273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1172 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1172  taurine dioxygenase  100 
 
 		 277 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.105338  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12970  taurine dioxygenase  96.75 
 
 		 277 aa  546  1e-154  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.325066 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0230  taurine dioxygenase  76.53 
 
 		 277 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.091152  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0254  taurine dioxygenase  76.53 
 
 		 277 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4982  taurine dioxygenase  74.73 
 
 		 277 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.393114  normal  0.753177 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0245  taurine dioxygenase  75.45 
 
 		 291 aa  431  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311094  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0253  taurine dioxygenase  72.83 
 
 		 280 aa  425  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.907637 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4563  taurine dioxygenase  62.18 
 
 		 282 aa  352  4e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.737071 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3239  Taurine dioxygenase  59.64 
 
 		 283 aa  340  1e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0261  taurine dioxygenase  60.58 
 
 		 282 aa  341  1e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0397  taurine dioxygenase  59.64 
 
 		 283 aa  340  1e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3692  taurine dioxygenase  60.58 
 
 		 282 aa  341  1e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3935  taurine dioxygenase  60.58 
 
 		 282 aa  341  1e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0432  taurine dioxygenase  59.64 
 
 		 283 aa  339  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00318  taurine dioxygenase  59.64 
 
 		 283 aa  339  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0443  taurine dioxygenase  59.64 
 
 		 283 aa  339  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3260  taurine dioxygenase  59.64 
 
 		 283 aa  339  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.169566  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00322  hypothetical protein  59.64 
 
 		 283 aa  339  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0392  taurine dioxygenase  59.64 
 
 		 283 aa  338  4e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0799  taurine dioxygenase  60.36 
 
 		 277 aa  333  2e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229107  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0623  taurine dioxygenase  60.73 
 
 		 277 aa  328  8e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0658151  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0841  taurine dioxygenase  57.45 
 
 		 283 aa  327  1.0000000000000001e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.149733 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2137  taurine dioxygenase  60.36 
 
 		 277 aa  325  6e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.625225  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2223  taurine dioxygenase  60.36 
 
 		 335 aa  325  6e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0838  taurine dioxygenase  48.21 
 
 		 285 aa  249  3e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.518318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2004  taurine dioxygenase  43.88 
 
 		 278 aa  239  2.9999999999999997e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.316372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6202  Taurine dioxygenase  48.36 
 
 		 272 aa  239  2.9999999999999997e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4704  taurine dioxygenase  46.21 
 
 		 282 aa  229  5e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4158  taurine dioxygenase  43.36 
 
 		 297 aa  228  6e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670587  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4329  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  46.15 
 
 		 305 aa  228  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2733  taurine dioxygenase  44.91 
 
 		 295 aa  226  4e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488932  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4409  taurine dioxygenase 2-oxoglutarate-dependent  43.01 
 
 		 301 aa  225  7e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0425898  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4751  taurine dioxygenase  42.12 
 
 		 304 aa  223  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.325692  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4218  Taurine dioxygenase  47.65 
 
 		 322 aa  223  4e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5742  Taurine dioxygenase  44.57 
 
 		 307 aa  222  4.9999999999999996e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.448505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5823  taurine dioxygenase 2-oxoglutarate-dependent  41.1 
 
 		 295 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02787  hypothetical protein  42.75 
 
 		 314 aa  219  3.9999999999999997e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1796  taurine dioxygenase  42.03 
 
 		 270 aa  219  5e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.404778  normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7076  Taurine dioxygenase  44.61 
 
 		 282 aa  216  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2717  taurine dioxygenase  39.59 
 
 		 305 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1374  Taurine dioxygenase  43.57 
 
 		 306 aa  215  5e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30930  taurine catabolic dioxygenase protein  44.2 
 
 		 273 aa  214  8e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433901  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0986  taurine dioxygenase  41.22 
 
 		 271 aa  211  9e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.762036 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2086  taurine dioxygenase  44.16 
 
 		 293 aa  211  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4136  taurine dioxygenase (TauD/TfdA family)  41.84 
 
 		 308 aa  207  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.805351 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0828  taurine dioxygenase  41.18 
 
 		 276 aa  206  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.297497  normal  0.696924 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3666  Taurine dioxygenase  42.55 
 
 		 304 aa  207  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4542  taurine dioxygenase  39.37 
 
 		 301 aa  206  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0422287  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3776  Taurine dioxygenase  43.2 
 
 		 315 aa  206  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4566  taurine dioxygenase  44.2 
 
 		 314 aa  204  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4018  taurine dioxygenase  43.48 
 
 		 317 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4348  taurine dioxygenase  43.48 
 
 		 317 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3506  taurine dioxygenase  43.48 
 
 		 317 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463034 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4976  taurine dioxygenase  45.49 
 
 		 305 aa  203  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141478 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3924  taurine dioxygenase  42.39 
 
 		 317 aa  202  5e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.134883  normal  0.401271 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2065  taurine dioxygenase  42.75 
 
 		 317 aa  202  5e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.479444  normal  0.956195 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3417  taurine dioxygenase  42.39 
 
 		 318 aa  201  8e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.63153 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4383  Taurine dioxygenase  40.79 
 
 		 281 aa  201  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3847  taurine dioxygenase  40 
 
 		 282 aa  199  5e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0137  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  39.1 
 
 		 298 aa  198  7e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1958  dioxygenase, TauD/TfdA  40.77 
 
 		 292 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2012  taurine dioxygenase  41.67 
 
 		 281 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0337  taurine dioxygenase  38.81 
 
 		 298 aa  196  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34750  putative taurine catabolism dioxygenase  40.28 
 
 		 295 aa  196  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.109909  normal  0.0729012 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4308  Taurine dioxygenase  40.86 
 
 		 303 aa  196  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677541  hitchhiker  0.00107302 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1665  taurine dioxygenase  39.79 
 
 		 303 aa  195  5.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04663  taurine dioxygenase  41.28 
 
 		 305 aa  196  5.000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5198  dioxygenase, TauD/TfdA family  38.75 
 
 		 298 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2175  taurine dioxygenase  41.24 
 
 		 306 aa  194  9e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.129597 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2520  dioxygenase, TauD/TfdA  40.7 
 
 		 292 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0978  Taurine dioxygenase  37.92 
 
 		 287 aa  194  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.793561  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3116  taurine dioxygenase  41.52 
 
 		 316 aa  194  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.362427 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4840  putative dioxygenase  40.15 
 
 		 316 aa  194  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.538744 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5292  taurine dioxygenase  40.77 
 
 		 281 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.119745 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3179  dioxygenase, TauD/TfdA  40.42 
 
 		 292 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2573  dioxygenase, TauD/TfdA  40.42 
 
 		 292 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.225164  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1602  taurine dioxygenase  39.72 
 
 		 281 aa  193  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2661  dioxygenase, TauD/TfdA  40.42 
 
 		 292 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.719861  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2819  taurine dioxygenase  41.58 
 
 		 282 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.373247 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5751  Taurine dioxygenase  41.24 
 
 		 309 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.278464 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2135  dioxygenase, TauD/TfdA  40.42 
 
 		 292 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1409  dioxygenase, TauD/TfdA  40.42 
 
 		 292 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.530858  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0233  taurine dioxygenase  41.73 
 
 		 301 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7176  taurine dioxygenase  40.34 
 
 		 282 aa  192  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1633  dioxygenase, TauD/TfdA  40.34 
 
 		 292 aa  192  7e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1366  putative taurine dioxygenase, 2-oxoglutarate-dependent  39.73 
 
 		 308 aa  192  7e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0715055 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5119  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA (2-oxoglutarate-dependent)  41.03 
 
 		 299 aa  191  9e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2169  taurine dioxygenase  40.28 
 
 		 302 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0153  taurine dioxygenase  40.99 
 
 		 302 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.93116 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6251  taurine dioxygenase  40.48 
 
 		 308 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3110  taurine dioxygenase  37.23 
 
 		 316 aa  190  2e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6536  taurine dioxygenase  40.48 
 
 		 308 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.788384 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0511  Taurine dioxygenase  40.8 
 
 		 299 aa  190  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2676  taurine dioxygenase  41.24 
 
 		 282 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5054  taurine dioxygenase  39.37 
 
 		 280 aa  187  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4633  taurine dioxygenase 2-oxoglutarate-dependent  40.21 
 
 		 280 aa  187  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0817335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2147  taurine dioxygenase  40.34 
 
 		 282 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0213  taurine dioxygenase  39.35 
 
 		 306 aa  187  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22390  Taurine dioxygenase protein  40.48 
 
 		 318 aa  186  3e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0190  taurine dioxygenase  37.41 
 
 		 299 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>