More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1480 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_1480  hexapaptide repeat-containing transferase  100 
 
 
251 aa  493  1e-139  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1022  hexapaptide repeat-containing transferase  79.03 
 
 
251 aa  395  1e-109  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0169  hexapaptide repeat-containing transferase  72.8 
 
 
254 aa  368  1e-101  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0546103  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0167  hexapaptide repeat-containing transferase  72 
 
 
254 aa  368  1e-101  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.290287  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1029  hexapaptide repeat-containing transferase  62.2 
 
 
252 aa  318  7e-86  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1240  hexapaptide repeat-containing transferase  61.48 
 
 
246 aa  295  4e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0040  transferase hexapeptide repeat containing protein  52.82 
 
 
249 aa  261  8.999999999999999e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3255  acetyltransferase  50.21 
 
 
243 aa  240  1e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4502  UDP-3-O-(3-hydroxymyristoyl)-like protein  38.99 
 
 
322 aa  201  9e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5491  transferase hexapeptide repeat containing protein  40.19 
 
 
219 aa  160  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1700  hexapaptide repeat-containing transferase  34.06 
 
 
246 aa  127  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0120  hexapaptide repeat-containing transferase  39.23 
 
 
221 aa  125  5e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5179  transferase hexapeptide repeat containing protein  33.66 
 
 
192 aa  123  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.781731  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1136  acetyltransferase  37.8 
 
 
240 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0413  acetyl/acyl transferase related protein  35.51 
 
 
230 aa  113  3e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3011  hexapaptide repeat-containing transferase  36.09 
 
 
192 aa  108  6e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2143  hexapaptide repeat-containing transferase  39.16 
 
 
198 aa  107  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.748162 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0813  transferase hexapeptide repeat containing protein  34.52 
 
 
198 aa  107  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.434904  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1694  hypothetical protein  42.34 
 
 
182 aa  106  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.373843  normal  0.731728 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2036  transferase hexapeptide repeat containing protein  32.45 
 
 
193 aa  103  3e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.327248  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1692  hypothetical protein  41.61 
 
 
182 aa  103  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.733433  decreased coverage  0.000199621 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1527  transferase hexapeptide repeat containing protein  36.78 
 
 
211 aa  102  5e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.584038  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0476  hexapaptide repeat-containing transferase  35.71 
 
 
193 aa  99  7e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.269907  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1122  hexapeptide repeat-containing transferase  38.51 
 
 
517 aa  95.9  5e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2232  hexapaptide repeat-containing transferase  33.75 
 
 
199 aa  94.7  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0893  NAD-dependent oxidoreductase  39.71 
 
 
517 aa  94.4  1e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0550  transferase hexapeptide repeat containing protein  38.93 
 
 
193 aa  93.6  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.259438  normal  0.0248751 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1288  hypothetical protein  29.77 
 
 
250 aa  92.4  7e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1324  WxcM-like protein  36.36 
 
 
309 aa  90.9  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1783  WxcM-like protein  39.53 
 
 
171 aa  90.1  3e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0951  hexapaptide repeat-containing transferase  34.19 
 
 
189 aa  89.7  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0635  hypothetical protein  28.64 
 
 
255 aa  89.4  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.590624 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0038  transferase hexapeptide repeat containing protein  37.93 
 
 
196 aa  88.6  8e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4761  transferase hexapeptide repeat containing protein  35.81 
 
 
190 aa  88.6  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000053665  normal  0.125318 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1928  transferase hexapeptide repeat containing protein  33.99 
 
 
196 aa  88.2  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.746546  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0251  hexapaptide repeat-containing transferase  38.12 
 
 
202 aa  88.2  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3930  WxcM domain-containing protein  41.41 
 
 
317 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.505027  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1070  lipopolysaccharide biosynthesis protein  40.77 
 
 
316 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710053  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1609  WxcM domain protein  38.06 
 
 
310 aa  86.7  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.875347  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1298  putative acetyltransferase  32.9 
 
 
207 aa  85.9  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.248019  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0577  transferase hexapeptide repeat containing protein  38.85 
 
 
194 aa  85.9  6e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0641  transferase hexapeptide repeat containing protein  35.42 
 
 
192 aa  84.7  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.312071 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1673  transferase hexapeptide repeat containing protein  33.78 
 
 
192 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.160587  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0605  hexapaptide repeat-containing transferase  37.79 
 
 
227 aa  84.7  0.000000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.51526  normal  0.572168 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1421  hexapaptide repeat-containing transferase  36.55 
 
 
192 aa  85.1  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2971  putative acetyltransferase  35.95 
 
 
192 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.727659  normal  0.708619 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2258  putative acetyltransferase  35.57 
 
 
193 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0569631  hitchhiker  0.00196203 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3128  putative acetyltransferase WbpD  34.46 
 
 
194 aa  84.3  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0002  hexapeptide transferase family protein  32.19 
 
 
190 aa  83.6  0.000000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00123717 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0871  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  36.3 
 
 
189 aa  83.6  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0973  hexapaptide repeat-containing transferase  34.59 
 
 
160 aa  83.6  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0161902  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0541  hexapaptide repeat-containing transferase  36.88 
 
 
191 aa  83.6  0.000000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3256  transferase hexapeptide repeat containing protein  31.72 
 
 
236 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1940  putative acetyltransferase  35.51 
 
 
191 aa  83.2  0.000000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1859  Serine acetyltransferase-like protein  33.99 
 
 
194 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.127737  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2008  hexapaptide repeat-containing transferase  39.31 
 
 
186 aa  82.8  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.500963  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0690  WxcM-like  36.24 
 
 
313 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3016  putative acetyltransferase  32.21 
 
 
215 aa  81.3  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0692  WxcM domain-containing protein  35.2 
 
 
315 aa  81.6  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253812  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0246  hexapaptide repeat-containing transferase  33.78 
 
 
193 aa  81.3  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.35108 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0206  hexapaptide repeat-containing transferase  34.33 
 
 
191 aa  80.9  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.238916  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2659  WxcM-like protein  36.18 
 
 
304 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6224  transferase hexapeptide repeat containing protein  38.28 
 
 
168 aa  80.5  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.164318 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0290  acetyltransferase  33.81 
 
 
194 aa  80.5  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0704  hexapeptide transferase family protein  36.92 
 
 
194 aa  80.1  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000306748  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0823  WbbJ protein  34.9 
 
 
193 aa  79.7  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1609  acetyltransferase  31.66 
 
 
207 aa  79.3  0.00000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6420  transferase hexapeptide repeat containing protein  34.59 
 
 
167 aa  79.3  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.45706  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1458  hexapaptide repeat-containing transferase  37.68 
 
 
189 aa  79.3  0.00000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.532773  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3195  transferase hexapeptide repeat protein  33.83 
 
 
175 aa  79  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3027  WxcM-like protein  34.31 
 
 
153 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0683597  normal  0.28553 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1066  transferase hexapeptide repeat  33.33 
 
 
175 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0822  acyl-(acyl-carrier-protein)--UDP-N- acetylglucosamine O-acyltransferase  35.71 
 
 
257 aa  78.2  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1724  hexapaptide repeat-containing transferase  35.66 
 
 
182 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3315  hexapaptide repeat-containing transferase  33.56 
 
 
196 aa  77.8  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.711982 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1080  hexapaptide repeat-containing transferase  33.59 
 
 
203 aa  76.6  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00205406  normal  0.0149533 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0895  hexapaptide repeat-containing transferase  33.33 
 
 
202 aa  75.9  0.0000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5772  transferase hexapeptide repeat containing protein  36.64 
 
 
168 aa  75.5  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1238  WxcM-like  35.77 
 
 
312 aa  75.9  0.0000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.219256  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2875  hexapaptide repeat-containing transferase  30.72 
 
 
159 aa  75.5  0.0000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21040  N-acetylglucosamine-1-phosphate uridylyltransferase/acetyltransferase  31.03 
 
 
228 aa  74.7  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.94293  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7631  putative acetyltransferase  31.08 
 
 
206 aa  74.7  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.196092  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2423  acetyltransferase  31.01 
 
 
164 aa  75.1  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1820  hexapaptide repeat-containing transferase  36.43 
 
 
187 aa  74.3  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0803  acetyl/acyl transferase related protein  35.67 
 
 
212 aa  73.6  0.000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4289  putative acetyltransferase  31.08 
 
 
197 aa  73.6  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.934275  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002756  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] glucosamine N-acyltransferase  30.92 
 
 
343 aa  73.6  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.477456  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0357  transferase hexapeptide repeat containing protein  34.25 
 
 
192 aa  73.2  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03227  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] glucosamine N-acyltransferase  30.92 
 
 
343 aa  73.2  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1570  acetyl/acyl transferase related protein  35.33 
 
 
227 aa  73.2  0.000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1824  hexapaptide repeat-containing transferase  33.92 
 
 
224 aa  73.2  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2194  hypothetical protein  36.28 
 
 
185 aa  72.8  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.73675  decreased coverage  0.00108321 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1841  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] glucosamine N-acyltransferase  31.9 
 
 
351 aa  72  0.000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0291196  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14121  hypothetical protein  30.46 
 
 
172 aa  72  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0245  acetyltransferase  32.12 
 
 
158 aa  71.2  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1024  UDP-N-acetylglucosamine acyltransferase  34.59 
 
 
257 aa  71.6  0.00000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.131773  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1564  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] glucosamine N-acyltransferase  30.51 
 
 
340 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128344  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4052  putative acetyltransferase  31.9 
 
 
198 aa  71.6  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08610  N-acetylglucosamine-1-phosphate uridylyltransferase/acetyltransferase  31.94 
 
 
198 aa  72  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.351534 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2688  transferase hexapeptide repeat containing protein  32.43 
 
 
198 aa  71.2  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00225103  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>