206  hexapaptide repeat-containing transferase  42.86 
 
 
191 aa  114  5e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.238916  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1324  WxcM-like protein  42.21 
 
 
309 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1609  WxcM domain protein  42.25 
 
 
310 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.875347  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0038  transferase hexapeptide repeat containing protein  43.75 
 
 
196 aa  108  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7631  putative acetyltransferase  39.69 
 
 
206 aa  108  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.196092  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2659  WxcM-like protein  40.62 
 
 
304 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4209  putative acetyltransferase  44.44 
 
 
198 aa  107  9.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0577  transferase hexapeptide repeat containing protein  44.22 
 
 
194 aa  106  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1458  hexapaptide repeat-containing transferase  43.54 
 
 
189 aa  105  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.532773  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1940  putative acetyltransferase  41.22 
 
 
191 aa  105  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0002  hexapeptide transferase family protein  40.14 
 
 
190 aa  104  6e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00123717 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1238  WxcM-like  37.04 
 
 
312 aa  103  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.219256  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1122  hexapeptide repeat-containing transferase  39.46 
 
 
517 aa  102  2e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0893  NAD-dependent oxidoreductase  39.46 
 
 
517 aa  102  3e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3930  WxcM domain-containing protein  39.46 
 
 
317 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.505027  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21040  N-acetylglucosamine-1-phosphate uridylyltransferase/acetyltransferase  35.53 
 
 
228 aa  101  4e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.94293  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0692  WxcM domain-containing protein  37.41 
 
 
315 aa  101  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253812  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1070  lipopolysaccharide biosynthesis protein  36.81 
 
 
316 aa  100  8e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710053  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1694  hypothetical protein  36.81 
 
 
182 aa  100  9e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.373843  normal  0.731728 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1692  hypothetical protein  38.19 
 
 
182 aa  100  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.733433  decreased coverage  0.000199621 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0413  acetyl/acyl transferase related protein  40 
 
 
230 aa  99.4  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4052  putative acetyltransferase  39.84 
 
 
198 aa  99  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2425  putative acetyltransferase  37.41 
 
 
194 aa  99.4  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0318047 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1421  hexapaptide repeat-containing transferase  41.5 
 
 
192 aa  98.6  3e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0290  acetyltransferase  42.36 
 
 
194 aa  97.4  6e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0690  WxcM-like  41.96 
 
 
313 aa  95.5  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1673  transferase hexapeptide repeat containing protein  38.26 
 
 
192 aa  95.9  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.160587  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4761  transferase hexapeptide repeat containing protein  37.8 
 
 
190 aa  96.3  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000053665  normal  0.125318 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3027  WxcM-like protein  36.71 
 
 
153 aa  95.1  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0683597  normal  0.28553 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0541  hexapaptide repeat-containing transferase  40.82 
 
 
191 aa  95.1  4e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0357  transferase hexapeptide repeat containing protein  40.94 
 
 
192 aa  95.1  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0641  transferase hexapeptide repeat containing protein  41.38 
 
 
192 aa  94.7  5e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.312071 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08610  N-acetylglucosamine-1-phosphate uridylyltransferase/acetyltransferase  39.68 
 
 
198 aa  94.7  5e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.351534 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0704  hexapeptide transferase family protein  38.62 
 
 
194 aa  94.4  5e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000306748  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1738  N-acetylglucosamine-1- phosphateuridyltransferase-like protein  39.72 
 
 
201 aa  93.6  9e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1136  acetyltransferase  33.55 
 
 
240 aa  91.3  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1985  transferase hexapeptide repeat containing protein  40.14 
 
 
203 aa  90.9  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0062564 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1783  WxcM-like protein  37.5 
 
 
171 aa  90.9  7e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0120  hexapaptide repeat-containing transferase  35.95 
 
 
221 aa  90.9  7e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1527  transferase hexapeptide repeat containing protein  40 
 
 
211 aa  89.7  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.584038  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2258  putative acetyltransferase  36.91 
 
 
193 aa  89.7  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0569631  hitchhiker  0.00196203 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4289  putative acetyltransferase  38.1 
 
 
197 aa  88.6  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.934275  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08990  hypothetical protein  37.59 
 
 
207 aa  88.6  3e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0040  transferase hexapeptide repeat containing protein  43.94 
 
 
249 aa  88.2  4e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5179  transferase hexapeptide repeat containing protein  35.06 
 
 
192 aa  87.8  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.781731  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1820  hexapaptide repeat-containing transferase  36.05 
 
 
187 aa  87.8  6e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3315  hexapaptide repeat-containing transferase  35.76 
 
 
196 aa  87.4  8e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.711982 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3128  putative acetyltransferase WbpD  34.42 
 
 
194 aa  86.7  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0550  transferase hexapeptide repeat containing protein  37.97 
 
 
193 aa  86.3  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.259438  normal  0.0248751 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0823  WbbJ protein  34.69 
 
 
193 aa  85.9  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0245  acetyltransferase  33.77 
 
 
158 aa  85.9  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0605  hexapaptide repeat-containing transferase  37.91 
 
 
227 aa  85.9  2e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.51526  normal  0.572168 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1859  Serine acetyltransferase-like protein  32.26 
 
 
194 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.127737  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1029  hexapaptide repeat-containing transferase  35.48 
 
 
252 aa  85.5  3e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0871  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  34.01 
 
 
189 aa  85.1  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0169  hexapaptide repeat-containing transferase  36.71 
 
 
254 aa  85.5  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0546103  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0167  hexapaptide repeat-containing transferase  37.97 
 
 
254 aa  85.5  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.290287  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1971  transferase hexapeptide repeat containing protein  37.41 
 
 
207 aa  85.5  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365375 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1022  hexapaptide repeat-containing transferase  39.55 
 
 
251 aa  85.5  3e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4429  hexapaptide repeat-containing transferase  38.26 
 
 
207 aa  85.1  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.520075 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0813  transferase hexapeptide repeat containing protein  36.92 
 
 
198 aa  84.7  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.434904  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1928  transferase hexapeptide repeat containing protein  34.9 
 
 
196 aa  85.1  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.746546  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2971  putative acetyltransferase  34.62 
 
 
192 aa  84.3  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.727659  normal  0.708619 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0783  hexapaptide repeat-containing transferase  38.26 
 
 
212 aa  84  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.989182  normal  0.702768 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3256  transferase hexapeptide repeat containing protein  33.33 
 
 
236 aa  84  8e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1480  hexapaptide repeat-containing transferase  34.59 
 
 
251 aa  83.6  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3255  acetyltransferase  36.09 
 
 
243 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0951  hexapaptide repeat-containing transferase  34.51 
 
 
189 aa  82.8  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1609  acetyltransferase  35.11 
 
 
207 aa  81.3  0.000000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2194  hypothetical protein  38.89 
 
 
185 aa  80.5  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.73675  decreased coverage  0.00108321 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0246  hexapaptide repeat-containing transferase  37.06 
 
 
193 aa  79.7  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.35108 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3016  putative acetyltransferase  34.03 
 
 
215 aa  80.1  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1080  hexapaptide repeat-containing transferase  33.56 
 
 
203 aa  79  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00205406  normal  0.0149533 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1240  hexapaptide repeat-containing transferase  36.13 
 
 
246 aa  79.3  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1298  putative acetyltransferase  33.11 
 
 
207 aa  79  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.248019  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0803  acetyl/acyl transferase related protein  35.33 
 
 
212 aa  76.6  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3011  hexapaptide repeat-containing transferase  31.58 
 
 
192 aa  76.3  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2989  hexapaptide repeat-containing transferase  39.83 
 
 
185 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29453  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3106  acetyltransferase  27.12 
 
 
183 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.440449  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2232  hexapaptide repeat-containing transferase  32.58 
 
 
199 aa  75.9  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0536  transferase hexapeptide repeat containing protein  30.69 
 
 
187 aa  75.5  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>