91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1863 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1863  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  275  2e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  4.73047e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21830  hypothetical protein  94.41 
 
 
143 aa  258  3e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  1.21545e-17  normal  0.0258957 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1715  hypothetical protein  53.47 
 
 
145 aa  148  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  3.38135e-07  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4004  hypothetical protein  53.47 
 
 
145 aa  148  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  1.26182e-08  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1307  hypothetical protein  52.78 
 
 
146 aa  147  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  5.04633e-14  normal  0.282911 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1265  hypothetical protein  52.08 
 
 
146 aa  146  7e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  1.79686e-10  normal  0.0239094 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1595  hypothetical protein  53.9 
 
 
150 aa  136  8e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  4.50152e-09  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1315  hypothetical protein  50.34 
 
 
147 aa  132  1e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  8.12186e-11  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1672  hypothetical protein  52.55 
 
 
151 aa  131  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  1.29043e-13  normal  0.0587565 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3889  hypothetical protein  54.03 
 
 
133 aa  124  5e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  3.44158e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35200  hypothetical protein  60 
 
 
116 aa  102  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4460  protein of unknown function DUF1232  32.95 
 
 
138 aa  69.3  2e-11  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.441335 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0315  hypothetical protein  34.07 
 
 
131 aa  68.2  3e-11  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4497  protein of unknown function DUF1232  37.8 
 
 
153 aa  68.2  4e-11  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.923848 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0867  protein of unknown function DUF1232  33.73 
 
 
142 aa  67  8e-11  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0858  hypothetical protein  31.82 
 
 
171 aa  66.2  1e-10  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0116  hypothetical protein  38.68 
 
 
145 aa  66.6  1e-10  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2125  hypothetical protein  34.4 
 
 
144 aa  62.8  1e-09  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.836422  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3525  hypothetical protein  35.14 
 
 
134 aa  59.7  1e-08  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.576058 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9304  hypothetical protein  38.46 
 
 
112 aa  58.9  2e-08  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.030186  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2537  protein of unknown function DUF1232  33.33 
 
 
155 aa  58.5  3e-08  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.36697  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0836  hypothetical protein  29.55 
 
 
167 aa  58.9  3e-08  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.202842 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2278  protein of unknown function DUF1232  28.32 
 
 
151 aa  57.8  5e-08  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4763  protein of unknown function DUF1232  41.33 
 
 
122 aa  55.8  2e-07  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2752  hypothetical protein  38.67 
 
 
185 aa  54.7  5e-07  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.176431  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2736  hypothetical protein  31.03 
 
 
148 aa  53.1  1e-06  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.909587  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20980  hypothetical protein  30.77 
 
 
157 aa  53.1  1e-06  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1681  hypothetical protein  34.18 
 
 
131 aa  51.6  3e-06  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.232652 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1529  protein of unknown function DUF1232  42.47 
 
 
120 aa  50.8  6e-06  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00770701 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2498  hypothetical protein  33.33 
 
 
110 aa  50.4  7e-06  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2517  protein of unknown function DUF1232  32.88 
 
 
150 aa  50.1  1e-05  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.545586  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3628  hypothetical protein  34.18 
 
 
142 aa  50.1  1e-05  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.89928  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01225  hypothetical protein  35.14 
 
 
143 aa  49.7  1e-05  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.115092  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2808  hypothetical protein  36.62 
 
 
126 aa  49.7  1e-05  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1508  protein of unknown function DUF1232  31.17 
 
 
133 aa  49.3  2e-05  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.987063  normal  0.0931118 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0853  hypothetical protein  29.41 
 
 
108 aa  48.5  3e-05  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000628024  hitchhiker  1.2824e-05 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0438  hypothetical protein  25.78 
 
 
152 aa  47.8  5e-05  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2523  hypothetical protein  34.21 
 
 
129 aa  47.8  6e-05  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0989751  normal  0.209211 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3765  hypothetical protein  54.55 
 
 
121 aa  47  8e-05  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  2.1606e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0098  hypothetical protein  29.87 
 
 
124 aa  47  9e-05  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5022  hypothetical protein  64.52 
 
 
121 aa  46.2  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  5.91225e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0012  hypothetical protein  42.55 
 
 
121 aa  46.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0407  protein of unknown function DUF1232  30.26 
 
 
124 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0363693  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0704  hypothetical protein  29.87 
 
 
124 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06311  hypothetical protein  42.55 
 
 
121 aa  46.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5607  hypothetical protein  59.38 
 
 
121 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  3.5022e-06  hitchhiker  2.94963e-24 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2908  protein of unknown function DUF1232  25 
 
 
152 aa  46.2  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1882  protein of unknown function DUF1232  44.68 
 
 
95 aa  46.2  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5352  hypothetical protein  59.38 
 
 
121 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00015826  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5080  hypothetical protein  58.06 
 
 
121 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  4.73899e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4927  hypothetical protein  58.06 
 
 
121 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  3.66167e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18241  hypothetical protein  44.68 
 
 
123 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0694351 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4912  hypothetical protein  58.06 
 
 
121 aa  45.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.76328e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5320  hypothetical protein  58.06 
 
 
121 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34657e-47 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5468  hypothetical protein  58.06 
 
 
121 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  4.0052e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0247  hypothetical protein  31.58 
 
 
135 aa  45.1  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4815  hypothetical protein  38.78 
 
 
182 aa  44.7  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.586532  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5403  hypothetical protein  58.06 
 
 
121 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  1.73737e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05801  hypothetical protein  42.55 
 
 
121 aa  45.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2073  protein of unknown function DUF1232  25.74 
 
 
159 aa  45.1  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5346  hypothetical protein  58.06 
 
 
121 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  7.84394e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0909  protein of unknown function DUF1232  42.05 
 
 
154 aa  44.7  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.972711  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0854  hypothetical protein  35 
 
 
118 aa  44.3  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0567626 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1386  hypothetical protein  32.31 
 
 
139 aa  44.3  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0092  hypothetical protein  34.55 
 
 
126 aa  43.9  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2261  hypothetical protein  36.21 
 
 
109 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000353755  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0081  hypothetical protein  34.55 
 
 
127 aa  43.5  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.461887  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2219  hypothetical protein  36.21 
 
 
109 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2487  hypothetical protein  36.21 
 
 
109 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0565  protein of unknown function DUF1232  44.44 
 
 
145 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  1.40761e-07  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2566  hypothetical protein  36.21 
 
 
109 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0631165  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4332  hypothetical protein  38.46 
 
 
154 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0079  hypothetical protein  34.55 
 
 
127 aa  43.5  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.728304  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1295  protein of unknown function DUF1232  40 
 
 
116 aa  42.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001113  hypothetical protein  60.71 
 
 
124 aa  42.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.777907  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0643  hypothetical protein  28.44 
 
 
191 aa  42.4  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5369  hypothetical protein  32.26 
 
 
162 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04866  hypothetical protein  60.71 
 
 
120 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2278  hypothetical protein  36.21 
 
 
109 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0575719  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0661  hypothetical protein  42.22 
 
 
93 aa  42  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4184  hypothetical protein  33.33 
 
 
154 aa  41.2  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.390701  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1079  hypothetical protein  41.07 
 
 
131 aa  41.2  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4050  protein of unknown function DUF1232  43.14 
 
 
130 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1729  hypothetical protein  31.71 
 
 
165 aa  40.8  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0469574  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3727  protein of unknown function DUF1232  43.14 
 
 
130 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.883988  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0465  hypothetical protein  35.09 
 
 
85 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0811  protein of unknown function DUF1232  50 
 
 
149 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.383536 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2903  hypothetical protein  30.59 
 
 
109 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0923004  normal  0.0879248 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0999  hypothetical protein  38.64 
 
 
129 aa  40  0.009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.178423  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06321  hypothetical protein  31.33 
 
 
122 aa  40.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06411  hypothetical protein  43.18 
 
 
124 aa  40  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>