More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_21922 on replicon NC_011683
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011683  PHATRDRAFT_21922  predicted protein  100 
 
 		 306 aa  623  1e-177  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1878  GTP-binding protein Era  42.86 
 
 		 295 aa  236  3e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3777  GTP-binding protein Era  41.39 
 
 		 295 aa  230  3e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01555  putative GTP-binding protein  41.39 
 
 		 294 aa  229  4e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0214  GTP-binding protein Era  41.2 
 
 		 293 aa  228  7e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.890226  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5225  GTP-binding protein Era  40.66 
 
 		 306 aa  220  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.761652 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1141  GTP-binding protein Era  42.05 
 
 		 296 aa  220  1.9999999999999999e-56  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.891303 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3074  GTP-binding protein Era  41.58 
 
 		 298 aa  218  7e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2142  GTP-binding protein Era  42.52 
 
 		 299 aa  213  3.9999999999999995e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3856  GTP-binding protein Era  39.67 
 
 		 308 aa  211  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00601446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0251  GTP-binding protein Era  37.87 
 
 		 311 aa  206  3e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1116  GTP-binding protein Era  41.06 
 
 		 303 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6543  GTP-binding protein Era  38.87 
 
 		 289 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1793  GTP-binding protein Era  37.54 
 
 		 307 aa  190  2.9999999999999997e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000375473  normal  0.0439993 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0456  GTP-binding protein Era  37.22 
 
 		 306 aa  189  7e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00371329  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  37.42 
 
 		 298 aa  188  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0569  GTP-binding protein Era  37.5 
 
 		 305 aa  187  2e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0419  GTP-binding protein Era  37.3 
 
 		 305 aa  185  7e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000385747  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1946  GTP-binding protein Era  35.71 
 
 		 303 aa  185  9e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1999  GTP-binding protein Era  36.89 
 
 		 306 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00245097  normal  0.170992 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  35.83 
 
 		 302 aa  183  3e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  36.75 
 
 		 297 aa  183  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4275  GTP-binding protein Era  35.76 
 
 		 303 aa  182  8.000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1064  GTP-binding protein Era  35.86 
 
 		 298 aa  181  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0212543  normal  0.0907756 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  34.87 
 
 		 302 aa  181  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0994  GTP-binding protein Era  36.18 
 
 		 312 aa  181  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.307835  normal  0.0847852 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1445  GTP-binding protein Era  36.81 
 
 		 298 aa  180  2e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0929  GTP-binding protein Era  36.18 
 
 		 312 aa  181  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163867  normal  0.15052 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  38.01 
 
 		 324 aa  180  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0995  GTP-binding protein Era  37.21 
 
 		 300 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0611001 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1376  GTP-binding protein Era  36.81 
 
 		 298 aa  180  2.9999999999999997e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1981  GTP-binding protein Era  36.09 
 
 		 298 aa  179  4.999999999999999e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1462  GTP-binding protein Era  37.05 
 
 		 293 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1726  GTP-binding protein Era  37.42 
 
 		 296 aa  179  7e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0671  GTP-binding protein Era  36.18 
 
 		 301 aa  178  9e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.584741  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4216  GTP-binding protein Era  37.21 
 
 		 300 aa  177  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.305152  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1685  GTP-binding protein Era  37.87 
 
 		 295 aa  178  1e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3950  GTP-binding protein Era  37.21 
 
 		 300 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1653  small GTP-binding protein Era  37.42 
 
 		 310 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0482  GTP-binding protein Era  37.54 
 
 		 295 aa  177  2e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43907  predicted protein  34.85 
 
 		 351 aa  177  2e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1149  GTP-binding protein Era  36.45 
 
 		 335 aa  176  3e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.28675  normal  0.946741 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0600  GTP-binding protein Era  34.44 
 
 		 301 aa  176  4e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0350  GTP-binding protein Era  36.36 
 
 		 305 aa  176  5e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000177967  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1731  GTP-binding protein Era  35.6 
 
 		 305 aa  176  6e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000233953  decreased coverage  0.0035862 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  35.55 
 
 		 303 aa  176  6e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1074  GTP-binding protein Era  36.21 
 
 		 300 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1323  GTP-binding protein Era  35.1 
 
 		 298 aa  175  9.999999999999999e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0411499  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4748  GTP-binding protein Era  37.21 
 
 		 302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0521069  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0735  GTP-binding protein Era  36.27 
 
 		 314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.222854  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3668  GTP-binding protein Era  37.29 
 
 		 302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2765  GTP-binding protein Era  35.83 
 
 		 334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00576917  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2417  GTP-binding protein Era  35.55 
 
 		 312 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.262207 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1476  GTP-binding protein Era  36.75 
 
 		 299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.881887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54320  GTP-binding protein Era  37.21 
 
 		 305 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  35.1 
 
 		 299 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12510  GTP-binding protein Era  34.11 
 
 		 294 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2251  GTP-binding protein Era  34.22 
 
 		 311 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.41102  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2457  GTP-binding protein Era  35.22 
 
 		 306 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0668  GTP-binding protein Era  34.85 
 
 		 299 aa  173  2.9999999999999996e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0548419  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4373  GTP-binding protein Era  36.54 
 
 		 300 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212808 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4287  GTP-binding protein Era  36.54 
 
 		 300 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  34.77 
 
 		 302 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13790  GTP-binding protein Era  36.88 
 
 		 300 aa  172  3.9999999999999995e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.264209  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1434  GTP-binding protein Era  36.54 
 
 		 302 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.810573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1205  GTP-binding protein Era  36.3 
 
 		 297 aa  172  5e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.124977  normal  0.282602 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0375  GTP-binding protein Era  36.68 
 
 		 339 aa  172  5.999999999999999e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.426985  hitchhiker  0.000823221 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0651  putative GTP-binding protein  37.38 
 
 		 312 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.181354  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1038  GTP-binding protein Era  36.13 
 
 		 330 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00137835  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1064  GTP-binding protein Era  35.41 
 
 		 303 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0033  GTP-binding protein Era  35.88 
 
 		 305 aa  172  6.999999999999999e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2974  GTP-binding protein Era  35.55 
 
 		 298 aa  172  6.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0899132  hitchhiker  0.00507105 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1244  GTP-binding protein Era  35.48 
 
 		 329 aa  172  9e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000178109  unclonable  0.0000000143866 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3148  GTP-binding protein Era  37.29 
 
 		 300 aa  171  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0159525  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0138  GTP-binding protein Era  32.46 
 
 		 300 aa  171  2e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2205  GTP-binding protein Era  36.77 
 
 		 310 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.395814  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2546  GTP-binding protein Era  32.45 
 
 		 314 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  36.42 
 
 		 297 aa  170  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2293  GTP-binding protein Era  36.77 
 
 		 310 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0382696  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0874  GTP-binding protein Era  35.16 
 
 		 307 aa  170  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0332  GTP-binding protein Era  35.08 
 
 		 293 aa  169  4e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1348  GTP-binding protein Era  34.88 
 
 		 315 aa  169  4e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.136623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3560  GTP-binding protein Era  32.45 
 
 		 314 aa  169  5e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3802  GTP-binding protein Era  35.86 
 
 		 301 aa  169  7e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1205  GTP-binding protein Era  34.55 
 
 		 301 aa  169  8e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.745594  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02997  GTP-binding protein Era  34.88 
 
 		 314 aa  168  9e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.249422  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  33.11 
 
 		 298 aa  168  9e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2928  GTP-binding protein Era  34.97 
 
 		 334 aa  168  9e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0296  GTP-binding protein Era  33.68 
 
 		 306 aa  168  1e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0080  GTP-binding protein Era  35.4 
 
 		 300 aa  168  1e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000115632  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3066  GTP-binding protein Era  32.12 
 
 		 300 aa  168  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000674548  decreased coverage  0.0000000895367 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3070  GTP-binding protein Era  36.63 
 
 		 301 aa  168  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.129104  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0641  GTP-binding protein Era  35.22 
 
 		 300 aa  168  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.354328  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1102  GTP-binding protein Era  35.86 
 
 		 301 aa  167  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0130588  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2719  GTP-binding protein Era  35.86 
 
 		 301 aa  167  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0551516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2852  GTP-binding protein Era  35.86 
 
 		 301 aa  167  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0251331  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2931  GTP-binding protein Era  35.86 
 
 		 301 aa  167  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.163008  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1093  GTP-binding protein Era  36.36 
 
 		 287 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.324542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0908  GTP-binding protein Era  34.95 
 
 		 303 aa  167  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2721  GTP-binding protein Era  35.86 
 
 		 301 aa  167  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>