More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3028 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3028  class I cytochrome c  100 
 
 		 103 aa  211  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.135761  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0628  cytochrome c, class I  55.22 
 
 		 102 aa  87  7e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3008  cytochrome c, class I  46.81 
 
 		 196 aa  85.5  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3716  cytochrome c, class I  42.06 
 
 		 206 aa  84  6e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3330  cytochrome c553-like protein  40.19 
 
 		 109 aa  84.3  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1464  cytochrome c, class I  53.03 
 
 		 98 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00242813  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2702  cytochrome c, class I  50 
 
 		 108 aa  78.2  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.482609  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3139  di-heme cytochrome c, class IC  51.47 
 
 		 200 aa  77  0.00000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  49.25 
 
 		 318 aa  76.6  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3958  cytochrome c, class I  50 
 
 		 108 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.990396  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  51.52 
 
 		 209 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0288  cytochrome c class I  57.81 
 
 		 107 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.403292 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5418  cytochrome c, class I  49.28 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3398  cytochrome c, class I  39.56 
 
 		 98 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  52.86 
 
 		 202 aa  75.5  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0313  cytochrome c552  47.06 
 
 		 100 aa  75.5  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.577665  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0053  cytochrome c, class I  41.24 
 
 		 203 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301772 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0100  cytochrome c class I  40.19 
 
 		 206 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0157  cytochrome c, class I  51.43 
 
 		 201 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3823  cytochrome c-type protein  52.31 
 
 		 217 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6289  cytochrome c4 precursor  51.47 
 
 		 196 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484546  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  38.68 
 
 		 206 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72460  cytochrome c4 precursor  51.47 
 
 		 201 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.462993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0094  cytochrome c, class I  39.62 
 
 		 206 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00310871  decreased coverage  0.00000781089 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0528  cytochrome c family protein  44.09 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000129168  normal  0.22493 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0129  cytochrome c-type protein  56.92 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19667  normal  0.20244 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1947  cytochrome c, class I  52.31 
 
 		 216 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.457627  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4453  cytochrome c class I  47.06 
 
 		 226 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12029  normal  0.150095 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4292  cytochrome c class I  38.38 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136847  unclonable  0.00000000000512206 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4666  cytochrome c  46.75 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  38.38 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0051  cytochrome c class I  38.38 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00284279  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3538  cytochrome c class I  51.52 
 
 		 216 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250632  normal  0.0110108 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  38.38 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  38.38 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  38.38 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  38.38 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000402028  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2406  cytochrome c4  39.42 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3908  cytochrome c, class I  46.05 
 
 		 207 aa  72  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5102  cytochrome c class I  47.06 
 
 		 205 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0768786 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1071  cytochrome c, class I  38.61 
 
 		 105 aa  71.2  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0930552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  47.76 
 
 		 221 aa  70.9  0.000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0913  cytochrome c, class I  38.83 
 
 		 212 aa  70.5  0.000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.826925  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0346  cytochrome c, class I  48 
 
 		 217 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0101877 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1131  cytochrome c class I  50.75 
 
 		 222 aa  70.5  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3049  cytochrome c, class I  48.48 
 
 		 113 aa  70.5  0.000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000419911  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  50.75 
 
 		 205 aa  70.5  0.000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0126  cytochrome c4  45.59 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.813624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0982  cytochrome c class I  36.36 
 
 		 106 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0520697  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0143  cytochrome c, class I  45.59 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.286683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3611  cytochrome c class I  46.67 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00161979  hitchhiker  0.0000000311228 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2414  putative cytochrome c  44.12 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2807  cytochrome c class I  46.67 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.988864 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3945  cytochrome c, class I  45.95 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.405176  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0141  cytochrome c class I  44.12 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0787  cytochrome c family protein  52.46 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000887671  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0984  cytochrome c, class I  47.06 
 
 		 242 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.336073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2741  class I diheme cytochrome c4  50 
 
 		 198 aa  68.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.236816  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1176  cytochrome c class I  43.28 
 
 		 110 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000869093 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0772  cytochrome c, class I  45.59 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  36.54 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0664  cytochrome c, class I  47.62 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0074134 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4048  cytochrome c family protein  43.48 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02000  Cytochrome c4  44.87 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2865  cytochrome c, class I  48.65 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.240799  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0089  cytochrome c class I  44.44 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1400  class I diheme cytochrome c4  48.44 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.49014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3432  cytochrome c family protein  42.03 
 
 		 208 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.402335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0519  cytochrome c family protein  42.03 
 
 		 208 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5803  cytochrome c class I  48.53 
 
 		 179 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182127  normal  0.316784 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1770  cytochrome c553-like protein  46.27 
 
 		 195 aa  67.4  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.290935 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0523  cytochrome c family protein  35.42 
 
 		 199 aa  67  0.00000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3147  cytochrome c, class I  43.48 
 
 		 219 aa  67  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1068  cytochrome c family protein  43.94 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230608  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0197  putative cytochrome C signal peptide protein  47.14 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.283033 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0543  cytochrome c family protein  36.71 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3192  cytochrome c class I  47.69 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3607  cytochrome c family protein  40.58 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0102183  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0714  monoheme cytochrome c  34.69 
 
 		 100 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0138  hypothetical protein  42.42 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6402  cytochrome c, class I  42.65 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0299  cytochrome c, class I  43.84 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.194352  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1173  cytochrome c class I  42.65 
 
 		 136 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000726448 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  38.54 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5681  cytochrome c class I  46.27 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.670247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3769  cytochrome c family protein  38.16 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0572  cytochrome c family protein  38.16 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0567  cytochrome c family protein  37.18 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5589  cytochrome c class I  43.48 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6296 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0076  cytochrome c4 precursor  40.23 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.699547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3284  cytochrome c, class I  43.48 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0308  cytochrome c class I  43.84 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.618372  normal  0.165447 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0006  monoheme cytochrome c  32.65 
 
 		 100 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000773885 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0187  cytochrome c oxidase  43.48 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0207051  normal  0.526918 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2026  cytochrome c, class IC  48.44 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0524  cytochrome c, class I  43.28 
 
 		 115 aa  65.1  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614003 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0623  cytochrome c family protein  38.67 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000405798  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0572  cytochrome c, class I  47.22 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0006  monoheme cytochrome c  32.65 
 
 		 100 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2741  cytochrome c, class I  42.42 
 
 		 218 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0698392  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>