More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4393 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_4393  chemotaxis protein CheV  100 
 
 
309 aa  635  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3954  response regulator receiver modulated CheW protein  99.68 
 
 
309 aa  633  1e-180  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1461  putative CheW protein  99.68 
 
 
309 aa  633  1e-180  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3734  response regulator receiver modulated CheW protein  94.5 
 
 
309 aa  605  1e-172  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4253  CheW protein  87.34 
 
 
310 aa  553  1e-156  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.861577 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3486  response regulator receiver:CheW-like protein  84.74 
 
 
308 aa  539  1e-152  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1927  chemotaxis protein CheV, putative  84.42 
 
 
308 aa  536  1e-151  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.203525  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20750  putative chemotaxis protein  81.43 
 
 
310 aa  520  1e-147  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1781  putative chemotaxis protein  81.43 
 
 
310 aa  519  1e-146  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2852  putative CheW protein  82.35 
 
 
310 aa  501  1e-141  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.141391 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1068  putative CheW protein  65.03 
 
 
309 aa  420  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0334866  normal  0.0302452 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2215  putative chemotaxis protein  67.32 
 
 
316 aa  421  1e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1176  putative CheW protein  62.42 
 
 
309 aa  384  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.531119  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1319  response regulator receiver modulated CheW protein  59.47 
 
 
306 aa  378  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0920942 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1257  response regulator receiver modulated CheW protein  59.47 
 
 
306 aa  378  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1414  response regulator receiver modulated CheW protein  58.8 
 
 
306 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2964  putative CheW protein  58.8 
 
 
306 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.725917  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1159  response regulator receiver modulated CheW protein  59.47 
 
 
306 aa  375  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.601808  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2949  putative CheW protein  58.8 
 
 
306 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3252  chemotaxis protein CheV  59.14 
 
 
306 aa  375  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1327  response regulator receiver modulated CheW protein  59.47 
 
 
306 aa  377  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3102  response regulator receiver modulated CheW protein  58.8 
 
 
306 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.896505 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1301  CheW-like protein  58.8 
 
 
306 aa  374  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2599  putative CheW protein  58.47 
 
 
306 aa  370  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1343  response regulator receiver modulated CheW protein  58.8 
 
 
306 aa  368  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.447173  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2320  chemotaxis protein CheV  58.94 
 
 
306 aa  369  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.698234  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1338  response regulator receiver modulated CheW protein  58.8 
 
 
306 aa  369  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1595  response regulator receiver modulated CheW protein  58.14 
 
 
307 aa  365  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01282  hypothetical protein  57.89 
 
 
308 aa  367  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2340  chemotaxis protein methyltransferase CheV  58.61 
 
 
306 aa  365  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004175  chemotaxis protein CheV  57.24 
 
 
308 aa  364  1e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3089  response regulator receiver modulated CheW protein  58.14 
 
 
306 aa  364  1e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1794  chemotaxis protein CheV  58.22 
 
 
308 aa  363  3e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3102  response regulator receiver modulated CheW protein  59.47 
 
 
306 aa  361  8e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.262439  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1215  response regulator receiver modulated CheW protein  54.87 
 
 
310 aa  355  7e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.186708  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1572  CheW protein  56.21 
 
 
310 aa  354  1e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2213  putative CheW protein  55.7 
 
 
311 aa  353  2e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.542266 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3954  CheW protein  56.39 
 
 
311 aa  349  4e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1474  chemotaxis protein CheV  56.35 
 
 
309 aa  348  7e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3524  chemotaxis protein CheV, putative  55.41 
 
 
308 aa  345  4e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.010446  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1646  response regulator receiver modulated CheW protein  55.88 
 
 
311 aa  345  6e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3612  putative CheW protein  55.88 
 
 
311 aa  344  9e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.296716  normal  0.145923 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2128  chemotaxis protein CheV  55.88 
 
 
311 aa  344  9e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.103105 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1670  response regulator receiver modulated CheW protein  55.88 
 
 
311 aa  343  2e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.75876 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3297  response regulator receiver:CheW-like protein  55.08 
 
 
308 aa  341  7e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.307395  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2144  response regulator receiver modulated CheW protein  53.23 
 
 
317 aa  340  1e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  6.7765e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2032  chemotaxis protein CheV  53.55 
 
 
338 aa  338  5e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00977151  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1989  chemotaxis protein CheV  54.98 
 
 
314 aa  338  7e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0231  chemotaxis protein CheV  54.84 
 
 
313 aa  338  8e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2678  response regulator receiver modulated CheW protein  53.55 
 
 
312 aa  337  1e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0199239  normal  0.361965 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1944  response regulator receiver modulated CheW protein  53.87 
 
 
314 aa  334  1e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  2.11383e-06  normal  0.0128896 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2594  putative CheW protein  52.9 
 
 
314 aa  333  3e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0125388  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2708  response regulator receiver modulated CheW protein  52.9 
 
 
314 aa  333  3e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.404736  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1752  response regulator receiver modulated CheW protein  52.9 
 
 
314 aa  333  3e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0141626  hitchhiker  0.0048436 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02869  hypothetical protein  53.23 
 
 
313 aa  332  4e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2462  response regulator receiver modulated CheW protein  53.87 
 
 
314 aa  332  5e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0985134  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2344  response regulator receiver modulated CheW protein  53.87 
 
 
314 aa  332  6e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.088498  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2272  response regulator receiver modulated CheW protein  53.87 
 
 
314 aa  331  8e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.740501  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0522  putative CheW protein  53.4 
 
 
311 aa  330  1e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2633  putative CheW protein  52.58 
 
 
314 aa  330  2e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0317026  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003013  chemotaxis protein CheV  52.26 
 
 
317 aa  328  7e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2144  CheW-like protein  53.53 
 
 
313 aa  325  4e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00213305  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2319  putative CheW protein  52.58 
 
 
314 aa  325  7e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00776156  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1592  chemotaxis protein CheV  52.26 
 
 
314 aa  320  1e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2316  response regulator receiver modulated CheW protein  52.09 
 
 
313 aa  319  3e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.90141  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0891  response regulator receiver modulated CheW protein  50.8 
 
 
312 aa  318  9e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.875715  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1431  response regulator receiver modulated CheW protein  52.15 
 
 
313 aa  315  8e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0924  response regulator receiver modulated CheW protein  50.97 
 
 
309 aa  311  1e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1901  response regulator receiver modulated CheW protein  53.21 
 
 
314 aa  307  2e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0980501  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01327  chemotaxis protein CheV  49.19 
 
 
319 aa  305  7e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.750704  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1063  putative CheW protein  51.56 
 
 
307 aa  297  1e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1476  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  46.82 
 
 
324 aa  291  9e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1907  response regulator receiver modulated CheW protein  47.48 
 
 
314 aa  290  2e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.150829 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06152  chemotaxis protein  48.22 
 
 
314 aa  287  2e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000739527  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01014  chemotaxis protein  48.22 
 
 
314 aa  287  2e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.347371  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02930  chemotaxis protein  54.17 
 
 
248 aa  266  3e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.464973  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0734  response regulator receiver:CheW-like protein  38.27 
 
 
322 aa  223  4e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1457  response regulator receiver modulated CheW protein  37.18 
 
 
314 aa  216  3e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1463  response regulator receiver modulated CheW protein  36.88 
 
 
308 aa  215  6e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1425  response regulator receiver modulated CheW protein  37.63 
 
 
299 aa  215  9e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.419487  normal  0.0812955 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2708  response regulator receiver modulated CheW protein  37.91 
 
 
300 aa  213  3e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2899  response regulator receiver modulated CheW protein  37.18 
 
 
295 aa  211  1e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.715975  hitchhiker  0.00931868 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1805  response regulator receiver modulated CheW protein  39.02 
 
 
312 aa  211  1e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.123386  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1372  response regulator receiver modulated CheW protein  36.92 
 
 
299 aa  211  2e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00980078 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1437  response regulator receiver modulated CheW protein  36.92 
 
 
299 aa  211  2e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.080472 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3123  chemotaxis protein CheV  36.92 
 
 
299 aa  210  3e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2201  chemotaxis protein CheV  38.27 
 
 
299 aa  208  8e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.865724 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2493  putative CheW protein  37.55 
 
 
299 aa  208  8e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2185  putative CheW protein  38.44 
 
 
297 aa  208  8e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0845954  normal  0.0210169 
 
 
-
 
NC_003296  RS03881  putative response regulator transcription regulator protein  36.57 
 
 
313 aa  206  5e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.521949  normal  0.59764 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5616  response regulator receiver modulated CheW protein  37.79 
 
 
316 aa  205  6e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.375026 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1747  response regulator receiver modulated CheW protein  37.55 
 
 
298 aa  205  8e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0999043 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4573  response regulator receiver modulated CheW protein  35.92 
 
 
316 aa  205  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.639433 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3501  response regulator receiver modulated CheW protein  35.92 
 
 
316 aa  205  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.096074  normal  0.598076 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4985  response regulator receiver:CheW-like protein  35.65 
 
 
318 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0841  response regulator receiver modulated CheW protein  37.46 
 
 
299 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0826  putative CheW protein  37.46 
 
 
299 aa  202  7e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.449083  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3225  response regulator receiver modulated CheW protein  37.74 
 
 
322 aa  201  1e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.185014  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1561  response regulator receiver modulated CheW protein  36.82 
 
 
298 aa  200  2e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0294399  hitchhiker  0.00399966 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2796  putative CheW protein  36.82 
 
 
298 aa  200  2e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>